贾恩·朱恩·布萨。;贾恩·布萨;Shura Hayryan;胡金坤;吴明霞 CAVE-CL:一个OpenCL版本的包,用于检测和定量分析重叠球系统中的内腔:应用于蛋白质。 (英语) Zbl 1344.92005年 计算。物理。Commun公司。 190, 224-227 (2015). 摘要:在这里,我们展示了我们早期出版的修订版和新改写版洞穴包[第二作者等人,同上,181,第12号,2116–2125(2010;Zbl 1216.92034号)]它最初是写在FORTRAN公司。该包已在中重写C类语言,该算法已被并行化,并使用OpenCL实现。这使得程序可以方便地在带有图形处理单元(GPU)的平台上运行。改进还包括对原始算法的一些修改/优化。代码的性能得到了很大的改进。一个名为输入_结构已经添加了,这有助于用户使数据输入和转换更加容易和通用。 MSC公司: 92-04 生物相关问题的软件、源代码等 92C40型 生物化学、分子生物学 92D20型 蛋白质序列,DNA序列 92C05型 生物物理学 关键词:蛋白质;腔;开放运算语言 引文:Zbl 1216.92034号 软件:CAVE-CL型;洞穴;开放运算语言 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{J.Buša jun.}等人,计算。物理。Commun公司。190、224--227(2015;Zbl 1344.92005) 全文: 内政部