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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
NFKB1型 不适用
序列长度(AA) 分子量(Da)
968 105356
蛋白质名称
核因子NF-kappa-B p105亚单位
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
梅德佩尔格 PEQMFHLDPS公司 LTHTIFNPEV公司 FQPQMALPTD公司 GPYLQILEQP公司
60 70 80 90 100
KQRGFRFRYV公司 CEGPSHGGLP公司 GASSEKNKKS公司 YPQVKICNYV公司 GPAKVIVQLV公司
110 120 130 140 150
TNGKNIHLHA公司 HSLVGKHCED公司 GICTVTAGPK公司 DMVVGFANLG公司 ILHVTKKKVF公司
160 170 180 190 200
ETLEARMTEA公司 CIRGYNPGLL公司 VHPDLAYLQA系统 EGGGDRQLGD公司 列克列尔卡阿
210 220 230 240 250
LQQTKEMDLS公司 VVRLMFTAFL公司 PDSTGSFTRR公司 LEPVVSDAIY公司 DSKAPNASNL型
260 270 280 290 300
KIVRMDRTAG公司 CVTGGEEIYL公司 LCDKVQKDDI公司 QIRFYEEEN公司 GGVWEGFGDF公司
310 320 330 340 350
SPTDVHRQFA标准 IVFKTPKYKD公司 INITKPASVF程序 VQLRRKSDLE公司 TSEPKPFLYY公司
360 370 380 390 400
PEIKDKEEVQ公司 RKRQKLMPNF公司 SDSFGGSGA公司 GAGGGMFGS公司 GGGGG三峡
410 420 430 440 450
GPGYSPFHYG公司 FPTYGGITFH公司 PGTTKSNAGM公司 KHGTMDTESK公司 KDPEGCDKSD公司
460 470 480 490 500
DKNTVNLFGK公司 VIETTEQDQE公司 伪随机数 VTLTYATGTK公司 EESAGVQDNL公司
510 520 530 540 550
FLEKAMQLAK公司 拉哈纳法迪亚 VTGDVKMLLA公司 VQRHLTAVQD公司 ENGDSVLHLA公司
560 570 580 590 600
IIHLHSQLVR公司 DLLEVTSGLI公司 SDDIINMRND公司 LYQTPHLAV型 ITKQEVED公司
610 620 630 640 650
LLRAGADLSL公司 LDRLGNSVLH公司 拉阿克德科夫 LSILLKHKKA公司 所有HPNGD
660 670 680 690 700
格纳伊拉姆 SNSLPCLLLL公司 瓦加德夫纳克 EQKSGRTALH公司 LAVEHDNISL公司
710 720 730 740 750
阿格勒格达 HVDSTTYDGT TPLHIAAGG公司 斯特拉奥尔卡 阿加德普尔文夫
760 770 780 790 800
EPLYDLDDSW公司 启用DEGVV PGTTPLDMAT公司 SWQVFDILNG公司 KPYEPEFTSD公司
810 820 830 840 850
DLLAQGDMKQ公司 LAEDVKLQLY公司 KLLEIPDPDK公司 NWATLAQKLG公司 LGILNNAFR公司
860 870 880 890 900
S公司P(P)A类P(P)S公司K(K)TLMD公司 NYEVSGGTVR公司 ELVEALRQMG公司 YTEAIEVIQA公司 ASSPVKTTSQ公司
910 920 930 940 950
AHSLPLSPAS公司 TRQQIDELR公司D类 S公司D类S公司V(V)C类D类S公司G公司V(V)E类 T型S公司F类KLSFTE公司 SLTSGASLLT公司
960 968
LNKMPHDYGQ公司 EGPLEGKI公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-1330的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
NFKB1型
肽修饰顺序
DSDSVC[+57.0]DSGVETS[+80.0]FR(法国)
修改类型
氨基甲基半胱氨酸,磷酸(ST)
蛋白质-修饰位点
925, 932
肽-修饰位点
6, 13
肽开始
920
肽末端
934
CPTAC标识
CPTAC-1330型
肽分子质量
1,739.6346
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
丰富MRM或SRM
富集方法
不适用
矩阵
消化细胞裂解液
提交实验室
布罗德学院
提交实验室PI
史蒂文·卡尔

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

Abelin等,分子细胞蛋白质组学。2016年5月;15(5):1622-41. doi:10.1074/mcp。M116.058354。Epub 2016年2月24日。项目管理标识号:26912667


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
匡提瓦TSQ
内部标准
中稳定同位素肽(δ6 amu)
肽标准纯度
原油(~60%)
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Easy NanoLC1000
色谱柱填料
阻垢剂C18,3 um,200A
立柱尺寸
0.075 x 100毫米
流速
300 nL/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向MRM2

