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塞巴斯蒂安·勒科兹;皮埃尔·奥利维尔·切普托;纳塔利·佩拉德

用于估计具有休眠的一年生植物的区域和局部动态的空间马尔科夫框架。 （英语） Zbl 1415.92117号

西奥。大众。生物。 127, 120-132 (2019).
摘要：许多物种在其生命周期中都处于休眠阶段，包括植物种子。休眠期影响物种动态，但通常无法检测到。将休眠包括在内的一种方法是在马尔科夫框架内将其建模为一种隐藏的动态状态。该框架内的模型已经被提出，但有不同的局限性：只对存在/不存在的观测进行建模，休眠期限制为一年，或者不考虑邻近地区的殖民。我们提出了一个隐马尔可夫模型，该模型描述了一个物种的局部和区域动态，该物种可能经历无限休眠时间的休眠。用丰度类对种群进行建模。我们的模型将殖民过程视为邻近非休眠种群状态对斑块中休眠种群状态的不可区分的影响。可以预计，参数估计、隐藏状态估计和下一个非休眠种群的预测将在补丁数量方面具有指数计算时间。然而，我们证明了估计、隐藏状态估计和预测都可以在线性计算时间内实现。对模拟数据进行的数值实验表明，休眠种群的状态以及未来非休眠种群的状态都可以很容易地恢复。我们的框架提供了一个简单有效的工具，可以进一步用于分析和比较年度植物动态，如农田杂草物种生存策略。

MSC公司：

92C80型 植物生物学
92D40型 生态学
60J20型 马尔可夫链和离散时间马尔可夫过程在一般状态空间（社会流动、学习理论、工业过程等）上的应用

关键词：

集合种群;种子库;隐藏生命阶段;殖民地化;预测;期望最大化算法

软件：

LBFGS-B型
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{S.Le Coz}等人，Theor。大众。生物学127120-132（2019；兹bl 1415.92117）
全文： 内政部 哈尔

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