本山由一;川崎吉美;Izumi Mochizuki;岩本,晴;Ichinose,Hayato先生;武藤浩史 数据分析软件框架2DMAT及其在二维材料结构实验测量中的应用。 (英语) Zbl 07682142号 计算。物理学。Commun公司。 280,文章ID 108465,11 p.(2022). 摘要:开发了一个用于二维材料结构实验测量的开源数据分析框架。提供了五种分析方法:(i)Nelder-Mead优化,(ii)网格搜索,(iii)贝叶斯优化,(iv)副本交换蒙特卡罗方法,以及(v)种群归一化蒙特卡罗法。方法(ii)到(v)通过并行计算实现,这不仅对个人计算机有效,对超级计算机也有效。当前版本的2DMAT适用于全反射高能正电子衍射(TRHEPD)、表面X射线衍射(SXRD)和低能电子衍射(LEED)实验,方法是安装相应的正向问题求解器,从给定的原子位置数据集生成衍射强度数据。分析方法通用,也可应用于其他实验和问题。 引用于1文件 MSC公司: 68倍 计算机科学 78至XX 光学、电磁理论 关键词:实验测量的数据分析;贝叶斯优化;副本交换蒙特卡罗方法;人口退火蒙特卡罗方法;二维材料;全反射高能正电子衍射;表面x射线衍射;低能电子衍射 软件:托姆利;2DMAT公司;sim-trhepd瑞德西韦;PHYSBO公司;TOML公司;JStatCom公司;sxrd计算;数字Py;量子浓缩咖啡;科学Py PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{Y.Motoyama}等人,计算。物理学。Commun公司。280,文章ID 108465,11 p.(2022;Zbl 07682142) 全文: 内政部 arXiv公司 OA许可证 参考文献: [1] Hugenschmidt,C.,《冲浪科学》。代表,71,547(2016) [2] Y.Fukaya。;川崎,A。;Ichimiya,A。;Hyodo,T.,J.物理学。D、 52,第013002条pp.(2019) [3] Fukaya,Y.(Matsuda,I.,《单原子二维层》,单原子二维层数,微纳米技术(2019)),第75-111页 [4] Feidenhans l,R.,《冲浪科学》。代表,10,105(1989) [5] 塔吉克里,H.,Jpn。J.应用。物理。,59,第020503条pp.(2020) [6] 霍夫,M.A.V。;莫里茨,W。;超过,H。;Rous,P。;Wander,A。;Barbieri,A。;马泰瑟,N。;斯塔克,美国。;Somorjai,G.A.,《冲浪科学》。代表,19,191(1993) [7] 田中,K。;Hoshi,T。;Mochizuki,I。;Hanada,T。;Ichimiya,A。;Hyodo,T.,《物理学学报》。波兰。A、 137188(2020) [8] 田中,K。;Mochizuki,我。;Hanada,T。;Ichimiya,A。;Hyodo,T。;Hoshi,T.,JJAP Conf.Series(2022),出版中。预打印: [9] Hoshi,T。;坂田,D。;Oie,S。;Mochizuki,I。;田中,S。;Hyodo,T。;K.Hukushima,计算。物理学。社区。,271,第108186条pp.(2022) [10] Nelder,J.A。;米德·R·计算。J.,7308(1965)·Zbl 0229.65053号 [11] Wright,M.(Griffiths,D.;Watson,G.,数值分析(1996),Addison-Wesley),191-208 [12] 拉斯穆森,C.E。;Williams,C.K.I.,《机器学习的高斯过程、自适应计算和机器学习》(2005),麻省理工学院出版社 [13] K.Hukushima。;内莫托,K.,J.Phys。Soc.Jpn.公司。,65, 1604 (1996) [14] K.Hukushima。;Iba,Y.,AIP咨询程序。,690, 1604 (2003) [15] Dalcín,L。;巴兹·R。;Storti,M.,J.并行分布计算。,65, 1108 (2005) [16] Dalcín,L。;巴兹·R。;斯托蒂,M。;D'Elia,J.,J.