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福格尔（F.Fogel）。;R.杰纳顿。;巴赫，F。;阿斯普雷蒙特。

置换问题的凸松弛。 （英语） Zbl 1338.90336号

SIAM J.矩阵分析。申请。 36，第4期，1465-1488（2015）.
摘要：序列化旨在使用未排序的成对相似信息重建变量之间的线性顺序。例如，它在考古学和霰弹枪基因测序中有直接的应用。我们通过证明相似矩阵上的序列和组合2-SUM问题之间的等价性，将序列写成一个优化问题（2-SUM是置换上的二次最小化问题）。在无噪声情况下，可以用谱算法精确地解决序列问题，并且我们推导了2-SUM的几个凸松弛，以提高序列解在噪声环境中的鲁棒性。这些凸松弛也允许我们对解施加结构约束，从而解决半监督序列问题。我们推导了其中一些松弛的新近似界，并对考古数据、马尔可夫链和鸟枪基因测序数据中的DNA组装进行了数值实验。

引用于10文件

理学硕士：

90C27型 组合优化
90C25型 凸面编程
92D20型 蛋白质序列，DNA序列
06A07年 偏序集的组合数学

关键词：

系列化;C1P公司;凸松弛;二次指派问题;鸟枪DNA测序

软件：

莫塞克
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{F.Fogel}等人，SIAM J.矩阵分析。申请。36，第4号，1465-1488（2015；Zbl 1338.90336）
全文： 内政部 arXiv公司

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