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与帕金森病相关的LRRK2激酶结构域G2019S替代的分子见解:分子动力学模拟方法。 (英语) Zbl 1411.92229号

小结:富含亮氨酸重复激酶2(LRRK2)的G2019S替代与帕金森病(PD)显著相关。这种替代在家族性和散发性帕金森病中均有发现,且发生频率较高。很少有计算研究报道G2019S取代对LRRK2激酶结构域抑制剂的影响。然而,没有计算研究深入研究G2019S取代对其Apo构象中激酶结构域的可能影响。因此,在本研究中,我们使用200 ns分子动力学模拟,使用GROMACS 5.1.4软件包来研究G2019S取代对LRRK2激酶结构域结构的影响。我们的结果表明,G2019S取代通过降低激酶结构域的柔性和增加其紧密性来影响LRRK2的动力学和稳定性,并且由于活性构象和非活性构象之间的高能垒,其表现出长时间处于活性构象的趋势。本研究预测了G2019S对PD患者的分子致病机制,并为开发含有这种氨基酸替代物的PD患者治疗药物提供了潜在平台。

MSC公司:

92D20型 蛋白质序列,DNA序列

软件:

格鲁马克斯
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全文: 内政部

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