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高桥苏姬；Keiji Horita；佐托鲁·霍索诺；伊藤、智多智；东山英彦

通过动态规划方法探索类似蛋白质序列的专用计算机。 （英语） Zbl 1196.90122号

计算。物理学。公社。 157，编号1，1-8（2004）.
摘要：我们通过动态编程方法构建了一台用于探索相似蛋白质序列的专用计算机BIOLER-1（BIOLogical sequence explorER）。它可以计算两个氨基酸少于1024个的蛋白质序列之间的完全相似性。我们将该系统集成在Altera公司的PLD（可编程逻辑器件）芯片APEX EP20K300EQC240-1（300000个门）上。它安装在连接到个人计算机的32位PCI（外围组件互连）总线板上。其性能为3564 MIPS（每秒百万条指令），是1.8 GHz Pentium4个人电脑的三倍。BIOLER-1向我们展示了在生物序列分析领域的有效性。

MSC公司：

90立方厘米 动态编程
92-04 生物相关问题的软件、源代码等
92D15型 与进化有关的问题

软件：

拜勒-1；角质层-4
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{T.Sugie}等人，计算。物理学。Commun公司。157，编号1，1--8（2004；Zbl 1196.90122）
全文： 内政部

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