荷兰，芭芭拉;凯萨琳娜·胡贝尔（Katharina T.Huber）。;文森特·莫尔顿 收敛进化的基于距离的模型。 （英语） Zbl 1531.92065号 数学杂志。生物。 88，第2期，第17号论文，23页（2024年）. 摘要：收敛进化是一个重要的过程，在这个过程中，独立物种通常会在很长一段时间内进化出类似的特征。它发生在生命树上的许多不同物种中，通常是由于物种必须适应相似的环境生态位。在本文中，我们引入并研究了一个基于距离的收敛进化模型的性质，在该模型中，我们假设两个祖先物种在按照进化时钟进化的物种集合内收敛一定时间。在这些假设下，我们得到了集合上的一个距离，这是由等距系统发育树产生的超距距离的修正。除了描述修改后的距离是树度量时的特征外，我们还根据模型参数给出了恢复基础树及其高度的条件，即使修改后的间距不是树度量。 MSC公司： 92D15型 与进化有关的问题 05二氧化碳 树 05C12号 图形中的距离 关键词：收敛进化;超测量的;等距树;树度量;三重相关度量 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{B.Holland}等人，J.Math。生物学88，第2期，论文17，23页（2024；Zbl 1531.92065） 全文： 内政部 OA许可证 参考文献： [1] 巴普泰斯特，E。；范·埃尔塞尔，L。；詹克，A。；Kelchner，S。；Kelk，S。；JO麦金纳尼；陆军部莫里森；纳赫勒，L。；钢，M。；Stougie，L.，《网络：扩展进化思维》，《趋势基因》，29，8，439-441（2013）·doi:10.1016/j.tig.2013.05.007 [2] Bohling，JH，《应对杂交和基因渗入带来的保护威胁的策略》，《生物保护》，203，321-327（2016）·doi:10.1016/j.biocon.2016.10.101 [3] Dagan，T。；Martin，W.，《百分之一之树》，《基因组生物学》，第7期，第1-7页（2006年）·doi:10.1186/gb-2006-7-10-118 [4] Felsenstein，J.，推断系统发育（2004），桑德兰：西诺尔，桑德兰 [5] 弗朗西斯，AR；Steel，M.，树状网状网络——树状距离何时也支持网状进化？，Math Biosci，259，12-19（2015）·Zbl 1315.92053号 ·doi:10.1016/j.mbs.2014.10.008 [6] 朱克斯，TH；康托，CR，蛋白质分子的进化，哺乳动物蛋白质元，3，21-132（1969）·doi:10.1016/B978-1-4832-3211-9.50009-7 [7] Mallet，J.，《杂交作为基因组入侵》，《生态进化趋势》，20，5，229-237（2005）·doi:10.1016/j.tree.2005.02.010 [8] Mitchell J（2016）《区分进化网络上的趋同》。博士论文 [9] Mitchell，JD；JG萨姆纳；Holland，BR，区分三个分类群的聚合进化和破坏分子钟，Syst Biol，67，5，905-915（2018）·doi:10.1093/sysbio/syy038 [10] 佩雷兹·洛萨达，M。；阿雷纳斯，M。；加兰，JC；Palero，F。；González-Candelas，F.，《病毒重组：机制、研究方法和进化后果》，《感染基因进化》，30，296-307（2015）·doi:10.1016/j.meegid.2014.12.022 [11] 鲁德曼，SM；Schluter，D.，《三棘棘锥鱼反向物种形成的生态影响》，Curr Biol，26，4，490-495（2016）·doi:10.1016/j.cub.2016年1月16日 [12] 萨克顿，结核病；Clark，N.，《基因组学时代的融合进化：新见解和方向》，Philos Trans R Soc B，374177720190102（2019）·doi:10.1098/rstb.2019.0102 [13] Seehausen，O.，《保护：通过反向物种形成丧失生物多样性》，Curr Biol，16，9，334-337（2006）·doi:10.1016/j.cub.2006.03.080 [14] Semple，C。；Steel，M.，有根树的超树方法，离散应用数学，105，1-3，147-158（2000）·Zbl 0961.05015号 ·doi:10.1016/S0166-218X（00）00202-X [15] Semple，C。；Steel，M.，《系统发育学》（2003），牛津：牛津大学出版社，牛津·Zbl 1043.92026 ·doi:10.1093/oso/9780198509424.001.0001 [16] Steel，M.，进化模型应该尝试“适合大象”吗？，《Genet趋势》，21，6，307-309（2005）·doi:10.1016/j.tig.2005.04.001 [17] 萨姆纳，JG；荷兰，B。；Jarvis，P.，《系统发育树和网络上一般马尔可夫模型的代数》，《公牛数学生物学》，74858-880（2012）·Zbl 1235.92037号 ·doi:10.1007/s11538-011-9691-z [18] Willson，SJ，某些系统发育网络上的树平均距离具有唯一确定的权重，Algorithms Mol Biol，7，1-15（2012）·doi:10.1186/1748-7188-7-13 [19] 扎克坎德尔，E。；Pauling，L.，《作为进化历史文件的分子》，《Theor Biol杂志》，8，2，357-366（1965）·doi:10.1016/0022-5193（65）90083-4 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。