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Priya P.帕尼格拉希。;蒂拉莎·拉吉·辛格

使用微阵列基因表达和网络数据对阿尔茨海默病相关途径和调控模式的计算研究：揭示了与衰老和其他疾病的关联。 （英语） 兹比尔1397.92352

J.西奥。生物。 334109-121（2013）.
摘要：阿尔茨海默病（AD）是最常见的与年龄相关的神经退行性疾病之一，影响着全世界数百万人。由于其多基因性质，AD被认为不是由单个基因的缺陷引起的，而是由大量基因的变异及其复杂的相互作用引起的，这最终导致了疾病表型的广泛谱。从微阵列和网络数据中提取见解和知识将有助于更好地理解复杂疾病。本研究旨在确定具有差异拓扑结构的基因及其与其他生物过程的进一步关联，这些生物过程调节AD、衰老（AG）和其他疾病的致病因素。我们的分析揭示了AD和AG之间重要生物过程和假定候选基因的共同点。据报道，一些重要的新基因和各种生物过程的其他变体与AD、AG和其他疾病相关，这些可能与通过途径、相互作用和关联从AG导致AD的生化事件有关。此外，还发现了网络基序的新信息，如BiFan、MIM（多输入模块）和SIM（单输入模块）及其类似变体，这些隐含信息将有助于改进AD和AG的研究。我们的数据中已确定了TF（转录因子）的十大类，发现数百种TFBS模式与AD和其他疾病相关。这些TFBS类别的结构和理化性质分析揭示了生物过程与其他严重人类疾病的关联。核小体和连接子位置信息可以提供关键细胞过程的见解。独特的miRNA（micro-RNA）靶点被确定为AD的另一个调节过程。新基因和现有基因变体的关联也被探索，以了解它们与其他疾病的相互作用和关联，这些疾病通过AG和AD直接或间接牵连。

MSC公司：

92 C50 医疗应用（通用）
92C40型 生物化学、分子生物学

关键词：

富集分析;TFBS公司;米尔纳;网络模体;核小体

软件：

MAVisto公司;JASPAR公司;字符串;iNuc-PhysChem;GOLEM公司;网络格式塔;戈里拉;生物网格;FANMOD公司;TM4公司;KEGG公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{P.P.Panigrahi}和\textit{T.R.Singh}，J.Theor。生物.334，109--121（2013；Zbl 1397.92352）
全文： 内政部

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