CPTAC-1219:
AURKB公司。
LPLAQVSAHPWVR公司
CPTAC-1220:
中国。
LGTGGFGNVC[+57.0]LYQHR公司
第一百二十一页:
中国。
VWAEAVHHYVSGLK公司
CPTAC-1222:
6月。
NSDLLTSPDVGLLK公司
CPTAC-1223:
MGEA5。
EIPVESIEVSK公司
CPTAC-1224:
PCNA。
DLSHIGDAVVISC[+57.0]阿拉斯加州
CPTAC-1225:
PCNA。
FSASGELGNGNIK公司
第126页:
VAV1。
LNPGDIVELTK公司
CPTAC-1227:
VAV1。
YC[+57.0]SQVESASK公司
CPTAC-1228:
AURKB公司。
SNVQPTAAPGQK公司
CPTAC-1229:
ADCY9。
TDAHFVDVIK公司
CPTAC-1230:
ADCY9。
VIPQHQLSISPDIR公司
CPTAC-1231:
ARHGEF1。
ELVPPDTLHSLPK公司
CPTAC-1232:
B2M。
VEHSDLSFSK公司
CPTAC-1233:
B3GNT8。
NLLLVRPLGPQASIR公司
CPTAC-1234:
加利福尼亚州。
GAQELAASSQQK公司
CPTAC-1235:
加利福尼亚州。
LQLEGQVTELR公司
CPTAC-1236:
CCNB1。
TALGDIGNK公司
CPTAC-1237:
CDKN1B。
NLFGPVDHEELTR公司
CPTAC-1238:
CDKN1B。
VSNGSPSLER公司
CPTAC-1239:
C3。
TIYTPGSTVLYR公司
CPTAC-1240:
EP300。
LGT透镜
CPTAC-1241:
ESR1。
LLFAPNLLLDR公司
CPTAC-1242:
FOXM1。
VLLAEEGIAPLSSAGPGK公司
CPTAC-1243:
GNAI1。
DSGVQAC[+57.0]FNR公司
CPTAC-1244:
GNAI1。
IAQPNYIPTQQDVLR公司
CPTAC-1245:
GNAI3。
IDFGEAAR公司
CPTAC-1246:
GNAI3。
ISQSNYIPTQQDVLR公司
CPTAC-1247:
GRB10级。
SQQDPAGPGLPAQSDR公司
CPTAC-1248:
HDAC1。
YYAVNYPLR公司
CPTAC-1249:
IL18。
ISTLSC[+57.0]英语
CPTAC-1250:
IL18。
SDIIFFQR系统
CPTAC-1251:
JAK1。
QLASALSYLEDK公司
CPTAC-1252:
JAK2。
LSDPGISITVLPK公司
CPTAC-1253:
CDC25B。
LLGHSPVLR公司
CPTAC-1254:
CDC25B。
TAVNLPLER公司
CPTAC-1255:
NCOA1。
LVQGGGLDVLSER公司
CPTAC-1256:
NCOA3。
AVSLDSPVSVGSSPPVK
CPTAC-1257:
NCOA3。
LLQNGNSPAEVAK公司
CPTAC-1258:
NEK2。
SQDSSPVLSELK公司
CPTAC-1259:
NEK2。
YSDELNEIITR公司
CPTAC-1260:
NFKB1。
LSPAPSK公司
CPTAC-1261:
OGT公司。
AFLDSLPDVK公司
CPTAC-1262:
OGT公司。
GSVAEAEDC[+57.0]YNTALR公司
CPTAC-1263:
PCP4。
AAVAIQSQFR公司
CPTAC-1264:
第1页。
HINPVAASLIQK公司
CPTAC-1265:
RANBP10。
LYPAVNQETPLPR公司
CPTAC-1266:
RANBP10。
VQGTVHC[+57.0]FPISAR
CPTAC-1267:
SKP2。
LSDPIVNTLAK公司
CPTAC-1268:
SMAD4。
GFPHVIYAR公司
CPTAC-1269:
SMAD4。
YC[+57.0]QYAFDLK公司
CPTAC-1270:
STAT5A。
ATIISEQQAK公司
CPTAC-1271:
STAT5A。
希林纳(HILYNEQR)
CPTAC-1272:
统计1。
年平均值[+57.0]
CPTAC-1273:
统计2。
EVLQSLPLTEIIR公司
CPTAC-1274:
统计2。
HYQLLTEENIPENPLR公司
CPTAC-1275:
统计3。
FPELNYQLK公司
CPTAC-1276:
统计3。
GLSIEQLTTLAEK公司
CPTAC-1277:
统计4。
YLYPDIPK基因

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y10(1+) 24 18.6 11.7 25.2 20.4 16.5 34.8 27.6 20.2 15 15 15
9岁(1+) 48.1 20.3 29.2 46.9 31.1 40.3 67.2 37.1 49.8 15 15 15
8岁(1+) 37.5 28.7 11 55.7 32.7 11.1 67.1 43.5 15.6 15 15 15
总和 22.6 8.6 9.6 21.8 10 12.6 31.4 13.2 15.8 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-1260的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
NFKB1型
顺序
LSPAPSK公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
850
肽末端
856
CPTAC标识
CPTAC-1260型
肽分子质量
698.3963
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子K处的13C和15N
信用证
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流速
0.5微升/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向MRM2

