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具有异质细胞大小的最小细胞自动机模型预测上皮细胞集落生长

@进行中{Lange2024MinimalCA，title={具有异质细胞大小的最小细胞自动机模型预测上皮细胞集落生长}，author={Steffen Lange和Jannik Schmied以及Paul Willam和Anja Voss-Bohme}，年份={2024}，网址={https://api.semanticscholar.org/CorpusID:268364011}}
一种最小的数据驱动模型，通过扩展概率CA来模拟平面细胞培养的动力学，以纳入生长和细胞分裂过程中单个细胞的大小变化，并表现出从低密度融合状态到稳定的融合后状态的转变，细胞大小和运动迅速减少。
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上皮集落生长和接触抑制的机制性集合细胞模型。

上皮接触抑制中的集体和单细胞行为

测量和分析表明，接触抑制是机械相互作用和约束的结果，而不仅仅是界面接触的结果，并定义了定量表型，可以指导未来接触抑制的分子机制研究。

连接细胞和组织力学的理论和实验。

讨论了不同的建模方法，包括自下而上的假设驱动和自上而下的数据驱动模型，并强调了它们的优势和应用，强调了物理模型如何提供概念见解，并为生物现象产生统一和可推广的框架。

放射治疗三维肿瘤球体动力学的高效辐射壳模型

提出了一种基于径向球体内和跨径向球体细胞动力学的有效一维数学模型，该模型利用肿瘤球体的近似旋转对称性，充分融合了肿瘤球体的三维动力学。

比较基准流几何结构中集体细胞运动的基于个体的模型。

对五种细胞集体迁移的模拟模型进行了比较，并对运动粒子和运动细胞的模型是否显示类似的集体效应进行了检查，以提供如何选择模型来回答给定问题的建议。

MorphoSim：用于准确模拟多细胞形态的高效可扩展相场框架

通过使用稳定的数值格式和改进的体积收缩，提出了一种改进的相场模型，并提出了一个可扩展的相场框架，即MorphoSim，它的效率是前一个框架的100倍，可以模拟100多个机械相互作用的细胞。

基于模型的指导多型细胞分离的有效粘附参数预测

有效粘附参数可以解决最近关于界面粘附影响的争议，皮层张力和异型排斥对细胞分离的影响，并根据差异迁移模型的细胞自动装置生成的硅时间序列数据，证明了三种细胞类型在数值上存在。

通过生态位竞争模拟结肠癌的年龄特异性发病率

提出了一种基于细胞的模型，该模型关注结肠隐窝中野生型细胞和肿瘤细胞之间的竞争，利用该模型可以重现结肠癌的流行病学发病率。

细胞分离是否像油和水：渐进与暂时状态

通过校准一个细胞自动机（CA）模型，该模型有效地将差分粘附假设的动态变量实现到Méhes等人的实验数据中，这项工作证明了瞬态行为与实验相关，而不是渐近行为，并证实了缩放行为的模糊性。

接触抑制对集体细胞迁移和增殖的影响。

采用多相场模型研究由增殖细胞组成的细胞集落的生长动力学，并考虑了局部机械相互作用对细胞增殖的接触抑制机制。
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