埃里克·克罗巴特;格哈德·威廉·韦伯;埃尔凡·巴贝·蒂尔科莱埃 半代数基因环境网络基础。 （英语） Zbl 1465.92042号 J.戴恩。游戏 7，第4期，253-268（2020年）. 在本文中，作者试图“超越传统的随机方法，提出一种新的半代数基因环境网络框架”。在综述了处理不确定性模型的基因-环境网络、不确定性区域的半代数描述和全基因组关联研究的最新进展之后，作者提出了一种新的网络定义，强调（并分离）基因和环境因素。接下来，将详细讨论集群分区，然后对不确定性区域进行全面概述。还包括网络修剪的方法。审核人：Irina Ioana Mohorianu（牛津） 引用于8文件 MSC公司： 92立方厘米 系统生物学、网络 92D10型 遗传学和表观遗传学 90立方厘米 混合整数编程 关键词：基因环境网络;半代数回归;半代数不确定性;几何模型;预测;不确定性建模;混合整数编程;连续程序设计 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{E.Kropat}等人，J.Dyn。第7届奥运会，第4名，253-268（2020；Zbl 1465.92042） 全文： 内政部 参考文献： [1] M.U.Akhmet；M.Kirane；M.A.特列别格诺娃；G.Weber，拟线性脉冲积分微分方程的控制和最优响应问题，欧洲期刊Oper。第1691128-1147号决议（2006年）·Zbl 1259.49037号 ·doi:10.1016/j.ejor.2004.10.030 [2] B.Akteke-Øztürk；G.-W.韦伯；G.Köksal，模型不确定性下广义期望函数的优化，优化，66，2157-2169（2017）·Zbl 1386.90133号 ·网址：10.1080/02331934.2017.1371167 [3] A.Arnau-Soler等人，《英国生物银行和苏格兰一代的抑郁症状和心理社会压力的全基因组与环境交互研究》，转化精神病学，9（2019），13页。 [4] E.Ayyildiz；V.Purutçuoglu；G.W.Weber，《基于回路的二次曲线多元自适应回归样条是高级构建复杂生物网络的新方法》，欧洲J.Oper。第270号决议，852-861（2018）·Zbl 1403.92089号 ·doi:10.1016/j.jor.2017.12.011 [5] J.Bochnak、M.Coster和M.-F.Roy，半代数集《现代数学调查系列》，36，施普林格-柏林-海德堡出版社，柏林，海德堡，1998年，23-58。 [6] A.切维奇；G.韦伯；B.M.Eyüboglu；K.K.Oguz，阿尔茨海默病神经成像倡议Voxel-MARS：通过结构脑MRI分类早期检测阿尔茨海默氏病的方法，Ann.Oper。决议，258，31-57（2017）·Zbl 1383.92039号 ·doi:10.1007/s10479-017-2405-7 [7] H.Delfs和M.Knebusch，局部半代数空间《数学讲义》，第1173卷，施普林格-弗拉格出版社，柏林，1985年·Zbl 0582.14006号 [8] R.Dobson；G.Giovannoni，多发性硬化——综述，《欧洲神经病学杂志》，26，27-40（2019）·doi:10.1111/ene.13819 [9] X.Dong；Y.Yang，通过可转换架构搜索进行网络修剪，NeurIPS，32，760-771（2019） [10] A.开斋节；I.姆哈特雷；J.R.Richardson，阿尔茨海默病中的基因-环境相互作用：精确医学的潜在途径，药理学与治疗学，199173-187（2019）·doi:10.1016/j.pharmthera.2019.03.005 [11] S.Z.A.哥克；G.-W.Weber，关于合作椭球对策的优势核心和稳定集，优化，621297-1308（2013）·Zbl 1291.91014号 ·doi:10.1080/02331934.2013.993327 [12] A.戈里；香港扎尔；R.Tavakkoli-Moghaddam；A.Sadegheih，带劳动力就业的财务约束闭环供应链的多目标模糊数学模型，计算智能，36，4-36（2020）·doi:10.1111/coin.12228 [13] A.Goli、H.Khademi Zare、R.Tavakkoli-Moghaddam和A.Sadeghieh，多目标产品组合问题的混合人工智能和稳健优化案例研究：乳制品行业，计算机与工业工程, 137 (2019), 106090. ·Zbl 1447.91160号 [14] G.卡拉；奥兹曼；G.-W.Weber，平行六面体不确定性下稳健投资组合优化的稳定性进展，CEJOR Cent。