CPTAC-1219:
AURKB公司。
LPLAQVSAHPWVR公司
CPTAC-1220:
中国。
LGTGGFGNVC[+57.0]LYQHR公司
CPTAC-1221:
中国。
VWAEAVHHYVSGLK公司
CPTAC-1222:
6月。
NSDLLTSPDVGLLK公司
CPTAC-1223:
MGEA5。
EIPVESIEVSK公司
CPTAC-1224:
PCNA。
DLSHIGDAVVISC[+57.0]阿拉斯加州
CPTAC-1225:
PCNA。
FSASGELGNGNIK公司
CPTAC-1226:
VAV1。
LNPGDIVELTK公司
CPTAC-1227:
VAV1。
YC[+57.0]SQVESASK公司
CPTAC-1228:
AURKB公司。
SNVQPTAAPGQK公司
CPTAC-1229:
ADCY9。
TDAHFVDVIK公司
CPTAC-1230:
ADCY9。
VIPQHQLSISPDIR公司
CPTAC-1231:
ARHGEF1。
ELVPPDTLHSLPK公司
CPTAC-1232:
B2M。
VEHSDLSFSK公司
CPTAC-1233:
B3GNT8。
NLLLVRPLGPQASIR公司
CPTAC-1234:
加利福尼亚州。
GAQELAASSQQK公司
CPTAC-1235:
加利福尼亚州。
LQLEGQVTELR公司
CPTAC-1236:
CCNB1。
塔格登克
CPTAC-1237:
CDKN1B。
NLFGPVDHEELTR公司
CPTAC-1238:
CDKN1B。
VSNGSPSLER公司
CPTAC-1239:
C3。
TIYTPGSTVLYR公司
CPTAC-1240:
EP300。
LGT透镜
CPTAC-1241:
ESR1。
LLFAPNLLLDR公司
CPTAC-1242:
FOXM1。
VLLAEEGIAPLSSAGPGK公司
CPTAC-1243:
GNAI1。
DSGVQAC[+57.0]FNR公司
CPTAC-1244:
GNAI1。
IAQPNYIPTQQDVLR公司
CPTAC-1245:
GNAI3。
IDFGEAAR公司
CPTAC-1246:
GNAI3。
ISQSNYIPTQQDVLR公司
CPTAC-1247:
GRB10。
SQQDPAGPGLPAQSDR公司
CPTAC-1248:
HDAC1。
YYAVNYPLR公司
CPTAC-1249:
IL18。
ISTLSC[+57.0]脑啡肽
CPTAC-1250:
IL18。
SDIIFFQR系统
CPTAC-1251:
JAK1。
QLASALSYLEDK公司
CPTAC-1252:
JAK2。
LSDPGISITVLPK公司
CPTAC-1253:
CDC25B。
LLGHSPVLR公司
CPTAC-1254:
CDC25B。
TAVNLPLER公司
CPTAC-1255:
NCOA1。
LVQGGGLDVLSER公司
CPTAC-1256:
NCOA3。
AVSLDSPVSVGSSPPVK
CPTAC-1257:
NCOA3。
LLQNGNSPAEVAK公司
CPTAC-1258:
NEK2。
SQDSSPVLSELK公司
CPTAC-1259:
NEK2。
YSDELNEIITR公司
CPTAC-1260:
NFKB1。
LSPAPSK公司
CPTAC-1261:
OGT公司。
AFLDSLPDVK公司
CPTAC-1262:
奥格特。
GSVAEAEDC[+57.0]YNTALR公司
CPTAC-1263:
PCP4。
AAVAIQSQFR公司
CPTAC-1264:
PLK1。
HINPVAASLIQK公司
CPTAC-1265:
RANBP10。
LYPAVNQETPLPR公司
CPTAC-1266:
RANBP10。
VQGTVHC[+57.0]FPISAR
CPTAC-1267:
SKP2。
LSDPIVNTLAK公司
CPTAC-1268:
SMAD4。
GFPHVIYAR公司
CPTAC-1269:
SMAD4。
YC[+57.0]QYAFDLK公司
CPTAC-1270:
STAT5A。
阿蒂塞克
CPTAC-1271:
STAT5A。
希林纳(HILYNEQR)
CPTAC-1272:
统计1。
NLSFFLTPPC[+57.0]银币
CPTAC-1273:
统计2。
EVLQSLPLTEIIR公司
CPTAC-1274:
统计2。
HYQLLTEENIPENPLR公司
CPTAC-1275:
统计3。
FPELNYQLK公司
CPTAC-1276:
统计3。
GLSIEQLTTLAEK公司
CPTAC-1277:
统计4。
YLYPDIPK公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y3(1+) 37 19.8 14.1 56.7 42.8 31.3 67.7 47.2 34.3 15 15 15
y4(1+) 49.1 9.2 12.9 82.4 21.9 16.2 95.9 23.8 20.7 15 15 15
y5(1+) 22.1 6 11.5 28.9 8.6 12.2 36.4 10.5 16.8 15 15 15
总和 19.2 6.8 9.3 28.9 7.8 9.3 34.7 10.3 13.2 15 15 15


其他资源和评论

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