显示导航
引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们要感谢美国国家癌症研究所的临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)检测门户网站(assays.cance.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
10韩元 关键性能参数
序列长度(AA) 分子量(Da)
584 58827
蛋白质名称
角蛋白,I型细胞骨架10
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MSVRYSSSKH公司 YSSSRSGGG公司 GGGGG VSSLRISSK公司 GSLGGGFSSG公司
60 70 80 90 100
GFSGGSFSRG公司 SSGGGCFGGS公司 SGGYGGLGGF公司 GGGSFRGSYG公司 SSSFGGSYGG公司
110 120 130 140 150
IFGGGSFGGG公司 SFGGGSFGGG公司 gfggggfggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggg FGGGFGG(烟气脱硫) LLSGNEKVTM公司
160 170 180 190 200
QNLNDRLASY公司 LDK公司V(V)R(右)A类L(左)E类E类S公司 N个Y(Y)E类L(左)E类GKIKE公司 WYEKHGNSHQ公司 GEPRDYSKYY公司
210 220 230 240 250
KTIDDLKNQI公司 LNLTTDNAI公司 里奇纳L(左)A类 A类D类D类F类R(右)LKYEN公司 EVALRQSVEA公司
260 270 280 290 300
丁格列夫尔德 ELTLTKADLE公司 MQIESLTEEL公司 AYLKNHEEE(阿勒克尼耶) MKDLRNVSTG公司
310 320 330 340 350
DVNVEMNAAP公司 GVDLTQLNN公司 SQYEQLAE先生 QNRKDAEAWF公司 奈克斯凯尔特
360 370 380 390 400
IDNNIEQISS公司 YKSEITELRR公司 NVQALEIELQ公司 SQLALKQSLE公司 阿斯莱特格雷
410 420 430 440 450
CVQLSQIQAQ公司 ISALEEQLQQ公司 IRAETECQNT公司 EYQQLLDIKI公司 RLENEIQTYR公司
460 470 480 490 500
S公司L(左)L(左)E类G公司E类G公司S公司S公司G公司 G公司G公司G公司R(右)GGGSFG公司 GGYGGGSSGG公司 GSSGGGHGGG公司 HGGSSGGGYG公司
510 520 530 540 550
GGSSGSG公司 GGYGGGSSSG GHGGSSSGY公司 GGGSSGGGG GYGGGSSGGG公司
560 570 580 584
SSSGGGYGGG公司 SSSGGHKSSS公司 SGSVGESSSK公司 GPRY公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-5854的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
10韩元
顺序
拉脱维亚民主共和国
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
229
肽末端
235
CPTAC标识
CPTAC-5854型
肽分子质量
806.3923
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
不适用
矩阵
冷冻乳腺癌肿瘤组织裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

通过免疫肽富集和靶向质谱法对福尔马林固定石蜡包埋和冷冻乳腺癌组织中的人表皮生长因子受体2进行定量。Kennedy JJ、Whiteaker JR、Kennedy LC、Bosch DE、Lerch ML、Schoenherr RM、Zhao L、Lin C、Chowdhury S、Kilgore MR、Allison KH、Wang P、Hoofnagle AN、Baird GS、Paulovich AG.临床化学。2021年6月17日:hvab047。doi:10.1093/clinchem/hvab047。打印前在线。PMID:34136904


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
QTRAP 6500号
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Eksigent纳米LC 425
色谱柱填料
3µm ChromXP C18EP,120º
立柱尺寸
150 x 0.3毫米
流速
10.0微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y2(1+) 29.1 12.8 8.8 32.7 19 11.5 43.8 22.9 14.5 15 17 15
b5(1+) 50.3 34.6 14.7 64.8 36.5 22.8 82 50.3 27.1 15 17 15
y3(1+) 47.5 20 12.4 52.5 17.9 14.9 70.8 26.8 19.4 15 17 15
y4(1+) 47.6 16.5 11.5 50.8 15.9 15 69.6 22.9 18.9 15 17 15
y6(1+) 36 15.4 7.6 33.9 14.8 13.9 49.4 21.4 15.8 15 17 15
总和 22.5 12.4 7.9 26.7 14.4 12.9 34.9 19 15.1 15 17 15


