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欧洲PMC更新全球生命科学文献数据库

夏季罗索诺夫斯基

 | 2023年10月25日

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为印前审查奠定技术基础


与会者进行了讨论。

生命科学中的预印本实践发展迅速。除了加速科学出版之外,预印本还有潜力在研究人员之间开辟新的交流渠道。例如,预印本同行评议为改变科学评估文化、扩大参与范围和增强学术的稳健性提供了巨大潜力。仅当<预印本的2%(他们自己只发表了约10%的生物医学论文)有附带的评论,这种形式的同行评议是许多从事促进开放科学的组织的聚光灯。 

为了支持这一新兴生态系统的发展,我们必须确保以机器可读的形式捕获并与预印本服务器和书目数据库共享有关预印本评论的重要元数据。然而,目前在内容、格式、,以及预印本审查元数据的分发渠道。 

10月17日和18日在英国Hinxton Hall举行的“支持预印本同行评审元数据的互操作性”研讨会上,由欧洲PMCASAPbio公司,来自预印本审查项目、基础设施提供商、出版商、出资人和其他利益相关者的代表召开会议,共同确定预印本审核元数据的关键元素和共享此信息的机制。在两天多的时间里,与会者讨论了他们对理想系统的愿景、应包括的元数据元素、技术协议和下一步要采取的步骤。 

第1天:蓝天愿景和元数据优先级

蓝天视觉

我们以一系列四场演讲开始了研讨会,展示了理想元数据生态系统的蓝天愿景。这包括Ludo Waltman(莱顿大学)、Martin Klein(COAR Notify)、Thomas Guillemaud和Denis Bourguet(Peer Community In)以及Michael Parkin(欧洲PMC)的贡献。 

卢多的愿景是将预先打印的同行评议转变为真正有意义的双向对话,并摆脱它仅仅是一种官僚行为。Martin从COAR的角度来看,他的愿景是开发一种基于标准、可互操作和分散的方法,以连接存储库和外部服务的分布式网络中的资源。以Thomas和Denis为代表的同行社区分享了他们对研究人员社区的愿景,即通过同行评审和对其科学领域预印本的推荐来处理评估,在作者知情同意的情况下,读者可以有效地了解预印本的同行评审和认可。由Michael代表的欧洲PMC的愿景包括要求一致使用持久标识符,明确许可信息以告知重用,以及标准化审查类型词汇表,以区分完整审查和简短评论。

随后,在一个分组中,参与者讨论了他们希望通过共享预打印同行评审元数据来实现的目标。 

每个人都有一些共同的目标:

 单词云表示与“信任”商定的目标,以“信用”为中心,以“集中支持去中心化”、“互操作性”和“内容认可”为围绕,其他时间则在外围:激励预印本审查、透明度、标准化特征、包容性、可发现性、一致性、可见性、,链接到输出、公众信任、预印本信任、评估、系统效率、信任-显示-促进和转变学术交流

其他目标引发了关于相关细微差别的热烈讨论:

未达成一致的目标词云显示意见/反馈来源的多样性、减少运营开销、标准、作者同意、健康评论文化、认可

为预印本同行评审确定元数据元素的优先级

第一天的后半部分侧重于为预印本同行审查确定元数据的优先级。与会者在研讨会之前与一份不完整的元数据消费者名单共享了一份问卷,调查了13个被确定为最重要的元数据元素。这些要素包括:

  • 预印本DOI审查
  • 审查的预印本版本
  • 审查日期
  • 审核人姓名(或表示审核是匿名的)
  • 推荐/得分
  • 谁选择审稿人(如自我提名或编辑/协调员)
  • 决策(二进制或标量)
  • 审查人竞争利益
  • 审查许可证
  • 评审组名称(如期刊俱乐部或社区)
  • 包含作者回复
  • 审查员ORCID
  • 编辑/协调员竞争利益

本课程首先为这些元数据元素定义不同的用例,以及收集它们的好处和困难。在深入讨论之后,参与者根据他们所代表的组织的观点,将13个要素从优先级最高到最低排序。

从上到下按优先级从高到低排列的元数据元素:

从上到下按优先级从高到低排列的元数据元素:预印本DOI审查审查的预印本版本复审日期审核人姓名(或表示审核是匿名的)审核人ORCID评论员组名称(如期刊俱乐部或社区)审查人竞争利益审查许可证推荐/得分谁选择了评审员(如自行提名或编辑/协调员)包含作者回复编辑/协调员竞争利益决策(二进制或标量)

审查的预印本的DOI(或其他PID)被确定为最高优先级,而审查决定(无论是二进制还是标量)被放在列表的底部。排名练习引发了一场涉及多个主题的激烈辩论。参与者考虑是否必须根据预打印服务器的版本控制策略,将审查过的预打印版本与预打印标识符分开编码。还有一次围绕描述评审员专业知识的元数据进行的对话,这是一个模糊的术语,尽管有可能被滥用,但对一些用户来说可能是可取的。在评审人员希望匿名的情况下,获取专业知识可能特别有用;否则,评审员的ORCID记录可用于推断此信息。进一步的关键建议确定了其他高度优先的元数据元素,包括审查的标题、多语言内容的审查语言,以及捕捉不同审查小组和社区复杂性的方法。接下来,我们讨论了将排名转换为核心,并希望清楚地确定元数据元素需求。

第2天:元数据传输、分数和建议以及路线图

元数据传输路径

研讨会的第二天首先集中讨论了元数据传输路径的技术要素。该讨论检查了各种传输协议和服务(包括Crossref、DocMaps、COAR Notify、Sciety、DataCite、Zenodo、OA Switchboard和OAI PMH)当前共享的元数据元素。与会者在确定共享预印本审查元数据存在的重大差距之前,共同讨论了不同方法的障碍和好处。在提出这些差距的解决方案时,与会者普遍认为,围绕共同方法进行更多的标准化和社区共识将是有益的。 

推荐和评分方法

第二天最活跃的讨论之一是关于在预打印同行评审元数据中包含和使用建议和评审分数。课程开始时概述了一些评分方法(整理成以下内容桌子),揭示了从数字到描述性评分的各种不同方法。参与者为预印本评审分数和决策创建了用户故事,引发了关于如何使用这些信息的对话。虽然许多与会者认为这种元数据非常有用,但其他与会者担心,在元数据中包含分数可能会被不良行为者操纵。主要关注的是简化论评分与更大的审查报告的分离。许多人认为,即使建议或分数是有益的,它也应该保留在更大的审查范围内,并通过将分数从伴随不同用户情景的最低必要元数据列表中排除来反映这一点。

路途

第2天的后半部分侧重于路线图活动,以确定本次研讨会产生的具体行动。参与者首先单独列出接下来的步骤和活动,然后再围绕列表展开更大的对话。作为该练习的一部分,根据重要性和可实现性对潜在行动列表进行了注释。在对这些优先行动进行了第二轮讨论之后,与会者报名参加了正在进行的活动。共同决定成立3个工作组,每个工作组以明确定义的行动为中心。 

一个工作组的任务是映射元数据传输生态系统该小组将绘制服务、站点和协议的交互方式,以更清楚地说明如何共享信息。 

第二个工作组将重点关注开发共享数据模型。除了建议的标准外,该小组还旨在提供一种通用的方法和协议,包括定义元数据元素。此外,该小组将努力准备元数据以供不同平台共享,从而减少共同标准的障碍。 

第三个工作组将进一步关于建议和认可的讨论该小组将明确区分审查、背书和策展工作。小组还将商定建议的术语,并讨论在预印本审查元数据中包含建议的效用和风险。

加入我们

参加我们研讨会的人倾向于美国和欧洲的组织,但学术传播生态系统的发展应该在全球范围内进行。因此,我们有兴趣扩大对话范围,包括对预印本审查元数据感兴趣的人的评论、建议和参与;我们的工作组将通过邮件列表定期共享项目更新。如果您想参与本次对话,请通过以下表格加入:https://forms.gle/g3FATYf57ASdQTUB9(https://forms.gle/g3FATYf57ASdQTUB9).

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