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CAVE-CL:一个OpenCL版本的包,用于检测和定量分析重叠球系统中的内腔:应用于蛋白质。 (英语) Zbl 1344.92005年

摘要:在这里,我们展示了我们早期出版的修订版和新改写版洞穴包[第二作者等人,同上,181,第12号,2116–2125(2010;Zbl 1216.92034号)]它最初是写在FORTRAN公司。该包已在中重写C类语言,该算法已被并行化,并使用OpenCL实现。这使得程序可以方便地在带有图形处理单元(GPU)的平台上运行。改进还包括对原始算法的一些修改/优化。代码的性能得到了很大的改进。一个名为输入_结构已经添加了,这有助于用户使数据输入和转换更加容易和通用。

MSC公司:

92-04 生物相关问题的软件、源代码等
92C40型 生物化学、分子生物学
92D20型 蛋白质序列,DNA序列
92C05型 生物物理学
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全文: 内政部