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引用CPTAC分析门户时,请包括以下声明
我们感谢美国国家癌症研究所临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)分析门户网站(assesss.Cancer.gov)用于开发分析并建立本出版物中所述分析的标准。

概述数据来源:UniProt

官方基因符号 其他别名
ESR1系列 电子自旋共振,NR3A1
序列长度(AA) 分子量(Da)
595 66216
蛋白质名称
雌激素受体
来源
UniProt公司
磷化SitePlus®
基因卡
人类蛋白质阿特拉斯

蛋白质序列悬停以查看完整序列

10 20 30 40 50
MTMTLHTKAS公司 GMALLHQIQG公司 NELEPLNRPQ公司 LKIPLERPLG公司 EVYLDSSKPA公司
60 70 80 90 100
维尼佩加 EFNAAAAANA公司 QVYGQTGLPY公司 GPGSEAAAFG公司 SNGLGGFPPL公司
110 120 130 140 150
NSVSPSPLML LHPPPQLSPF公司 LQPHGQQVPY公司 聚乙烯 VREAGPPAFY公司
160 170 180 190 200
RPNSDNRRQG公司 格雷兰州 克格斯马梅萨克 ETRYCAVCND公司 YASGYHYGVW公司
210 220 230 240 250
SCEGCKAFFK公司 RSIQGHNDYM公司 CPATNQCTID公司 KNRRKSCQAC公司 RLRKCYEVGM公司
260 270 280 290 300
MKGGIRKDRR公司 GGRMLKHKRQ公司 RDDGEGRGEV公司 GSAGDMAAN公司 LWPSPLMIKR公司
310 320 330 340 350
SKKNSLALSL公司 TADQMVSALL公司 DAEPPILYSE公司 YDPTRPFSEA公司 SMMGLLTNLA公司
360 370 380 390 400
DRELVHMINW公司 AKRVPGFVDL公司 TLHDQVHLLE公司 CAWLEILMIG公司 LVWRSMEHPG公司
410 420 430 440 450
K(K)F类A类P(P)N个 D类NQGKCVEG公司 MVEIFDMLLA公司 TSSRFRMMNL公司 QGEEFVCLKS公司
460 470 480 490 500
IILLNSGVYT公司 FLSSTLKSLE公司 EKDHIHRVLD公司 KITTLIHLM公司 阿卡克语
510 520 530 540 550
HQRLAQLLI公司 LSHIRHMSNK公司 通用电气股份有限公司 KNVVPLYDLL LEMLDAHRLH公司
560 570 580 590 595
APTSRGGASV公司 EETDQSHLAT公司 AGSTSSHSLQ公司 KYITGEAEG公司 FPATV公司

数据来源:UniProt


蛋白质图谱 折叠蛋白图

靶向肽分析物相对于SNP、异构体和PTM的位置

Uniprot公司数据库登录 磷网站+®

单击节点上的点
查看下面的详细分析信息
所有其他点链接到 UniProt公司



磷酸化 乙酰化 泛素化 其他

加载

装载机

CPTAC-145的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
ESR1系列
顺序
LLFAPNLLLDR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
402
肽末端
412
CPTAC标识
CPTAC-145型
肽分子质量
1,283.7602
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
细胞系裂解液池
提交实验室
弗雷德·哈钦森癌症研究中心
提交实验室PI
阿曼达·保罗维奇

出版物

查看详细信息 (在新窗口中打开)

证明大规模开发标准化分析以量化人类蛋白质的可行性。Kennedy JJ、Abbatiello SE、Kim K、Yan P、Whiteaker JR、Lin C、Kim JS、Zhang Y、Wang X、Ivey RG、Zhao L、Min H、Lee Y、Yu MH、Yang EG、Lee C、Wang P、Rodriguez H、Kim Y、Carr SA、Paulovich AG。Nat方法2014年2月;11(2):149-55. doi:10.1038/nmeth.2763。Epub 2013年12月8日。PMID:24317253


分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
5500个QTRAP(ABSCIEX)
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
nanoLC-Ultra 2D,cHiPLC-nanoflex(Eksigent)
色谱柱填料
ChromXP C18-CL,3微米,120A
立柱尺寸
150 x 0.075毫米
流速
500 nL/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向MRM2

