×

心脏电生理逆向问题的PDE-aware深度学习。 (英语) Zbl 1497.65212号

本文解决了一个涉及深度学习(DL)的心电图逆问题。更详细地说:“这项工作的目标是展示DL技术和基于物理的正则化之间的集成如何使人们能够准确地解决心电图的逆问题,即使是在小数据范围内。”(第B608页)。在第二节中,作者介绍了一种基于物理知识的深度学习模型及其一般结构和主要特征。接下来,给出了如何生成数据的描述。此外,他们还研究了心电图的正向问题以及通过有限元方法解决的相应假设。然后,他们进行模型降阶,以实现有效的计算。在本节的最后,给出了有关神经网络体系结构的详细信息。在下一节中,他们将根据合成数据进行几次数值模拟。我们想提及的是,模拟是在固定的几何设置下进行的,例如,考虑了不同的初始激活模式。进一步,他们分析了相对误差。在第4节中,研究了之前的结果,即数值模拟等。论文以总结结束。

MSC公司:

65N21型 含偏微分方程边值问题反问题的数值方法
68T05型 人工智能中的学习和自适应系统
65N30型 含偏微分方程边值问题的有限元、Rayleigh-Ritz和Galerkin方法
92秒20 生物研究、人工生命和相关主题中的神经网络
92年第35季度 与生物、化学和其他自然科学相关的PDE
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: 内政部

参考文献:

