TY-JOUR公司AU-菲利普·拉米AU-安徒生,克劳斯·L。澳大利亚-戴尔斯克约特,拉尔斯AU-托林,尼尔斯澳大利亚-沃夫,卡斯滕2007年上半年DA-2007/11/09TI-使用Affymetrix SNP阵列估计癌症人群混合和等位基因拷贝数的隐马尔可夫模型JO-BMC生物信息学SP-434型VL-8IS-1标准AB-Affymetrix SNP阵列可以同时查询数千个SNP。这使我们能够查看癌细胞的基因组内容,并研究导致癌症的潜在事件。如今,基因组拷贝数通常来自SNP阵列数据,但用于此任务的拟议算法通常忽略了来自配对生殖系肿瘤样本中生殖系细胞的基因型信息。包括这些信息可以加深我们对“真实”生物情况的理解,例如通过分析等位基因特定的拷贝数。在这里,我们依赖于匹配的生殖系肿瘤样本,并开发了一个隐马尔可夫模型(HMM)来估计肿瘤细胞中的等位基因拷贝数变化。通过这种方法,我们能够估计肿瘤中正常细胞的比例(混合比例)。序号1471-2105UR-(欧元)https://doi.org/10.1186/1471-2105-8-434DO-10.1186/1471-2105-8-434ID-Lamy2007急诊室-