HiFive公司 swMATH编号： 34258 软件作者： Sauria，M.E.、Phillips-Cremis，J.E.、Corces，V.G.、Taylor，J。 描述： HiFive：高分辨率hic和5c染色体构象数据分析的标准化方法。虽然基于序列分析的邻近性分析已经确定了染色体组织的许多百万级特征，但实验噪音和偏见使人们对精细组织的了解不足。我们开发了HiFive，一种经验驱动的概率建模方法，用于规范化和分析HiC和5C数据。HiFive允许以比先前描述的更高的分辨率重建染色质结构特征，并满足或优于其他方法。凭借新颖的特征检测、去噪和高效算法，HiFive能够在不牺牲分辨率的情况下，以较小的计算能力和时间利用这些数据。使用HiFive，我们展示了小鼠基因组的转录相关差异空间组织。 主页： https://www.biorxiv.org/content/10.1101/009951v1.full网站 源代码： https://github.com/bxlab/hifou网址 相关软件： TAD宾德先生;TAD树 引用于： 1文件 5位作者引用 1 彼得·约翰·比克尔 1 安舒尔昆达杰 1 Rachel Wang，Y.X。 1 Purnamrita Sarkar 1 奥纳州乌苏 连载1篇 1 应用统计学年鉴 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文