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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们要感谢美国国家癌症研究所的临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)检测门户网站(assays.cance.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
粘液1 PUM公司
序列长度(AA) 分子量(Da)
1255 122102
蛋白质名称
木素-1
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MTPGTQSPFF公司 LLLLL电视台 VTGSG装配 PGGEKETSAT公司 QRSSVPSSTE公司
60 70 80 90 100
KNAVSMTSSV公司 LSSHSPGSGS公司 STTQGQDVTL公司 APATEPASGS公寓 AATWGQDVTS公司
110 120 130 140 150
VPVTR标签 网址:http APDNKPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司
160 170 180 190 200
TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司
210 220 230 240 250
APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司
260 270 280 290 300
TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司
310 320 330 340 350
APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司
360 370 380 390 400
TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司
410 420 430 440 450
APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司
460 470 480 490 500
TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司
510 520 530 540 550
APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司
560 570 580 590 600
TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司
610 620 630 640 650
APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司
660 670 680 690 700
TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司
710 720 730 740 750
APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司
760 770 780 790 800
TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司
810 820 830 840 850
APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司
860 870 880 890 900
TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司
910 920 930 940 950
APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDTRPAPGS公司 TAPPAHGVTS公司 APDNRPALGS公司
960 970 980 990 1000
TAPPVHNVTS公司 ASGSASGSAS公司 TLVHNGTSAR卫星 ATTTPASKST公司 PFSIPSHHSD公司
1010 1020 1030 1040 1050
TPTTLASHST公司 KTDASTHHS公司 SVPPLTSSNH公司 STSPQLSTGV公司 SFFFLSFHIS公司
1060 1070 1080 1090 1100
NLQFNSSLED公司 PSTDYYQELQ公司 RDISEMFLQI公司 YKQGGFLGLS公司 NIKFRPGSVV公司
1110 1120 1130 1140 1150
VQLTLAFR公司E类G公司 N个V(V)H(H)V(V)E类 F类N个Y(Y)K(K)TEAAS公司 RYNLTISDVS公司 VSDVPFPFSA公司
1160 1170 1180 1190 1200
QSGAGVPGWG公司 IALLVLVCVL公司 瓦莱维利亚 LAVCQCRRK公司N个 Y(Y)G公司L(左)F类P(P)A类R(右)
1210 1220 1230 1240 1250
DTYHPMSEYP公司 TYHTHGRYVP公司 PSSTDRSPYE公司 KVSAGGSS公司 LSYTNPAVAA公司
1255
TSANL公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-146的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
粘液1
序列
egtinvhdvetqfnqik语言
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
1109
肽末端
1125
CPTAC标识
CPTAC-146型
肽分子质量
2,020.9490
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接免疫MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13C、15N
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
7岁(1+) 11.3 9.7 7.3 12.3 11.1 12 16.7 14.7 14 25 15 15
y6(1+) 10.1 14.2 7.9 16 22.6 33.8 18.9 26.7 34.7 25 15 15
y5(1+) 5.9 5.5 6.6 11.6 10.3 10.1 13 11.7 12.1 25 15 15
总和 5.9 5 5.8 10.1 8.6 12.6 11.7 9.9 13.9 25 15 15


其他资源和意见


CPTAC-719的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
粘液1
序列
EGTINVHDVETQFNQYK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
1109
肽末端
1125
CPTAC标识
CPTAC-719型
肽分子质量
2,020.9490
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
富集免疫MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
等离子体
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

用于免疫多重反应监测质谱分析的抗肽单克隆抗体具有支持蛋白质印迹和ELISA的高概率。Schoenherr RM、Saul RG、Whiteaker JR、Yan P、Whiteley GR、Paulovich AG。分子细胞蛋白质组学。2015年2月;14(2):382-98. doi:10.1074/mcp。O114.043133。Epub 2014年12月15日。PMID:25512614


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个陷阱
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Eksigent NanoLC 2D
色谱柱填料
ReproSil-Pur C18-AQ 3微米
立柱尺寸
100毫米x 75微米内径
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y5(1+) 19 5.9 6 26.8 8.9 7.2 32.9 10.7 9.4 15 15 15
y6(1+) 17 5.6 3.8 20.4 8.2 8 26.6 9.9 8.9 15 15 15
7岁(1+) 18.7 3.8 4 26.4 8.5 6.5 32.4 9.3 7.6 15 15 15
总和 15.3 3.5 3.6 23.8 7.6 5.5 28.3 8.4 6.6 15 15 15


其他资源和意见


CPTAC-147的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
粘液1
序列
NYGQLDIFPAR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
1190
肽末端
1200
CPTAC标识
CPTAC-147型
肽分子质量
1,292.6513
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接免疫MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13C、15N
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 12.8 7.5 7.2 22.6 11.3 6.6 26 13.6 9.8 15 25 15
7岁(1+) 17 7 7.3 19 10.3 10.3 25.5 12.5 12.6 15 25 15
y6(1+) 9.9 8.2 3.7 19 13.7 24 21.4 16 24.3 15 25 15
总和 8.9 6.1 3.4 15.4 10.5 12.6 17.8 12.1 13.1 15 25 15


其他资源和意见


CPTAC-730的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
粘液1
序列
NYGQLDIFPAR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
1190
肽末端
1200
CPTAC标识
CPTAC-730型
肽分子质量
1,292.6513
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
富集免疫MRM
富集方法
肽免疫亲和力
矩阵
等离子体
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

用于免疫多反应监测质谱分析的抗肽单克隆抗体很可能支持Western blot和ELISA。Schoenherr RM、Saul RG、Whiteaker JR、Yan P、Whiteley GR、Paulovich AG。分子细胞蛋白质组学。2015年2月;14(2):382-98. doi:10.1074/mcp。安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省安大略省。Epub 2014年12月15日。PMID:25512614


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个陷阱
内部标准
合成肽
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Eksigent NanoLC 2D
色谱柱填料
ReproSil-Pur C18-AQ 3微米
立柱尺寸
100毫米x 75微米内径
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
b4(1+) 57.1 15.1 4.5 53.6 15.9 8.5 78.3 21.9 9.6 15 15 15
b3(1+) 36 7.5 27.6 10.2 8.7 45.4 12.7 9.2 15 15 15
y4(1+) 29.9 5.8 4.4 29.4 7.8 9 41.9 9.7 10 15 15 15
总和 30.5 6.1 3.3 23.7 7.7 8.5 38.6 9.8 9.1 15 15 15


其他资源和意见