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生物信息学分析恶性疟原虫CDPK5蛋白通过分子建模、对接和动力学。 (英语) Zbl 1406.92209号

摘要:钙依赖性蛋白激酶5(CDPK5)蛋白是一种钙依赖性蛋白质激酶家族成员之一,存在于植物和一些原生动物物种中,包括恶性疟原虫(Pf),引起疟疾的病原体。CDPK调节顶端复合体的许多生物过程,例如疟原虫,弓形虫隐孢子虫这项研究探讨了顶复合体中CDPK5序列的相似性和进化关系。此外,通过同源建模生成PfCDPK5的三维结构构象。在40 ns的时间间隔内对同源模型进行分子动力学模拟,得到PfCDPK5蛋白的稳定构象。通过计算筛选已知抗疟疾化合物进行抑制剂鉴定。通过复杂分子动力学研究验证了最佳抑制剂化合物MMV687246结合模式的可靠性。这一发现主张来自Pathogen Box的MMV687246是对抗PfCDPK5蛋白的最佳抑制剂,可以考虑用于未来的实验验证研究。

MSC公司:

92C40型 生物化学、分子生物学
92D20型 蛋白质序列、DNA序列
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全文: 内政部

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