×

贝叶斯进化分析与BEAST。 (英语) Zbl 1321.92022号

剑桥:剑桥大学出版社(ISBN 978-1-107-01965-2/hbk;978-1-139-09511-2/电子书)。xii,第249页。(2015).
出版商描述:系统发育分析中使用的模型是什么,以及使用马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法进行贝叶斯进化分析中到底涉及什么?如何选择和应用这些模型,哪些参数化和先验是有意义的,以及当出现问题时如何诊断贝叶斯MCMC?这些只是贝叶斯进化论方法综合概述中回答的几个问题。
本实用指南:
–解决该领域的理论问题
–建议如何准备和执行系统发育分析
–帮助解释系统发育分析和可视化
–描述软件架构
–帮助开发BEAST 2.2扩展,以进一步扩展这些模型。
附带一个提供示例文件和教程的网站(http://beast2.org/)在BEAST 2中应用最新的系统发育模型的一站式参考将为所有用户提供基本指导,从使用系统发育工具的用户到计算生物学家和贝叶斯统计学家。

MSC公司:

92-02 与生物学有关的研究博览会(专著、调查文章)
92-04 生物相关问题的软件、源代码等
92D15型 与进化有关的问题
60J28型 连续时间Markov过程在离散状态空间中的应用
60J20型 马尔可夫链和离散时间马尔可夫过程在一般状态空间(社会流动、学习理论、工业过程等)上的应用
2015年1月62日 贝叶斯推断
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析

软件:

野兽
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: 内政部