刘嘉荣;郭波休;洪，洪 一种用于特征选择的鲁棒重新排序方法及其在基于池的GWA研究中的应用。 （英语） Zbl 1275.62076号 计算。数学。方法医学。 2013年，文章ID 860673，11 p.（2013）. 摘要：大-（p）-小-（n）数据集在现代生物医学研究中常见。为了检测两组之间的差异，传统方法将无法应用，因为在估计（t）检验中的方差时不稳定，并且AUC（接收器工作特性曲线下的面积）估计中的绑定值比例很高。微阵列（SAM）的显著性分析也可能不令人满意，因为其性能对调谐参数敏感，并且其选择也不简单。在这项工作中，我们提出了一种稳健的再库方法来克服上述困难。特别是，我们基于“等级过变量”的概念，获得了每个特征的基于等级的统计信息。然后，将“随机子集”和“重排”技术迭代应用于特征排序，并选择主要特征进行进一步研究。该方法特别适用于大（p）-小（n）数据集。此外，它对调谐参数的选择不敏感，这对于实际实现来说是一个很有吸引力的特性。基于集合的全基因组关联（GWA）研究的模拟研究和实际数据分析证明了我们的方法的有效性。 MSC公司： 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析 62H30型 分类和区分；聚类分析（统计方面） 软件：哈普洛维;PLINK公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{J.-R.Liu}等人，计算。数学。方法Med.2013，文章ID 860673，11 p.（2013；Zbl 1275.62076） 全文： 内政部 参考文献： [1] P.Cunningham，《尺寸缩减》，第91-112页，第4章，施普林格出版社，德国柏林，2008年。 [2] H.Hotelling，“将复杂的统计变量分析为主要成分”，《教育心理学杂志》，第24卷，第6期，第417-441页，1933年·doi:10.1037/h0071325 [3] I.Guyon和A.Elisseeff，“变量和特征选择简介”，《机器学习研究杂志》，第3卷，第1157-1182页，2003年·Zbl 1102.68556号 ·doi:10.1162/153244303322753616 [4] Y.Saeys、I.Inza和P.Larrañaga，“生物信息学特征选择技术综述”，《生物信息学》，第23卷，第19期，第2507-2517页，2007年·doi:10.1093/bioinformatics/btm344 [5] J.L.DeRisi、V.R.Iyer和P.O.Brown，“探索基因组尺度上基因表达的代谢和遗传控制”，《科学》，第278卷，第5338期，第680-686页，1997年·doi:10.1126/science.278.5338.680 [6] V.G.Tusher、R.Tibshirani和G.Chu，“应用于电离辐射响应的微阵列的显著性分析”，《美国国家科学院院刊》，第98卷，第9期，第5116-51212001页·2014年12月10日 ·doi:10.1073/pnas.091062498 [7] R.Breitling、P.Armengaud、A.Amtmann和P.Herzyk，“秩乘积：在重复微阵列实验中检测差异调节基因的简单而强大的新方法”，《联邦公报》，第573卷，第1-3期，第83-92页，2004年·doi:10.1016/j.fbslet.2004.07.055 [8] M.Alvo、Z.Liu、A.Williams和C.Yauk，“微阵列实验中平均值和相关性变化的测试：路径分析的应用”，BMC生物信息学，第11卷，第1期，第60条，2010年·doi:10.1186/1471-2105-11-60 [9] F.Chang和J.-C.Chen，“一种用于特征排序和选择的自适应多特征子集方法”，载于《第十五届人工智能技术与应用会议论文集》（TAAI’10），第255-262页，IEEE计算机学会，2010年11月·doi:10.1109/TAAI.2010.50 [10] G.C.Tseng和W.H.Wong，“紧密聚类：识别数据中稳定和紧密模式的基于重采样的方法”，《生物统计学》，第61卷，第1期，第10-16页，2005年·Zbl 1077.62049号 ·文件编号：10.1111/j.0006-341X.2005.031032.x [11] R.D.Cook和X.Yin，“判别分析中的降维和可视化（讨论）”，《澳大利亚和新西兰统计杂志》，第43卷，第2期，第147-199页，2001年·Zbl 0992.62056号 ·doi:10.1111/1467-842X.00164 [12] T.A.Manolio，L.L.Rodriguez，L.Brooks等人，“全基因组关联研究中合作的新模式：遗传关联信息网络”，《自然遗传学》，第39卷，第9期，第1045-1051页，2007年·doi:10.1038/ng2127 [13] M.D.Mailman、M.Feolo、Y.Jin等人，“NCBI dbGaP基因型和表型数据库”，《自然遗传学》，第39卷，第10期，第1181-1186页，2007年·doi:10.1038/ng1007-1181 [14] S.Purcell，B.Neale，K.Todd-Brown等人，“PLINK：全基因组关联和基于人群的连锁分析的工具集”，《美国人类遗传学杂志》，第81卷，第3期，第559-575页，2007年·doi:10.1086/519795 [15] P.H.Kuo、J.R.Liu、M.K.Lu、R.B.Lu和H.Hung，“使用DNA池对双相情感障碍进行全基因组关联研究”，《亚洲精神病学杂志》，第4卷，增补1，第S38页，2011年。 [16] J.C.Barrett、B.Fry、J.Maller和M.J.Daly，“Haploview:LD和单倍型图的分析和可视化”，《生物信息学》，第21卷，第2期，第263-265页，2005年·doi:10.1093/bioinformatics/bth457 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。