[1] R.R.Aliev和A.V.Panfilov,心脏兴奋的简单双变量模型,混沌孤子分形,7(1996),第293-301页。
[2] T.Bacoyannis、J.Krebs、N.Cedilnik、H.Cochet和M.Sermesant,用于时空相关性和成像信息数据驱动集成的ECGI深度学习公式,心脏功能成像和建模国际会议,纽约斯普林格,2019年,第20-28页。
[3] L.R.Bear、L.K.Cheng、I.J.LeGrice、G.B.Sands、N.A.Lever、D.J.Paterson和B.H.Smaill,心电图的正向问题:它解决了吗?,《循环心律失常电生理学》,8(2015),第677-684页。
[4] M.Boulakia、S.Cazeau、M.A.Fernández、J.-F.Gerbeau和N.Zemzemi,心电图的数学建模:数值研究,生物医学工程,第38期(2010年),第1071-1097页。
[5] K.Bujnarowski、P.Bonizzi、M.Cluitmans、R.Peeters和J.Karel,基于CT-扫描神经网络从ECG记录重建心脏表面电位,计算机。《心脏病学》,47(2020)。
[6] S.Butterworth等人,《滤波器放大器理论》,《无线工程师》,第7期(1930年),第536-541页。
[7] S.Cai,Z.Wang,L.Lu,T.A.Zaki,和G.E.Karniadakis,DeepM&Mnet:基于神经网络算子逼近推断电对流多物理场,预印本,https://arxiv.org/abs/2009.12935, 2020. ·Zbl 07513856号
[8] Y.Choi和K.Carlberg,用于非线性模型简化的时空最小二乘Petrov-Galerkin投影,SIAM J.Sci。计算。,41(2019年),第A26-A58页·Zbl 1405.65140号
[9] M.Cluitmans、D.H.Brooks、R.MacLeod、O.Doássel、M.S.Guillem、P.M.van Dam、J.Svehlikova、B.He、J.Sapp、L.Wang等人,《心电图成像的验证和机遇:从技术成就到临床应用》,《生理学前沿》,9(2018),1305。
[10] M.J.Cluitmans、P.Bonizzi、J.M.Karel、M.Das、B.L.Kietselaer、M.M.de Jong、F.W.Prinzen、R.L.Peeters、R.L Westra和P.G.Volders,《心电图成像的体内验证》,JACC临床电生理学,3(2017年),第232-242页。
[11] M.J.M.Cluitmans、R.Peeters、R.Westra和P.Volders,《心脏电活动的无创重建:当前方法、应用和挑战的更新》,《荷兰心脏杂志》,23(2015),第301-311页。
[12] J.Coll-Font和D.H.Brooks,《从体表电位图和心电图追踪心脏位置》,《前沿生理学》,9(2018),1727。
[13] P.Colli Franzone和L.F.Pavarino,计算心电反应扩散系统的并行求解器,数学。模型方法应用。科学。,14(2004),第883-911页·Zbl 1068.92024号
[14] J.W.Cooley和J.W.Tukey,复数傅里叶级数的机器计算算法,数学。公司。,19(1965年),第297-301页·Zbl 0127.09002号
[15] N.Dal Santo、S.Deparis和L.Pegolotti,通过简化基础和神经网络对参数化PDE进行数据驱动近似,J.Compute。物理。,416 (2020), 109550. ·Zbl 1437.65224号
[16] T.Dozat,将Nesterov Momentum纳入Adam,http://cs229.stanford.edu/proj2015/054_report.pdf, 2016.
[17] O.El B’charri,R.Latif,K.Elmansouri,A.Abenaou和W.Jenkal,基于双树小波变换阈值调谐的心电信号去噪评估,生物医学工程在线,16(2017),26。
[18] A.Ferrer、R.Sebastiaín、D.Sanchez-Quintana、J.F.Rodriguez、E.J.Godoy、L.Martinez和J.Saiz,心房激活模拟用人体心房和躯干的详细解剖和电生理模型,PloS ONE,10(2015),e0141573。
[19] P.C.Franzone、L.F.Pavarino和S.Scacchi,《数学心脏电生理学》,MS&A 13,Springer,纽约,2014年·Zbl 1318.92002号
[20] S.Giffard-Roisin、T.Jackson、L.Fovargue、J.Lee、H.Delingette、R.Razavi、N.Ayache和M.Sermesant,《从体表电位映射中实现心脏电生理模型的无创个性化》,IEEE Trans。生物医学工程,64(2016),第2206-2218页。
[21] E.Grandelius和K.H.Karlsen,心脏Bidomain模型和均质化,预印本,https://arxiv.org/abs/1811.07524, 2018. ·Zbl 1423.35200号
[22] L.Green、B.Taccardi、P.Ershler和R.Lux,《心外膜电位标测》。传导介质对等电位和等时线分布的影响。,《循环》,84(1991),第2513-2521页。
[23] N.Halko、P.-G.Martinsson和J.A.Tropp,《发现随机结构:构造近似矩阵分解的概率算法》,SIAM Rev.,53(2011),第217-288页·Zbl 1269.65043号
[24] J.S.Hesthaven和S.Ubbiali,使用神经网络对非线性问题进行非侵入式降阶建模,J.Compute。物理。,363(2018),第55-78页·Zbl 1398.65330号
[25] S.Hochreiter和J.Schmidhuber,长短期记忆,神经计算。,9(1997),第1735-1780页。
[26] C.Hoogendoorn、N.Duchateau、D.Sanchez-Quintana、T.Whitmarsh、F.M.Sukno、M.De Craene、K.Lekadir和A.F.Frangi,多层螺旋CT人体心脏高分辨率图谱和统计模型,IEEE Trans。《医学成像》,32(2012),第28-44页。
[27] A.Intini、R.N.Goldstein、P.Jia、C.Ramanathan、K.Ryu、B.Giannattasio、R.Gilkeson、B.S.Stambler、P.Brugada、W.G.Stevenson等人,心电图成像(ECGI),一种用于绘制年轻运动员局灶性左室性心动过速的新型诊断模式,《心律》,2(2005),第1250-1252页。
[28] E.M.Izhikevich和R.FitzHugh,FitzHugh-Nagumo模型,学术媒体,1(2006),1349。
