王廷玉;西蒙·莱顿(Simon K.Layton)。;罗伦娜·巴巴。 非精确GMRES迭代和快速多极边界元松弛策略。 (英语) Zbl 1491.35350号 高级计算。数学。 48,第3号,第32号论文,第25页(2022年). 概述:边界元方法产生了可以通过多极展开加速的密集线性系统。用Krylov方法求解,这意味着在每次迭代中计算矩阵-向量乘积时都会有一定的误差,精度由展开顺序控制,\(p)。我们利用Krylov迭代的一个独特性质,即在收敛过程中矩阵-向量乘积的精度较低,并提出了一种基于逐步递减的松弛策略。在放松Krylov迭代的广泛数值测试中,我们获得了拉普拉斯问题的1.5倍到2.3倍的加速,以及斯托克斯问题的2.7倍到3.3倍的加速。我们包括一个应用程序,用于红细胞周围的Stokes流,计算多达64个细胞,问题大小高达131k个边界元素和近400k个未知数。这项研究是在六核CPU上使用内部多线程C++代码完成的。该代码在其版本控制库中可用,https://github.com/barbaragroup/fmm-bem-relaxed(网址:https://github.com/barbaragroup/fmm-bem-relaxed),我们共享所有结果的再现性包https://github.com/barbagroup/不准确-gmres/. MSC公司: 35问题35 与流体力学相关的PDE 60年第35季度 与光学和电磁理论相关的PDE 76D07型 斯托克斯和相关(Oseen等)流量 76Z05个 生理流 78A30型 静电和磁力静力学 35J05型 拉普拉斯算子、亥姆霍兹方程(约化波动方程)、泊松方程 45英镑 弗雷德霍姆积分方程 65号38 偏微分方程边值问题的边界元方法 65号35 偏微分方程边值问题的谱、配置及相关方法 65英尺10英寸 线性系统的迭代数值方法 65天32分 数值求积和体积公式 78M16型 多极方法在光学和电磁理论问题中的应用 92立方35 生理流量 关键词:边界积分方程;边界元法;配置法;快速多极子;迭代求解器;Krylov方法;斯托克斯流 软件:示例(exafmm);fmm-bem-松弛 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{T.Wang}等人,高级计算。数学。48,第3号,第32号论文,第25页(2022年;Zbl 1491.35350) 全文: 内政部 arXiv公司 参考文献: [1] Appel,AW,《多体仿真的高效程序》,SIAM J.Sci。统计计算。,6, 1, 85-103 (1985) ·doi:10.1137/0906008 [2] 巴恩斯,J。;Hut,P.,一种分层的(O(N\logn)O(N\)logn)力计算算法,《自然》,32446-449(1986)·doi:10.1038/324446a0 [3] Bouras,A.,Frayssé,V.:Krylov方法的不精确矩阵向量乘积的松弛策略。CERFACS TR0PA000015欧洲科学计算研究和高级培训中心(2000年)·Zbl 1075.65041号 [4] Bouras,A。;Frayssé,V.,解线性系统的Krylov方法中的不精确矩阵向量积:松弛策略,SIAM J.矩阵分析应用,26,3,660-678(2005)·Zbl 1075.65041号 ·doi:10.1137/S0895479801384743 [5] 布雷比亚,C。;Dominguez,I.,《边界元素入门教程》(1992年),美国:WIT出版社,美国·兹比尔0780.73002 [6] Cheng,H。;Greengard,L。;Rokhlin,V.,三维快速自适应多极算法,J.Compute。物理。,155, 468-498 (1999) ·Zbl 0937.65126号 ·doi:10.1006/jcph.1999.6355 [7] Van den Eshof,J。;Sleijpen,G.,线性系统的非精确Krylov子空间方法,SIAM J.矩阵分析应用,26,1,125-153(2004)·Zbl 1079.65036号 ·doi:10.1137/S089547979802403459 [8] 埃文斯,E。;Fung,YC,《红细胞几何形状的改进测量》,《微血管研究》,4,4,335-347(1972)·doi:10.1016/0026-2862(72)90069-6 [9] Fata,SN,《势理论中三维边界积分的显式表达式》,国际期刊《数值方法》。工程,78,32-47(2009)·Zbl 1183.65155号 ·doi:10.1002/nme.2472 [10] Fata,SN,线性弹性中三维边界积分的显式表达式,J.Comp。应用程序。