CPTAC-1219:
AURKB公司。
LPLAQVSAHPWVR公司
CPTAC-1220:
中国。
LGTGGFGNVC[+57.0]LYQHR公司
第一百二十一页:
中国。
VWAEAVHHYVSGLK公司
CPTAC-1222:
6月。
NSDLLTSPDVGLLK公司
CPTAC-1223:
MGEA5。
EIPVESIEVSK公司
CPTAC-1224:
PCNA。
DLSHIGDAVVISC[+57.0]阿拉斯加州
CPTAC-1225:
PCNA。
FSASGELGNGNIK公司
第126页:
VAV1。
LNPGDIVELTK公司
CPTAC-1227:
VAV1。
YC[+57.0]SQVESASK公司
CPTAC-1228:
AURKB公司。
SNVQPTAAPGQK公司
CPTAC-1229:
ADCY9。
TDAHFVDVIK公司
CPTAC-1230:
ADCY9。
VIPQHQLSISPDIR公司
CPTAC-1231:
ARHGEF1。
ELVPPDTLHSLPK公司
CPTAC-1232:
B2M。
VEHSDLSFSK公司
CPTAC-1233:
B3GNT8。
NLLLVRPLGPQASIR公司
CPTAC-1234:
加利福尼亚州。
GAQELAASSQQK公司
CPTAC-1235:
加利福尼亚州。
LQLEGQVTELR公司
CPTAC-1236:
CCNB1。
TALGDIGNK公司
CPTAC-1237:
CDKN1B。
NLFGPVDHEELTR公司
CPTAC-1238:
CDKN1B。
VSNGSPSLER公司
CPTAC-1239:
C3。
TIYTPGSTVLYR公司
CPTAC-1240:
EP300。
LGT透镜
CPTAC-1241:
ESR1。
LLFAPNLLLDR公司
CPTAC-1242:
FOXM1。
VLLAEEGIAPLSSAGPGK公司
CPTAC-1243:
GNAI1。
DSGVQAC[+57.0]FNR公司
CPTAC-1244:
GNAI1。
IAQPNYIPTQQDVLR公司
CPTAC-1245:
GNAI3。
IDFGEAAR公司
CPTAC-1246:
GNAI3。
ISQSNYIPTQQDVLR公司
CPTAC-1247:
GRB10。
SQQDPAGPGLPAQSDR公司
CPTAC-1248:
HDAC1。
YYAVNYPLR公司
CPTAC-1249:
IL18。
ISTLSC[+57.0]脑啡肽
CPTAC-1250:
IL18。
SDIIFFQR系统
CPTAC-1251:
JAK1。
QLASALSYLEDK公司
CPTAC-1252:
JAK2。
LSDPGISITVLPK公司
CPTAC-1253:
CDC25B。
LLGHSPVLR公司
CPTAC-1254:
CDC25B。
TAVNLPLER公司
CPTAC-1255:
NCOA1。
LVQGGGLDVLSER公司
CPTAC-1256:
NCOA3。
AVSLDSPVSVGSSPPVK
CPTAC-1257:
NCOA3。
LLQNGNSPAEVAK公司
CPTAC-1258:
NEK2。
SQDSSPVLSELK公司
CPTAC-1259:
NEK2。
YSDELNEIITR公司
CPTAC-1260:
NFKB1。
LSPAPSK公司
CPTAC-1261:
OGT公司。
AFLDSLPDVK公司
CPTAC-1262:
OGT公司。
GSVAEAEDC[+57.0]YNTALR公司
CPTAC-1263:
PCP4。
AAVAIQSQFR公司
CPTAC-1264:
第1页。
HINPVAASLIQK公司
CPTAC-1265:
RANBP10。
LYPAVNQETPLPR公司
CPTAC-1266:
RANBP10。
VQGTVHC[+57.0]FPISAR
CPTAC-1267:
SKP2。
LSDPIVNTLAK公司
CPTAC-1268:
SMAD4。
GFPHVIYAR公司
CPTAC-1269:
SMAD4。
YC[+57.0]QYAFDLK公司
CPTAC-1270:
STAT5A。
阿蒂塞克
CPTAC-1271:
STAT5A。
希林纳(HILYNEQR)
CPTAC-1272:
统计1。
年平均值[+57.0]
CPTAC-1273:
统计2。
EVLQSLPLTEIIR公司
CPTAC-1274:
统计2。
HYQLLTEENIPENPLR公司
CPTAC-1275:
统计3。
FPELNYQLK公司
CPTAC-1276:
统计3。
GLSIEQLTTLAEK公司
CPTAC-1277:
统计4。
YLYPDIPK公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
9岁(1+) 15.9 8.4 6.6 35.2 24.8 13.2 38.6 26.2 14.8 15 15 15
8岁(1+) 19.5 10.4 6.4 48.1 25.7 10.5 51.9 27.7 12.3 15 15 15
7岁(1+) 21.9 11.1 10.6 43.6 21.9 14.5 48.8 24.6 18 15 15 15
总和 13.8 9.4 7.2 40.4 22.8 12.5 42.7 24.7 14.4 15 15 15