其他资源和意见

评论

CPTAC-5879的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
10韩元
顺序
拉脱维亚民主共和国
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
229
肽末端
235
CPTAC标识
CPTAC-5879型
肽分子质量
806.3923
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
浓缩MRM
富集方法
不适用
矩阵
FFPE乳腺癌肿瘤组织裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

福尔马林固定石蜡包埋和冷冻乳腺癌组织中人表皮生长因子受体2的免疫肽富集和靶向质谱定量。Kennedy JJ、Whiteaker JR、Kennedy LC、Bosch DE、Lerch ML、Schoenherr RM、Zhao L、Lin C、Chowdhury S、Kilgore MR、Allison KH、Wang P、Hoofnagle AN、Baird GS、Paulovich AG.临床化学。2021年6月17日:hvab047。doi:10.1093/clinchem/hvab047。打印前在线。PMID:34136904


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
QTRAP 6500号
内部标准
肽标准纯度
原油
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Eksigent纳米LC 425
色谱柱填料
3µm ChromXP C18EP,120º
立柱尺寸
150 x 0.3毫米
流速
10.0微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b5(1+) 52.2 18.8 15.3 50.8 18 8.7 72.8 26 17.6 12 12 12
y2(1+) 29.8 7.9 2.8 29.1 6.5 3.2 41.7 10.2 4.3 12 12 12
y3(1+) 74.9 21.1 7.3 72.6 21.4 6.3 104.3 30.1 9.6 12 12 12
y4(1+) 34.1 18.4 5.5 32.7 23 12.4 47.2 29.5 13.6 12 12 12
y6(1+) 26 10.7 6.4 27.8 9.2 7.6 38.1 14.1 9.9 12 12 12
总和 21.3 7 3.4 19.9 4.8 4.5 29.1 8.5 5.6 12 12 12


其他资源和意见

评论

非CPTAC-3987的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
Krt10
顺序
ALEESNYELEGK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
164
肽末端
175
CPTAC标识
非CPTAC-3987
肽分子质量
1,380.6409
物种
穆斯 肌肉 (鼠标)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
安捷伦6490/6495 QQQ
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>80%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y10(2+) 15.5 6.6 8.1 15.9 7.9 7.2 22.2 10.3 10.8 15 15 15
y2(1+) 11.8 7.7 5.1 16.1 10.4 6 20 12.9 7.9 15 15 15
y3(1+) 16 4 5.8 18.6 8.1 7.4 24.5 9 9.4 15 15 15
y6(1+) 19.8 7 8.6 19.4 10.9 8 27.7 13 11.7 15 15 15
8岁(1+) 10.7 4.6 5 10.8 7.9 7.6 15.2 9.1 9.1 15 15 15
总和 7.4 3.3 3.3 11.8 6.5 4.6 13.9 7.3 5.7 15 15 15


其他资源和意见

评论

非CPTAC-2680的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
10韩元
顺序
SLLEGEGSSGGR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
451
肽末端
464
CPTAC标识
非CPTAC-2680
肽分子质量
1,261.5899
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
等离子体
提交实验室
UVic-Genome BC蛋白质组学中心
提交实验室PI
克里斯托夫·博切尔斯

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
6490三四(安捷伦)
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
1290 LC(安捷伦)
色谱柱填料
Zorbax Eclipse Plus C18,1.8µm
立柱尺寸
2.1 x 150毫米
流速
400微升/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b2(1+) 10.5 4.5 5 15.6 8 7.7 18.8 9.2 9.2 15 15 15
y12(2+) 17.8 6.1 6.8 22.1 8.8 8.7 28.4 10.7 11 15 15 15
8岁(1+) 10.1 6.3 5.8 14.8 10 8.3 17.9 11.8 10.1 15 15 15
y11(1+) 12.9 6.8 4.6 19.9 10.4 7.2 23.7 12.4 8.5 15 15 15
y10(1+) 7.8 3.7 5.8 14.2 8.5 9 16.2 9.3 10.7 15 15 15
总和 5.6 3.3 4 13.6 7.9 7.5 14.7 8.6 8.5 15 15 15


其他资源和意见

评论