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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
19韩元 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
400 44106
蛋白质名称
角蛋白,I型细胞骨架19
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MTSYSYRQSS公司 ATSSFGGLGG公司 GSVRFGPGVA公司 弗朗索瓦格斯 GGRGVSVSSA公司
60 70 80 90 100
RFVSSSGA公司 YGGGGVLT公司 阿斯德格朗尼 KLTMQNLNDR公司 LASYLDKVR公司A类
110 120 130 140 150
E类A类A类N个G公司E类E类V(V) K(K)IRDWYQKQG公司 PGPSRDYSHY公司 YTTIQDLRDK公司 ILGATIENSR公司
160 170 180 190 200
IVLQIDNARL公司 AADDFRTKFE公司 TEQALRMSVE公司 ADINGLRRVL公司 德尔特拉德
210 220 230 240 250
EMQIEGLKEE公司 LAYLKNHEE公司 EISTLRGQVG公司 GQVSVEVDSA公司 PGTDLAKILS公司
260 270 280 290 300
DMRSQYEVMA公司 EQNRKDAEAW公司 FTSRTEELNR公司 EVAGHTEQLQ公司 MSRSEVTDLR软件
310 320 330 340 350
RTLQGLEIEL公司 QSQLSMK公司A类A类 E类D类T型A类E类T型E类A类 FGAQLAHIQA公司 利什基亚QLG
360 370 380 390 400
DVRADSERQN公司 QEYQRLMDIK公司 SRLEQEIATY公司 RSLLEGQEDH公司 YNNLSAKVL公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

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磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-1523的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
19韩元
顺序
AALEDTLAETEAR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
318
肽末端
330
CPTAC标识
CPTAC-1523型
肽分子质量
1,388.6783
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流速
0.4微升/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM1


色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y4(1+) 59.2 10.7 5.6 55 31.5 35.6 80.8 33.3 36 15 15 15
y5(1+) 38.7 14.6 5.1 37.1 28.6 30.9 53.6 32.1 31.3 15 15 15
y6(1+) 35.9 13 5.2 43.7 27.2 31.6 56.6 30.1 32 15 15 15
总和 30.7 8.2 3.4 37.7 27 32.1 48.6 28.2 32.3 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-1522的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
19韩元
顺序
阿连根列夫
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
100
肽末端
111
CPTAC标识
CPTAC-1522型
肽分子质量
1,242.6456
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流速
0.4微升/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向SRM1


色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(1+) 11.7 9.8 4.5 45.9 21.4 32.8 47.4 23.5 33.1 15 15 15
7岁(1+) 13.1 10.5 3.7 40.7 22.5 30.7 42.8 24.8 30.9 15 15 15
8岁(1+) 11.8 8.7 2.7 39.6 20.3 31.7 41.3 22.1 31.8 15 15 15
y10(1+) 6.6 9.8 2.7 45.4 22.4 30.4 45.9 24.4 30.5 15 15 15
总和 7.1 8.6 1.6 41.6 21.2 31.1 42.2 22.9 31.1 15 15 15


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