其他资源和评论

评论

CPTAC-1241的分析细节 折叠分析详细信息

数据来源:全景

官方基因符号
ESR1系列
顺序
LLFAPNLLLDR公司
修改类型
未修改的
蛋白质-修饰位点
不适用
肽-修饰位点
不适用
肽开始
402
肽末端
412
CPTAC标识
CPTAC-1241型
肽分子质量
1,283.7602
物种
人类 智者 (人类)
分析类型
直接MRM或SRM
矩阵
卵巢癌肿瘤组织裂解物
提交实验室
太平洋西北国家实验室
提交实验室PI
刘涛(Tao Liu)

分析参数 折叠分析参数

数据来源:全景

仪器
TSQ华帝
内部标准
肽标准纯度
>95%
肽标准标签类型
C端子R处的13C和15N
信用证
Waters nanoACQUITY(零件号176016000)
色谱柱填料
Waters BEH C18,1.7 um 130º(零件号186007485)
立柱尺寸
100微米x 100毫米
流速
0.5微升/分钟

分析复用 展开分析面板

太平洋西北国家实验室-方向MRM2

CPTAC-1219:
AURKB公司。
LPLAQVSAHPWVR公司
CPTAC-1220:
中国。
LGTGGFGNVC[+57.0]LYQHR公司
第一百二十一页:
中国。
VWAEAVHHYVSGLK公司
CPTAC-1222:
6月。
NSDLLTSPDVGLLK公司
CPTAC-1223:
MGEA5。
EIPVESIEVSK公司
CPTAC-1224:
PCNA。
DLSHIGDAVVISC[+57.0]阿拉斯加州
CPTAC-1225:
PCNA。
FSASGELGNGNIK公司
第126页:
VAV1。
LNPGDIVELTK公司
CPTAC-1227:
VAV1。
YC[+57.0]SQVESASK公司
CPTAC-1228:
AURKB公司。
SNVQPTAAPGQK公司
CPTAC-1229:
ADCY9。
TDAHFVDVIK公司
CPTAC-1230:
ADCY9。
VIPQHQLSISPDIR公司
CPTAC-1231:
ARHGEF1。
ELVPPDTLHSLPK公司
CPTAC-1232:
B2M。
VEHSDLSFSK公司
CPTAC-1233:
B3GNT8。
NLLLVRPLGPQASIR公司
CPTAC-1234:
加利福尼亚州。
GAQELAASSQQK公司
CPTAC-1235:
加利福尼亚州。
LQLEGQVTELR公司
CPTAC-1236:
CCNB1。
TALGDIGNK公司
CPTAC-1237:
CDKN1B。
NLFGPVDHEELTR公司
CPTAC-1238:
CDKN1B。
VSNGSPSLER公司
CPTAC-1239:
C3。
TIYTPGSTVLYR公司
CPTAC-1240:
EP300。
LGT透镜
CPTAC-1241:
ESR1。
LLFAPNLLLDR公司
CPTAC-1242:
FOXM1。
VLLAEEGIAPLSSAGPGK公司
CPTAC-1243:
GNAI1。
DSGVQAC[+57.0]FNR公司
CPTAC-1244:
GNAI1。
IAQPNYIPTQQDVLR公司
CPTAC-1245:
GNAI3。
IDFGEAAR公司
CPTAC-1246:
GNAI3。
ISQSNYIPTQQDVLR公司
CPTAC-1247:
GRB10。
SQQDPAGPGLPAQSDR公司
CPTAC-1248:
HDAC1。
YYAVNYPLR公司
CPTAC-1249:
IL18。
ISTLSC[+57.0]脑啡肽
CPTAC-1250:
IL18。
SDIIFFQR系统
CPTAC-1251:
JAK1。
QLASALSYLEDK公司
CPTAC-1252:
JAK2。
LSDPGISITVLPK公司
CPTAC-1253:
CDC25B。
LLGHSPVLR公司
CPTAC-1254:
CDC25B。
TAVNLPLER公司
CPTAC-1255:
NCOA1。
LVQGGGLDVLSER公司
CPTAC-1256:
NCOA3。
AVSLDSPVSVGSSPPVK
CPTAC-1257:
NCOA3。
LLQNGNSPAEVAK公司
CPTAC-1258:
NEK2。
SQDSSPVLSELK公司
CPTAC-1259:
NEK2。
YSDELNEIITR公司
CPTAC-1260:
NFKB1。
LSPAPSK公司
CPTAC-1261:
OGT公司。
AFLDSLPDVK公司
CPTAC-1262:
OGT公司。
GSVAEAEDC[+57.0]YNTALR公司
CPTAC-1263:
PCP4。
AAVAIQSQFR公司
CPTAC-1264:
第1页。
HINPVAASLIQK公司
CPTAC-1265:
RANBP10。
LYPAVNQETPLPR公司
CPTAC-1266:
RANBP10。
VQGTVHC[+57.0]FPISAR
CPTAC-1267:
SKP2。
LSDPIVNTLAK公司
CPTAC-1268:
SMAD4。
GFPHVIYAR公司
CPTAC-1269:
SMAD4。
YC[+57.0]QYAFDLK公司
CPTAC-1270:
STAT5A。
阿蒂塞克
CPTAC-1271:
STAT5A。
希林纳(HILYNEQR)
CPTAC-1272:
统计1。
年平均值[+57.0]
CPTAC-1273:
统计2。
EVLQSLPLTEIIR公司
CPTAC-1274:
统计2。
HYQLLTEENIPENPLR公司
CPTAC-1275:
统计3。
FPELNYQLK公司
CPTAC-1276:
统计3。
GLSIEQLTTLAEK公司
CPTAC-1277:
统计4。
YLYPDIPK公司

