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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
EPHB2型 DRT、EPHT3、EPTH3、ERK、HEK5、TYRO5
序列长度(AA) 分子量(Da)
1055 117493
蛋白质名称
Ephrin B型受体2
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MALRRLGAAL公司 LLLPLLAAVE公司 ETLMDSTTAT公司 AELGWMVHPP公司 SGWEEVSGYD公司
60 70 80 90 100
恩曼蒂耶 VCNVFESSQN公司 NWLRTKFIRR公司 有机玻璃 KFSVRDCSSI公司
110 120 130 140 150
PSVPG支架 最后一次 DSATKTFPNW公司 MENPWVKVDT公司 IAADESFSQV公司
160 170 180 190 200
DLGGRVMKIN公司 TEVRSFGPVS公司 RSGFYLAFQD公司 YGGCMSLIAV公司 RVFYRKCPRI公司
210 220 230 240 250
IQNGAIFQET公司 LSGAESTSLV公司 AARGSCIANA公司 EEVDVPIKLY公司 CNGDGEWLVP公司
260 270 280 290 300
IGRCMCKAGF公司 EAVENGTVCR公司 GCPSGTFKAN公司 QGDEACTHCP公司 INSRTTSEGA公司
310 320 330 340 350
TNCVCRNGYY公司 无线低密度脂蛋白 CTTIPSAPQA公司 VISSVNETSL公司 MLEWTPPRDS公司
360 370 380 390 400
格列德维尼 ICKSCGSGRG公司 ACTRCGDNVQ公司 雅普列格尔特 普利伊斯德拉
410 420 430 440 450
HTQYTFEIQA公司 VNGVTDQSPF公司 SPQFASVNIT公司 TNQAAPSAVS公司 IMHQVSRTVD公司
460 470 480 490 500
SITLSWSQPD公司 QPNGVILDYE公司 LQYYEKELSE公司 YNATAIKSPT公司 NTVTVQGLKA公司
510 520 530 540 550
GAIYVFQVRA公司 RTVAGYGRYS公司 GKMYFQTMTE公司 AEYQTSIQEK公司 LPLIIGSSAA公司
560 570 580 590 600
GLVFLIAVVV公司 IAIVCNRRGF公司 ERADSEYTDK公司 L(左)H(H)Y(Y)T型S公司G公司H(H)M(M)T型 P(P)G公司M(M)K(K)IYIDPF公司
610 620 630 640 650
蒂埃德PNEAVR EFAKEIDISC公司 VKIEQVIGAG公司 EFGEVCSGHL公司 KLPGKREIFV公司
660 670 680 690 700
AIKTLKSGYT公司 EKQRRDFLSE公司 ASIMGQFDHP公司 NVIHLEGVVT公司 KSTPVMIITE公司
710 720 730 740 750
FMENGSLDSF公司 LRQNDGQFTV公司 IQLVGMLRGI公司 AAGMKYLADM公司 NYVHRDLAAR公司
760 770 780 790 800
NILVNSNLVC公司 KVSDFGLSR公司F类 L(左)E类D类D类T型S公司D类P(P)T型Y(Y) T型S公司A类L(左)G公司G公司K(K)IPI公司 RWTAPEAIQY(跑道可用性)
810 820 830 840 850
RKFTSASDVW公司 SYGIVMWEVM公司 SYGERPYWDM公司 TNQDVINAIE公司 每年一次
860 870 880 890 900
CPSALHQLML公司 DCWQKDRNHR公司 PKFGQIVNTL公司 DKMIRNPNSL公司 KAMAPLSSGI公司
910 920 930 940 950
NLPLLDRTIP公司 DYTSFNTVDE公司 WLEAIKMGQY公司 KESFANAGFT公司 SFDVVSQMMM公司
960 970 980 990 1000
EDILRVGVTL公司 AGHQKKILNS公司 IQVMRAQMNQ公司 IQSVEGQPLA公司 RRPRATGRTK公司
1010 1020 1030 1040 1050
RCQPRDVTKK公司 TCNSNDGKKK公司 GMGKKTDPG公司 RGREIQGIFF公司 KEDSHKESND公司
1055
CSCGG公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-2786的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
EPHB2型
肽修饰顺序
LQHY[+80.0]TSGHMTPGMK公司
修改类型
磷(Y)
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
4
肽开始
581
肽末端
594
CPTAC标识
CPTAC-2786型
肽分子质量
1,666.6997
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接PRM
矩阵
哺乳动物细胞裂解物
提交实验室
约翰·霍普金斯大学/潘迪
提交实验室PI
阿克希利什·潘迪

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
Orbitrap Fusion Lumos公司
内部标准
100亿摩尔
肽标准纯度
原油(~60%)
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy nLC 1200系统
色谱柱填料
C18 2微米100A
立柱尺寸
内径75微米x 50厘米
流速
250nl/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y5(1+) 38.2 11 6.3 39.2 14.2 7 54.7 18 9.4 15 15 15
y4(1+) 14 7.1 6.1 17.4 8 5.9 22.3 10.7 8.5 15 15 15
b3(1+) 33.5 13.3 9.3 35.7 13.2 9.1 49 18.7 13 15 15 15
总和 16.7 8.2 6 19.6 9 6.1 25.7 12.2 8.6 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-3205的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
EPHB2型
顺序
FLEDDTSDPTYTSALGGK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
770
肽末端
787
CPTAC标识
CPTAC-3205型
肽分子质量
1,915.8687
物种
人类 智者
分析类型
直接PRM
矩阵
肿瘤消化
提交实验室
圣路易斯华盛顿大学
提交实验室PI
里德·汤森

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
赛默飞世尔,Q-Exactive
内部标准
柱上25 fmol
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Easy-nLC 1000 Thermo Scientific公司
色谱柱填料
第18号
立柱尺寸
75微米x 50厘米
流速
300 nL/分钟

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 11.2 2.8 2.5 10.6 4 3.1 15.4 4.9 4 15 15 15
7岁(1+) 7.5 2.8 2.7 10.6 4.1 3.3 13 5 4.3 15 15 15
y10(1+) 6.7 3.8 2.4 7.6 5.2 3.8 10.1 6.4 4.5 15 15 15
总和 6.3 3.2 2.2 7.6 4.4 3.3 9.9 5.4 4 15 15 15


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