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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们要感谢美国国家癌症研究所的临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)检测门户网站(assays.cance.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
DNM1L(DNM1L) DLP1、DRP1
序列长度(AA) 分子量(Da)
736 81877
蛋白质名称
动力蛋白-1样蛋白
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
米利浦尼克 LQDVFNTVGA型 DIIQLPQIVV公司 VGTQSSGKSS公司 VLESLVGRDL公司
60 70 80 90 100
LPRGTGIVTR公司 RPLILQLVHV公司 SQEDKRKTTG公司 EENGVEAEEW公司 GKFLHTKNKL公司
110 120 130 140 150
YTD迪尔QE IENETERISG公司 NNKGVSPEPI公司 HLKIFSPNVV公司 NLTLVDLPGM公司
160 170 180 190 200
TKVPVGDQPK公司 迪尔基雷利 LRFISNPNSI公司 ILAVTAANTD公司 MATSEALKIS公司
210 220 230 240 250
修订DGRRT LAVITKLDLM公司 DAGTDAMDVL公司 MGRVIPVKLG公司 IIGVVNRSQL语言
260 270 280 290 300
丁克斯维特 SIRDEYAFLQ公司 KKYPSLANRN公司 GTKYLARTLN公司 RLLMHHIRDC公司
310 320 330 340 350
LPELKTRINV公司 LAAQYQSLLN公司 SYGEPVDDKS公司 ATLLQLITKF公司 ATEYCONTIEG公司
360 370 380 390 400
TAKYIETSEL公司 CGGARICYIF公司 赫特夫格尔斯 VDPLGGLNTI公司 DILTAIRNAT公司
410 420 430 440 450
GPRPALFVPE公司 VSFELLVKRQ公司 IKRLEEPSLR公司 CVELVHEEMQ公司 RIIQHCSNYS公司
460 470 480 490 500
TQELLRFPKL公司 HDAIVEVVTC LLRKRLPVTN公司 埃姆夫恩尔韦 LAYINTKHPD公司
510 520 530 540 550
FADACGLMNN公司 NIEEQRRNRL公司 ARELPSAVSR公司 DKSSKVPSAL公司 APASQEPSPA公司
560 570 580 590 600
ASEADGKLI公司 QDSRRETKNV公司 ASGGGVGDG公司 VQEPTTGNWR公司 GMLKTSKAEE公司
610 620 630 640 650
LLAEEKSKPI公司 皮条每公斤 HAVNLLDVPV公司 PVARKLSARE公司 QRDCEVIERL公司
660 670 680 690 700
IKSYFLIVRK公司 NIQDSVPKAV公司 MHFLVNHVK公司 L(左)S公司E类L(左)V(V)G公司L(左) Y(Y)K(K)SSLLDDLL公司
710 720 730 736
TESEDMAQR公司 KEAADMLKAL公司 QGASQIAEI公司 RETHLW公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-57的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
DNM1L(DNM1L)
顺序
数据采集系统
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
680
肽末端
692
CPTAC标识
CPTAC-57型
肽分子质量
1,492.7773
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
13C、15N
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 12.9 10.9 8.2 19.1 18.8 9.9 23 21.7 12.9 15 25 15
8岁(1+) 18.6 23.2 19.6 21.7 25.7 27.2 28.6 34.6 33.5 15 25 15
7岁(1+) 9.7 15.1 12.5 12.4 25.7 16.3 15.7 29.8 20.5 15 25 15
总和 10 10 6.1 14.3 20.3 11 17.4 22.6 12.6 15 25 15

选择性

数据来源:全景

单元格线的曲线拟合斜率
碎片_离子 HCC1187公司 HCC1419公司 HCC1954型 HCC70型 MCF12A型 MDAMB175VII型 ZR751号 锆7530
7岁(1+) -1.93 -9.62 -7.96 -6.28 -3.09 -5.69 -2.84 -6.15
9岁(1+) -3.28 -8.16 -14.62 -9.17 -3月31日 -7.99 -3.03 -7.9
8岁(1+) -2.72 -7.23 -10.94 -8.97 -2.88 -7.16 -2.41 -11.27
总和 -2.67 -8时38分 -11.28 -8.12 -3.16 -7.09 -2.88 -7.61

稳定性

数据来源:全景

碎片/过渡 控制_输入_确认 实际_时间_行程_CV 冻结_intra_CV FTx1_intra_CV FTx2输入_确认
9岁(1+) 16.4 14.7 11 不适用 7.5
8岁(1+) 29.6 19.2 11.5 不适用 11.7
7岁(1+) 19.6 9.8 3.8 不适用 32
总和 17 13.6 6.5 不适用 13.2
碎片/过渡 全部_内Tra _ CV 所有中间CV
9岁(1+) 12.9 11.3
8岁(1+) 18.2 17.2
7岁(1+) 15 17.1
总和 12.8 11.4

内源性

数据来源:全景

碎片/过渡 CV内 中间CV 总计CV
8岁(1+) 22.6 28.7 36.5
9岁(1+) 11.3 20.8 23.7
7岁(1+) 14.7 30.1 33.5
总和 10.1 23.3 25.4

其他资源和意见

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