P折叠 swMATH ID: 17128 软件作者： Sukosd Z、Knudsen B、Kjems J、Pedersen中国 描述： PPfold 3.0：利用系统发育和辅助数据进行快速RNA二级结构预测。概要：PPfold是用于RNA二级结构预测的Pfold算法的多线程实现。在这里，我们提出了一个新版本的PPfold，它使用灵活的概率模型扩展了进化分析，以纳入辅助数据，例如来自结构探测实验的数据。我们的测试表明，使用PPfold 3.0中的实验数据预测单序列二级结构的准确性与RNA结构相当。此外，通过添加实验数据，对准结构预测质量进一步提高。因此，PPfold 3.0有可能产生比以前更准确的预测。可用性和实现：PPfold 3.0作为平台相关的Java应用程序提供，可以从以下网站下载http://birc.au.dk/software/ppfold。 主页： 网址：http://www.daimi.au.dk/~compbio/pfold/downloads.html 相关软件： ARB公司;EMBOS公司;最小值;埃米尔吉;维也纳RNA;标签清理器;OligoWalk公司;最优RNAi;阿斯塔拉维斯塔;预GPI;SPEPlip公司;BaCelLo公司;PolyA_DB公司;ASPicDB公司;生物城;Astex查看器;勺;战争;PatSearch（补丁搜索）;NGS QC工具包;ExpEdit（ExpEdit） 引用于： 1文件 1位作者引用 1 埃内斯托·皮卡迪 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 总体主题；集合（00-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文