大卫·皮尔曼。;凯斯(David A.Case)。;詹姆斯·W·考德威尔。;威尔逊·S·罗斯。;托马斯·E·III·契坦;史蒂夫·德博尔特;大卫·弗格森;乔治·塞贝尔;彼得·科尔曼 AMBER是一套计算机程序,用于应用分子力学、简正模式分析、分子动力学和自由能计算来模拟分子的结构和能量特性。 (英语) 兹伯利0886.92035 计算。物理。公社。 91,编号1-3,1-41(1995). 摘要:我们描述了AMBER计算机程序包的发展、当前特点和未来发展的一些方向。这个软件包已经从一个用于辅助建模和能量优化的程序发展到一组程序,其中包含了现代计算化学的许多强大工具——分子动力学和自由能计算。 引用于15文件 MSC公司: 92E99型 化学 92-04 生物相关问题的软件、源代码等 关键词:分子动力学;分子力学;正常模式;自由能;计算机模拟 软件:琥珀色 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{D.A.Pearlman}等人,计算。物理。Commun公司。91,编号1--3,1--41(1995;Zbl 0886.92035) 全文: 内政部 参考文献: [1] Warshel,A。;Lifson,S.,J.化学。物理。,53, 582-594 (1968) [2] Gelin,B.,哈佛大学博士论文(1976年) [3] 韦纳,P.K。;科尔曼,P.A.,J.Compute。化学,2287-303(1981) [4] 兰里奇,R。;费林,T.E。;I.D.昆茨。;Connolly,M.L.,《科学》,211661-666(1981) [5] Dearing,A.,CHEM(1980-1981),加利福尼亚大学:加利福尼亚大学旧金山分校,于 [6] 费林,T.E。;黄,C.C。;贾维斯,L.E。;Langridge,R.,MIDAS:分子交互显示与模拟(1985),加利福尼亚大学:加利福尼亚大学旧金山分校 [7] Weiner,S.J。;科尔曼,P.A。;凯斯,D.A。;加利福尼亚州辛格。;吉奥,C。;阿拉戈纳,G。;普罗菲塔,S。;韦纳,P.,J.Amer。化学。Soc.,106765-784(1984年) [8] Weiner,S.J。;科尔曼,P.A。;Nguyen,D.T。;Case,D.A.,J.计算。化学。,7, 230-252 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