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ARVO:一个Fortran包,用于通过解析方程计算溶剂可及表面积和重叠球体的排除体积。 (英语) Zbl 1196.92001号

小结:在计算蛋白质的溶剂化能、水合作用、药物结合、分子对接等方面,高效准确的算法对于计算溶剂可及表面积和大分子的排除体积至关重要。我们提出了一个基于新的精确分析方法的Fortran软件包,用于计算重叠球体的体积和表面积。在这个过程中,表面积和体积表示为封闭区域上的第二类曲面积分。利用赤平投影,将曲面积分转化为二重积分之和,再将二重积分转化为曲线积分。还介绍了MPI Fortran版本。该软件包还可用于计算连续渗流模型的渗流概率。

MSC公司:

2004年2月 生物相关问题的软件、源代码等
92C05型 生物物理学
92C40型 生物化学、分子生物学
60K35型 相互作用的随机过程;统计力学类型模型;渗流理论
92-08 生物学相关问题的计算方法
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: 内政部

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