彪马 swMATH ID: 19121 软件作者： 理查德·皮尔逊（Richard D.Pearson）。；刘学军；Sanguinetti，Guido；玛尔塔·米洛；尼尔·劳伦斯。；马格纳斯Rattray 描述： 彪马：一种用于微阵列分析中传播不确定性的生物导管包。Affymetrix基因芯片数据的大多数分析（包括传统的3'阵列和外显子阵列以及人类转录组阵列2.0）都基于表达水平的点估计，并忽略了此类估计的不确定性。通过向下游分析传播不确定性，我们可以改进微阵列分析的结果。puma包首次为普通观众提供了一套不确定性传播方法。除了从Affymetrix 3'阵列计算基因表达外，puma还提供了处理外显子阵列的方法，并为选择性剪接研究生成基因和亚型表达。与以前可用的不确定性传播方法相比，puma在执行范围和速度方面也有所改进。包括总结、差异表达检测、聚类和PCA方法，以及有用的绘图功能。 主页： https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/puma.html 依赖项： R（右） 相关软件： 生物导体;R（右）;Affycomp III公司;阿菲;GraphProt（图形保护）;IPMiner（IPMiner）;单词2vec;国际存托凭证;达奇;METIS公司;宇宙;MM5公司;ExnerFOAM公司;DYNAMICO公司;阿罗梅;阿勒丁-NH;阿佩格;NICAM公司;MMesh3D;菲姆 引用于： 2文件 全部的 前5名10位作者引用 1 维普洛夫·阿罗拉 1 弗朗西斯·吉拉尔多。 1 纪尧姆·胡泽奥 1 约巴，奥里奥尔 1 詹姆斯·凯利。 1 米查尔·科佩拉。 1 西蒙·马拉斯 1 玛格丽达·莫拉格 1 吉多·桑吉内蒂 1 马里亚诺·巴斯克斯 2篇连载文章中引用 1 工程计算方法档案 1 遗传学和分子生物学中的统计应用 在5个字段中引用 1 数值分析（65-XX） 1 计算机科学（68至XX） 1 流体力学（76-XX） 1 地球物理学（86-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文