郑明;Leah O·巴雷拉。;任炳;吴应年 ChIP-ChIP：数据、模型和分析。 （英语） 兹比尔1146.62357 生物计量学 63，第3期，787-796（2007）. 概述：ChIP-ChIP（或ChIP-on-ChIP）是一种分离和鉴定活细胞中特定DNA-结合蛋白占据的基因组位点的技术。ChIP-ChIP信号可以通过平铺阵列在整个基因组上获得，通常在蛋白结合位点周围观察到峰值形状。我们描述了ChIP-ChIP过程，并提出了ChIP-ChIP数据的概率模型。然后，我们提出了一种基于模型的方法来识别峰的形状，以检测蛋白结合位点。我们还研究了非参数核平滑方法中的带宽问题。 引用于三文件 MSC公司： 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析 92C40型 生物化学、分子生物学 62G07年 密度估算 关键词：基因组;峰值检测;蛋白质结合位点;超声波作用;截断三角形模型 软件：平铺贴图;形状记忆合金 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{M.Zheng}等人，《生物计量学》63，第3期，787--796（2007；Zbl 1146.62357） 全文： 内政部 链接 参考文献： [1] Buck，Chipotle:一个用于分析芯片芯片数据的用户友好工具，《基因组生物学》6 pp R97–（2005）·doi:10.1186/gb-2005-6-11-r97 [2] Dudoit，S.Yang，Y.Callow，M.Speed，T.2000在复制的cdna微阵列实验中识别差异表达基因的统计方法·Zbl 1004.62088号 [3] Glynn，酿酒酵母中粘蛋白复合物的全基因组图谱，《公共科学图书馆生物学2》（E259）第1325页–（2004） [4] Ji，Tilemap:创建平铺阵列杂交的染色体图，生物信息学21 pp 3629–（2005）·doi:10.1093/bioinformatics/bti593 [5] Kim，人类基因组中活性启动子的高分辨率图谱，《自然》436第876页–（2005）·doi:10.1038/nature03877 [6] Li，用于分析基因组拼接阵列芯片芯片实验的隐马尔可夫模型及其在p53结合序列中的应用，生物信息学21 pp i274–（2005）·doi:10.1093/bioinformatics/bti1046 [7] 洛克哈特，通过杂交到高密度寡核苷酸阵列的表达监测，《自然生物技术》14页1675–（1996）·doi:10.1038/nbt1296-1675 [8] Ren，DNA结合蛋白的全基因组定位和功能，《科学》290页2306–（2000）·doi:10.1126/science.290.5500.2306 [9] 维特金，《图像理解》第79页–（1984） 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。它的项目与zbMATH标识符启发式匹配，并且可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。