有很多BLAST搜索要运行吗?使用ElasticBLAST运行!

你需要进行大量BLAST搜索吗?您是否有专有序列数据要搜索,并且不能使用NCBI BLAST网站?您想避免设置和维护独立BLAST的工作吗?如果你对这些问题中的任何一个回答是肯定的,请继续阅读!

NCBI提供弹性BLAST可以在云端运行搜索。BLAST工作负载经常会突然出现。您可能希望一次搜索大量序列,并需要尽快获得结果以便进行进一步分析。通常,所需的序列数和快速周转会妨碍使用web服务。在许多类似的情况下,您也没有持续的需求来证明投资于您自己的专用服务器是合理的。使用ElasticBLAST在云端运行搜索是一个理想的解决方案。流行的BLAST数据库也可在云中使用允许您在靠近数据的地方运行计算,消除了下载大型数据文件所需的时间和资源到您的本地网络。在云中,您不受本地计算资源或公共web服务限制并且没有在大多数时间处于空闲状态的计算能力。

接下来的步骤是什么?

开始很容易!熟悉云服务是有帮助的,但不是必需的。ElasticBLAST在Amazon Web Services(AWS)和Google云平台(GCP)上受支持。它支持大多数BLAST程序和选项,可以在折扣实例上轻松运行搜索,这意味着您可以运行你的搜索量更少。我们有使用说明弹性BLAST,这将引导您使用云提供商的快速入门,并让您尽可能少地进行尝试。

资源

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