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Glazier-Graner-Hogeweg模型中的空间限制有丝分裂。 (英语) Zbl 1370.92044号

概述:Glazier-Graner-Hogeweg(GGH)模型是一个细胞自动机框架,用于表示细胞系统的时间演化,具有吸引力,因为与许多其他基于单个细胞的模型不同,它动态模拟细胞形状和大小的变化。这种建模框架已经得到了一定程度的推广,但文献中对如何最好地表示这种行为还没有达成共识。此外,大多数以增殖为特征的已发布GGH模型实现都是为了模拟有丝分裂很重要的特定生物情况,但没有分析这些增殖例程如何在基本层面上运行。这里,提出了GGH模型的一种增殖方法,该方法使用不同的细胞表型来区分进入或刚刚离开细胞周期有丝分裂期的细胞,并证明可以在宏观尺度上正确预测逻辑生长(根据实验证据)。比较在模型模拟和广义logistic增长模型之间,对后者的“形状参数”进行了解释,此处使用的扩散程序显示为建模者提供了对扩散率的某种可预测控制,对于确保模型中不同细胞行为之间的时间一致性很重要。所有结果都被发现对包含活性细胞运动不敏感。还讨论了这些模拟增殖测定对细胞生物学问题的影响。

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92立方37 细胞生物学
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