色谱图

数据来源:全景


响应曲线

数据来源:全景

检索数据

装载机

可重复性

数据来源:全景

  平均内部CV
(CV日内)
平均层间CV
(日间CV)
总CV
方程式
n个=
碎片/过渡 医学 医学 医学 医学
y6(1+) 39.7 26.4 20.9 59.9 25.9 25.4 71.9 37 32.9 15 15 15
7岁(1+) 6.2 6.3 5.3 45 18.6 22.2 45.4 19.6 22.8 15 15 15
8岁(1+) 13.6 11.6 5.9 49 19.9 24.4 50.9 23 25.1 15 15 15
总和 7.2 7.1 5.1 45.5 17.9 22.5 46.1 19.3 23.1 15 15 15

选择性

数据来源:全景

单元格线的曲线拟合斜率
碎片_离子 1 2 4 5 6
8岁(1+) 1.94 3.38 2.61 3.19 5.8 3.1
7岁(1+) 2.38 3.4 2.71 3.11 5.92 3.25
y6(1+) 1.44 3.31 1.85 1.98 3.74 3.47
总和 2.22 3.39 2.62 3.05 5.76 3.21

稳定性

数据来源:全景

碎片/过渡 控制_输入_确认 实际_温度_转换_电流 冻结_intra_CV FTx1_intra_CV FTx2入轨电流
7岁(1+) 4.5 7.4 4.1 7.5 7.7
8岁(1+) 7.6 5.2 3.5 12.7
y6(1+) 8.5 5.2 5.3 7.1 8.4
总和 3.4 6.5 3.8 5.1 8.2
碎片/过渡 全部_内Tra _ CV 所有中间CV
7岁(1+) 6.5 6.3
8岁(1+) 6.6 6.6
y6(1+) 6.6 9.4
总和 5.6 5.6

内源性

数据来源:全景

碎片/过渡 CV内 中间CV 总计CV
7岁(1+) 77 69.2 103.5
8岁(1+) 57.2 65.5 87
y6(1+) 68.6 76.7 102.9
总和 59.6 60.2 84.7

其他资源和评论

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