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汉迪，格雷戈里·A。;布拉德福德·E·皮尔斯。

扩展\（\mathrm{IP}_3\)受体模型包括与部分激动剂的竞争。 （英语） Zbl 1337.92091号

J.西奥。生物。 310, 97-104 (2012).
摘要：肌醇1,4,5-三磷酸（{IP}_3\))受体是位于内质网的（mathrm{Ca}^{2+}）通道，受（mathrm）调节{IP}_3\)和\（\mathrm{Ca}^{2+}\）。该通道对不同类型细胞中的钙信号传导至关重要，如神经元和胰腺β细胞到肥大细胞。G.W.德扬和J.凯泽[“基于肌醇1,4,5-三磷酸受体的单池模型，用于（mathrm{Ca}^{2+}）浓度下激动剂刺激的振荡”，美国国家科学院院刊89，第20期，9895-9899（1992；doi:10.1073/pnas.89.20.9895)]创建了一个八州九变量模型{IP}_3\)受体。在他们的模型中，他们计算了三个结合位点，一个是{IP}_3\)、激活\（\mathrm{Ca}^{2+}\）和停用\（\mathrm{Ca}^{2+}\）。只有当\（\mathrm{IP}_3\)并且激活\（\mathrm{Ca}^{2+}\）被绑定。Li和Rinzel在1994年对本文进行了后续研究，引入了一种简化方法，使其成为一个双变量系统。最近的出版物A.M.罗西等[“合成的部分激动剂揭示了{IP}_3\)受体激活”，《自然化学》。生物5，第9期，631-639（2009年；doi:10.1038/nchembio.195)]研究了引入mathrm的效果{IP}_3\)-类分子，称为部分激动剂（PA），进入细胞以确定{IP}_3\)及其受体。初步结果表明了一个有竞争力的模型，其中\（\mathrm｛IP｝_3\)和PA为同一个结合位点而战。为了说明这种竞争，我们将原来的八态模型扩展为12态模型，并在第一次建模研究中对Li和Rinzel的模型进行了类似的简化，我们注意到PA对模型的影响{IP}_3\)受体。利用此约简，我们求解了模型中钙释放的平衡开放概率。我们复制了Rossi论文提供的图，发现优化了\（\mathrm{IP}_3\)PA与数据吻合良好。我们将扩展的简化模型插入到全细胞模型中，以分析PA对整个细胞特性的影响，特别是二维钙波的传播。我们得出结论，PA产生的钙动力学与单纯的还原钙动力学有质的不同{IP}_3\)，但PA可以有效地充当｛IP｝_3\)击倒。

MSC公司：

92C45型 生化问题中的动力学（药代动力学、酶动力学等）
92C40型 生物化学、分子生物学

关键词：

肌醇三磷酸受体;数学模型;多状态模型;钙波;分岔图
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{G.A.Handy}和\textit{B.E.Peercy}，J.Theor。生物.310，97-104（2012；Zbl 1337.92091）
全文： 内政部

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