Seq-Gen：一种应用于沿着系统发育树的DNA序列进化的蒙特卡罗模拟

动机：Seq-Gen是一个程序，它将使用替换过程的通用模型模拟核苷酸序列沿系统发育的进化。实现了一系列分子进化模型，包括通用可逆模型。可以给出该模型的核苷酸频率和其他参数，也可以通过多种方式纳入特定位点的速率异质性。可以读入任意数量的树，程序将为每棵树生成任意数量的数据集。因此，可以轻松创建大型复制模拟集。这可以用于使用参数引导测试系统发育假设。

可用性：Seq-Gen可通过WWW从http://evolve.zoo.ox.ac.uk/Seq-Gen/Seq-Gen.html或通过FTP从ftp://evolve.zoo.ox.ac.uk/packages/Seq-Gen/。该包包括源代码、手册和示例文件。Apple Macintosh版本也可从相同的网站获得。