平行分布计算。,68, 655 (2008) [17] 达尔星,L.D。;帕斯,R.R。;Kler,宾夕法尼亚州。;Cosimo,A.,水资源高级。,34, 1124 (2011) [18] 达尔星。;Fang,Y.-L.L.,计算。科学。工程师,23,47(2021) [19] Scipy公司 [20] PHYSBO公司 [21] Motoyama,Y。;Tamura,R。;Yoshimi,K。;Terayama,K。;上野,T。;Tsuda,K.,计算。物理学。社区。,278,第108405条pp.(2022)·Zbl 07680575号 [22] Neal,R.M.,统计计算。,11, 125 (2001) [23] 阿纳达,M。;Nakanishi-Ohno,Y。;冈田,M。;木村,T。;Wakabayashi,Y.,J.应用。结晶器。,50, 1611 (2017) [24] Nagai,K。;阿纳达,M。;Nakanishi-Ohno,Y。;冈田,M。;Wakabayashi,Y.,J.应用。结晶器。,53, 387 (2020) [25] sim-trepd-reed系统 [26] Hanada,T。;Daimon,H。;Ino,S.,物理。B版,51,第13320条pp.(1995) [27] Hanada,T。;元山,Y。;Yoshimi,K。;Hoshi,T.,计算机。物理学。社区。,277,第108371条pp.(2022) [28] Mochizuki,I。;Ariga,H。;Y.Fukaya。;Wada,K。;Maekawa,M。;川崎,A。;Shidara,T。;浅仓,K。;Hyodo,T.,《物理学》。化学。化学。物理。,18, 7085 (2016) [29] Endo,Y。;Y.Fukaya。;Mochizuki,I。;Takayama,A。;Hyodo,T。;长谷川,S.,Carbon,157857(2020) [30] sxrdcalc公司 [31] 沃格利,W。;秋本,K。;青山,T。;苏米塔尼,K。;Nakatani,S。;塔吉克,H。;高桥,T。;Hisada,Y。;Mukainakano,S。;Zhang,X.,申请。冲浪。科学。,252, 5259 (2006) [32] ANA-ROD公司 [33] Vlieg,E.,J.应用。结晶器。,33, 401 (2000) [34] CTR结构 [35] Hirahara,T。;埃雷梅耶夫,S。;Shirasawa,T。;O.尤马。;Kubo,T.等人。;Nakanishi,R。;秋山,R。;Takayama,A。;哈吉里,T。;Ideta,S.、Nano Lett.、。,17, 3493 (2017) [36] Tong,S.Y.,《冲浪科学》。,457,L432(2000) [37] Wada,K。;Shirasawa,T。;Mochizuki,I。;Fujinami,M。;Maekawa,M。;川崎,A。;高桥,T。;Hyodo,T.,E-J.冲浪科学。纳米技术。,16, 313 (2018) [38] Rosenbrock,H.H.,计算机。J.,3175(1960) [39] Ackley,D.H.,《基因爬山的连接主义机器》(1987),Kluwer学术出版社:Kluwer-学术出版社波士顿 [40] Himmelblau,D.,《应用非线性规划》(1972),McGraw-Hill·Zbl 0241.90051号 [41] Kohashi,H。;岩本,H。;Fukaya,T。;山本,Y。;Hoshi,T.,JSIAM Lett。,14, 13 (2022) ·Zbl 1509.65153号 [42] TOML公司 [43] 托姆利 [44] Numpy公司 [45] Motoyama,Y。;Yoshimi,K。;加藤,T。;托多·S(2022) [46] Ichimiya,A.,《冲浪科学》。莱特。,192,L893(1987) [47] Shirasawa,T。;瑞穗,S。;Tochihara,H.,《冲浪科学》。,600, 815 (2006) [48] Quantum浓缩咖啡 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。