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摘要

总结：我们开发了一个程序，即转录位点簇分析器（CATS），它可以识别任何基因组序列中的转录因子结合位点簇。该程序在一个窗口（DNA长度）内搜索DNA结合的一致序列簇。窗口大小和簇大小（给定窗口中一致序列的数量）可以改变。CATS可用于根据生化和突变分析或比较基因组学推导出一致序列的单个或多个转录因子。对不同转录因子结合位点簇使用CATS可能有助于识别以细胞类型特异性或发育阶段特异性方式共同调控的基因。CATS易于在运行任何Windows NT平台的计算机上安装和使用。

可利用性： http://www.healthsciences.columbia.edu/dept/greenwaldlab/links.html

*

信件应寄给谁。

†

作者希望知道，在他们看来，前两位作者应被视为联合第一作者。

作者注释

Wave Systems Corp.，19925 Stevens Creek Blvd，Cupertino，CA 95014，USA，2细胞、分子和生物物理研究综合项目，3生物化学和分子生物物理系和霍华德·休斯医学研究所，哥伦比亚大学，701 West 168th Street，New York，NY 10032，USA

生物信息学20（7）©牛津大学出版社2004；保留所有权利。
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