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多类别结果关联分析的广义综合方法:应用于结直肠癌和吸烟的肿瘤序列研究。 (英语) Zbl 1514.62287号

摘要:癌症是一种异质性疾病,测序和组学技术的快速发展使研究人员能够全面描述肿瘤的特征。这激发了人们对研究风险因素如何与各种肿瘤异质性特征相关的浓厚兴趣。癌症预防研究II(CPS-II)队列是最大的前瞻性研究之一,对于阐明癌症与风险因素之间的关系特别有价值。在本文中,我们研究了吸烟与靶向测序获得的新型大肠肿瘤标记物的相关性。然而,由于成本和后勤困难,只能对有限数量的肿瘤进行检测,这限制了我们研究这些关联的能力。同时,有广泛的研究用于评估吸烟与总体癌症风险的关系,并建立了结直肠癌标志物。重要的是,这些摘要信息可以从文献中获得。通过将这些总结信息与具有适当约束的感兴趣参数联系起来,我们为具有肿瘤特征的结果的多体logistic回归模型开发了一种广义集成方法。该方法在缩小参数搜索空间的约束下,通过最大化个体级肿瘤数据和外部摘要信息的联合似然来提高效率。我们将所提出的方法应用于CPS-II数据,并确定吸烟与结直肠癌风险之间的关系,这种关系因APC和RNF43基因的突变状态不同而不同,而这两者都不是仅通过CPS-II个人数据的常规分析确定的。这些结果有助于更好地了解吸烟在结直肠癌病因中的作用。对于本文,可以在线获取。

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62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
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