数学,235,4480-4495(2011)·Zbl 1387.74122号 ·doi:10.1016/j.cam.2011.04.017 [11] 费多索夫,DA;Caswell,B。;苏雷什,S。;Karniadakis,GE,量化微循环中恶性疟原虫活化红细胞的生物物理特性,Proc。国家。阿卡德。科学。,108, 1, 35-39 (2011) ·doi:10.1073/pnas.1009492108 [12] 弗伦德,JB,流动血细胞的数值模拟,流体力学年鉴。,46, 67-95 (2014) ·兹比尔1297.76198 ·doi:10.1146/安努列夫-流体-010313-141349 [13] Greengard,L.,《粒子系统中势场的快速评估》(1987),剑桥:麻省理工学院出版社,剑桥·Zbl 1001.31500号 [14] Greengard,L。;Rokhlin,V.,《粒子模拟的快速算法》,J.Compute。物理。,73, 2, 325-348 (1987) ·Zbl 0629.65005号 ·doi:10.1016/0021-9991(87)90140-9 [15] 赫斯,JL;Smith,A.,任意物体的势流计算,航空航天科学进展,81-138(1967)·Zbl 0204.25602号 ·doi:10.1016/0376-0421(67)90003-6 [16] 刘,Y。;Nishimura,N.,《潜在问题的快速多极边界元法:教程》,《边界元工程分析》,30,5,371-381(2006)·Zbl 1187.65134号 ·doi:10.1016/j.enganabound.2005.11.006 [17] Nishimura,N.,快速多极加速边界积分方程方法,应用。机械。修订版,55、4、299-324(2002)·doi:10.1115/1.1482087 [18] Roache,P.J.:《计算科学与工程中的验证与确认》,Hermosa Albuquerque(1998) [19] 萨阿德,Y。;Schultz,M.,GMRES:求解非对称线性系统的广义最小残差算法,SIAM J.Sci。统计计算。,7, 856-869 (1986) ·Zbl 0599.65018号 ·doi:10.1137/0907058 [20] 西蒙西尼,V。;Szyld,D.,《不精确Krylov子空间方法理论及其在科学计算中的应用》,SIAM J.Sci。计算。,25, 2, 454-477 (2003) ·Zbl 1048.65032号 ·doi:10.1137/S1064827502406415 [21] Wang,T.,Layton,S.K.,Barba,L.A.:不精确GMRES:FMM缩放无花果。doi:10.6084/m9图3100816.v1(2016) [22] Wang,T.,Layton,S.K.,Barba,L.A.:不精确GMRES:拉普拉斯方程。doi:10.6084/m9图3100882.v2(2016) [23] Wang,T.,Layton,S.K.,Barba,L.A.:不精确的GMRES:红细胞无花果。doi:10.6084/m9图3100891.v1(2016) [24] Wang,T.,Layton,S.K.,Barba,L.A.:不精确GMRES:斯托克斯方程。doi:10.6084/m9图3100885.v3(2016) [25] 白色,CA;Head-Gordon,M.,《快速多极方法计算中围绕四次角动量势垒旋转》,J.Chem。物理。,1051215061-5067(1996年)·doi:10.1063/1.472369 [26] Yokota,R.,《基于双树遍历的多核架构FMM》,《算法与计算技术杂志》,2013年第7期,第3301-324页·doi:10.1260/1748-3018.7.3.301 [27] Yokota,R.,Barba,L.A.:作为exascale系统的卓越算法,一种调谐和可扩展的快速多极子方法。国际期刊高性能计算。适用。2012年1月24日在线发布http://doi.org/fzgqgmarXiv上的预印本:1106.2176(2012) [28] 横田,R。;巴丹,JP;Knepley,MG;路易斯安那州巴巴市;Hamada,T.,《生物分子静电学》,在多达512个GPU和10亿未知量上使用快速多极边界元法,计算。物理学。Comm.,182,6,1271-1283(2011)·Zbl 1259.78044号 ·doi:10.1016/j.cpc.2011.02.013 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。它的项目与zbMATH标识符启发式匹配,并且可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。