[29] M.Kachuee、S.Fazeli和M.Sarrafzadeh,《心电图心跳分类:深度可转换表示法》,《国际医疗信息学会议论文集》,IEEE,2018年,第443-444页。
[30] A.Karoui、L.Bear、P.Migerditichan和N.Zemzemi,《利用体外和电子数据解决心电图成像逆问题的十五种算法评估》,《前沿生理学》,9(2018),1708。
[31] G.Kutyniok、P.Petersen、M.Raslan和R.Schneider,深度神经网络和参数PDE的理论分析,预印本,https://arxiv.org/abs/1904.00377, 2019. ·Zbl 07493717号
[32] L.Lu,P.Jin,和G.E.Karniadakis,Deeponet:基于算子的通用逼近定理学习非线性算子以识别微分方程,预印本,https://arxiv.org/abs/1910.03193, 2019.
[33] L.Lu、Y.Shin、Y.Su和G.E.Karniadakis,《死亡的Relu和初始化:理论和数值示例》,预印本,https://arxiv.org/abs/1903.06733, 2019. ·Zbl 1507.68248号
[34] B.Messinger-Rapport和Y.Rudy,真实心搏几何结构中心外膜电位的无创恢复。正常窦性心律,《循环研究》,66(1990),第1023-1039页。
[35] J.Obergassel、I.Cazzoli、S.Guarguagli、V.D.Nagarajan和S.Ernst,《从左心耳的心内膜方面对心外膜室性早搏进行无创三维标测和消融》,JACC病例报告,2(2020),第1776-1780页,https://doi.org/10.1016/j.jacas.2020.07.045。
[36] H.S.Oster、B.Taccardi、R.L.Lux、P.R.Ershler和Y.Rudy,《无创心电图成像:心外膜电位、心电图和等时线的重建以及单个和多个心电事件的定位》,《循环》,96(1997),第1012-1024页。
[37] L.E.Payne,偏微分方程中的不当问题,SIAM,费城,1975年·Zbl 0302.35003号
[38] R.Piersanti,P.C.Africa,M.Fedele,C.Vergara,L.Dedè,A.F.Corno和A.Quarteroni,心室和心房电生理模拟中心肌纤维建模,计算机。方法应用。机械。工程师,373(2021),113468·Zbl 1506.74211号
[39] A.Quarteroni、A.Manzoni和F.Negri,《偏微分方程的约化基方法:简介》,UNITEXT 92,Springer,纽约,2015年·Zbl 1337.65113号
[40] M.Raissi、P.Perdikaris和G.E.Karniadakis,《以物理为基础的神经网络:解决涉及非线性偏微分方程的正问题和逆问题的深度学习框架》,J.Compute。物理。,378(2019),第686-707页·Zbl 1415.68175号
[41] C.Ramanathan、R.N.Ghanem、P.Jia、K.Ryu和Y.Rudy,《心脏电生理学和心律失常的无创心电图成像》,《自然医学》,10(2004),第422-428页。
[42] C.Ramanathan和Y.Rudy,心电图成像:I.躯干不均匀性对体表心电图电位的影响,《心血管电生理学杂志》,12(2001),第229-240页。
[43] D.E.Rumelhart、G.E.Hinton和R.J.Williams,《反向传播错误的学习表征》,《自然》,323(1986),第533-536页·Zbl 1369.68284号
[44] R.Sameni、M.B.Shamsollahi、C.Jutten和G.D.Clifford,心电图去噪的非线性贝叶斯滤波框架,IEEE Trans。生物医学工程,54(2007),第2172-2185页·Zbl 1168.94440号
[45] O.Sayadi和M.B.Shamsollahi,使用改进的扩展卡尔曼滤波器结构进行ECG去噪和压缩,IEEE Trans。生物医学工程,55(2008),第2240-2248页。
[46] N.Srivastava、G.Hinton、A.Krizhevsky、I.Sutskever和R.Salakhutdinov,《辍学:防止神经网络过度拟合的简单方法》,J.Mach。学习。Res.,15(2014),第1929-1958页·Zbl 1318.68153号
[47] J.Sundnes、G.T.Lines、X.Cai、B.F.Nielsen、K.-A.Mardal和A.Tveito,《计算心脏的电活动》,第1卷,纽约斯普林格出版社,2007年·兹比尔1182.92020
[48] N.N.Tarkhanov,椭圆方程解的Cauchy问题,数学主题,7,Vch Pub,1995年·Zbl 0831.35001号
[49] A.N.Tikhonov和V.Y.Arsenin,《病态问题的解决方案》,温斯顿,纽约,1977年·Zbl 0354.65028号
[50] L.Tung,描述缺血性心肌DC电位的双域模型,麻省理工学院博士论文,1978年。
[51] D.Wang、R.M.Kirby和C.R.Johnson,基于有限元的ECG反问题解决方案的解决策略,IEEE Trans。生物医学工程,57(2009),第220-237页。
[52] L.Wang、W.Wu、Y.Chen和C.Liu,心电图逆问题的ADMM-net解决方案,《第五届系统与信息学国际会议论文集》,IEEE,2018年,第565-569页。
[53] Q.Wang、J.S.Hesthaven和D.Ray,使用人工神经网络对非定常流动进行非侵入降阶建模,并应用于燃烧问题,J.Compute。物理。,384(2019),第289-307页·Zbl 1459.76117号
[54] J.B.W.Webber,《宽范围数据的双对称对数变换》,《测量科学技术》,24(2012),027001。
[55] C.Wyndham、T.Smith、M.K.Meeran、R.Mammana、S.Levitsky和K.Rosen,左束支传导阻滞患者的心外膜激活,《循环》,61(1980),第696-703页。
[56] C.R.Wyndham、M.K.Meeran、T.Smith、A.Saxena、R.M.Engelman、S.Levitsky和K.Rosen,《无传导缺陷完整人类心脏的心外膜激活》,《循环》,59(1979),第161-168页。
[57] N.Zemzemi、C.Dobrzynski、L.Bear、M.Potse、C.Dallet、Y.Coudière、R.Dubois和J.Duchateau,躯干电导率不均一性对ECGI反问题解决方案的影响,《心脏病学会议计算论文集》,IEEE,2015年,第233-236页。
[58] M.Zihlmann、D.Perekrestenko和M.Tschannen,用于心电图分类的卷积递归神经网络,《心脏病学会议计算学报》,IEEE,2017年,第1-4页。
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。