Elisa Pappalardo;坎通纳,多梅尼科;帕诺斯·帕达洛斯(Panos M.Pardalos)。 一种用于最近字符串问题的混合贪婪-行走启发式和模拟退火方法。 (英语) Zbl 1305.90307号 最佳方案。方法软件。 29,第4期,673-702(2014). 摘要:最接近字符串问题(CSP)是指从给定的有限输入集的字符串中找到一个具有最小汉明距离的字符串。为了克服其NP特性,我们提出了一种模拟退火方法和一种新的启发式算法,以找到问题的良好初始解,从而可以显著加快算法的收敛速度。为了评估其有效性和稳健性,我们广泛地将我们的方法与整数规划(IP)精确解以及文献中出现的其他启发式方法进行了比较,无论是在人工实例还是在实际实例中。实验结果表明,我们的方法可以为该问题找到很好的解决方案,接近IP公式所找到的最优解,并且在CSP方面优于其他启发式方法。 引用于1文件 MSC公司: 90立方厘米10 整数编程 90 C59 数学规划中的近似方法和启发式 90 C90 数学规划的应用 关键词:最近字符串问题;启发式;模拟退火;NP-hard问题;计算生物学;生物信息学 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{E.Pappalardo}等人,Optim。方法软件。29,第4号,673--702(2014;Zbl 1305.90307) 全文: 内政部 参考文献: [1] DOI:10.1016/0004-3702(89)90050-7·doi:10.1016/0004-3702(89)90050-7 [2] Boucher C.,BMC生物信息12(1)(2011) [3] 陈J.C.,数学。理论计算。Pract(2007) [4] DOI:10.1016/j.jcss.2011.01.003·Zbl 1238.68190号 ·doi:10.1016/j.jcss.2011.01.003 [5] DOI:10.1016/j.cor.2011.06.010·Zbl 1251.90278号 ·doi:10.1016/j.cor.2011.06.010 [6] DOI:10.1023/A:1019545003953·Zbl 1046.90105号 ·doi:10.1023/A:1019545003953 [7] M.Dorigo,优化、学习和自然算法,博士论文,电子技术研究所,米兰理工大学,意大利,1992年。 [8] DOI:10.11162/106454699568728·doi:10.1162/106454699568728 [9] 数字对象标识码:10.1007/s10479-011-1028-7·Zbl 1251.90317号 ·doi:10.1007/s10479-011-1028-7 [10] 内政部:10.1007/BF02679443·Zbl 0868.94056号 ·doi:10.1007/BF02679443 [11] DOI:10.1016/j.ces.2007.11.034·doi:10.1016/j.ces.2007.11.034 [12] DOI:10.1023/A:1022602019183·doi:10.1023/A:1022602019183 [13] DOI:10.1016/j.cor.2007.04.002·Zbl 1209.92024号 ·doi:10.1016/j.cor.2007.04.002 [14] 内政部:10.1007/s00453-003-1028-3·Zbl 1058.68119号 ·doi:10.1007/s00453-003-1028-3 [15] DOI:10.1093/bioinformatics/6.2.81·doi:10.1093/bioinformatics/6.2.81 [16] Holland J.H.,麻省理工学院出版社,密歇根州安娜堡(1992) [17] DOI:10.1038/科学美国人0792-66·doi:10.1038/科学美国人0792-66 [18] DOI:10.1126/科学220.4598.671·Zbl 1225.90162号 ·doi:10.1126/science.220.4598.671 [19] 内政部:10.1145/506147.506150·Zbl 1323.68635号 ·doi:10.1145/506147.506150 [20] 内政部:10.1007/11527503_70·doi:10.1007/11527503_70 [21] DOI:10.1016/j.cor.2011.01.009·Zbl 1219.90105号 ·doi:10.1016/j.cor.2011.01.009 [22] 内政部:10.1007/978-3-540-78839-3_33·doi:10.1007/978-3-540-78839-3_33 [23] 电话:10.1145/272991.272995·Zbl 0917.65005号 ·doi:10.1145/272991.272995 [24] McClure M.A.,分子生物学。Evol 11(4)第571页–(1994) [25] 内政部:10.1287/ijoc.1040.0090·Zbl 1239.90077号 ·doi:10.1287/ijoc.1040.0090 [26] 内政部:10.1109/MEMB.2005.1436464·doi:10.1109/MEMB.2005.1436464 [27] 内政部:10.1063/1.1699114·数字对象标识代码:10.1063/1.1699114 [28] 内政部:10.1080/01621459.1949.10483310·doi:10.1080/01621459.1949.10483310 [29] DOI:10.1016/j.cor.2011.02.025·Zbl 1251.90332号 ·doi:10.1016/j.cor.2011.02.025 [30] Roman S.,编码与信息理论134(1992)·Zbl 0752.94001号 [31] DOI:10.1073/pnas.86.4.1183·doi:10.1073/pnas.86.4.1183 [32] DOI:10.1016/j.cor.2011.06.005·Zbl 1251.90288号 ·doi:10.1016/j.cor.2011.06.005 [33] Wang L.,最接近字符串的高效算法和区分字符串选择问题,第261页–(2009年)·Zbl 1248.68577号 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。