欧洲药典。决议，27，241-261（2019）·Zbl 07024048号 ·doi:10.1007/s10100-017-0508-5 [15] E.克罗帕特；奥兹曼；G.-W.韦伯；S.Meyer-Nieberg；O.Defterli，基因环境网络的模糊预测策略-双模调节系统的模糊回归分析，RAIRO-Oper。决议，50，413-435（2016）·Zbl 1357.92032号 ·doi:10.1051/ro/2015044 [16] E.克罗巴特；G.-W.Weber，模糊目标环境网络和模糊回归方法，Numer。代数，控制优化。，8, 135-155 (2018) ·Zbl 1409.62155号 ·doi:10.3934/naco.2018008 [17] E.Kropat、G.-W.Weber和C.Pedamallu，椭球形不确定性下的监管网络——通过优化理论和动力系统进行数据分析和预测数据挖掘：基础与智能范式第2卷，智能。系统。参考图书馆。，24，施普林格，柏林，2012年，27-56·Zbl 1231.68208号 [18] E.克罗巴特；G.-W.韦伯；J.-J.Rückmann，基于椭球演算和优化的基因环境网络中簇的回归分析，Dyn。Contin公司。离散脉冲。系统。序列号。B申请。算法，17，639-657（2010）·兹比尔1206.93009 [19] E.Kürüm；G.-W韦伯；C.Iyigun，通过优化、聚类和反问题的方法对股市泡沫进行预警，Ann.Oper。决议，260，293-320（2018）·Zbl 1381.90086号 ·doi:10.1007/s10479-017-2496-1 [20] A.Mardani、D.Kannan、R.E.Hooker、S.Ozkul、M.Alrasheedi和E.B.Tirkolaee，《使用结构方程模型评估绿色和可持续供应链管理：最新文献的系统综述和未来研究的建议》，清洁生产杂志, 249 (2020), 119383. [21] K.McAllister，复杂疾病基因-环境相互作用研究的当前挑战和新机遇，《美国流行病学杂志》，186753-761（2017）·doi:10.1093/aje/kwx227 [22] M.C.Mills和C.Rahal，全基因组关联研究的科学计量学综述，通讯生物学第2期（2019年），第11页。 [23] R.J.Musci、J.L.Augustinavicius和H.Volk，精神病学中的基因-环境相互作用：最新证据和临床意义，当前精神病学报告，21（2019），81页。 [24] Ö. N.Onak，Y.S.Dogrusoz和G.Weber，针对建模和测量噪声的心电逆解降阶非参数模型的鲁棒性心脏病学中的计算，2018年9月23日至26日，荷兰马斯特里赫特，CinC 2018，2018，1-4。 [25] 奥兹曼；E.克罗巴特；G.-W.Weber，复杂多模式监管网络的样条回归模型，Optim。方法软件。，29, 515-534 (2014) ·Zbl 1285.90004号 ·doi:10.1080/10556788.2013.821611 [26] 奥兹曼；E.克罗巴特；G.-W.Weber，多面体不确定性下多模型监管网络样条回归模型的稳健优化，优化，66，2135-2155（2017）·邮编1383.90004 ·doi:10.1080/02331934.2016.1209672 [27] 奥兹曼；G.-W.韦伯；E.Kropat，多面体不确定性下二次曲线广义部分线性模型的稳健性，国际IFNA-ANS科学期刊“工程系统中的非线性分析问题”，38，104-113（2012） [28] S.ǧzöür-Akyüz；G.-W.Weber，《关于无限核学习的数值优化理论》，J.Global Optim。，48, 215-239 (2010) ·Zbl 1198.90377号 ·数字对象标识代码：10.1007/s10898-009-9488-x [29] S.özögür-Akyüz；G.-W.Weber，通过无限和半无限编程进行无限内核学习，Optim。方法软件。，25, 937-970 (2010) ·Zbl 1225.90141号 ·网址：10.1080/10556780903483349 [30] T.白豆；E.Özceylan；G.-W.Weber，面向利润的供应链网络优化，CEJOR Cent。欧洲药典。决议，21，455-478（2013）·Zbl 1397.90284号 ·doi:10.1007/s10100-012-0240-0 [31] J.Rogers；T.雷诺阿；A.J.Hannan，基因-环境相互作用为认知和情感障碍的治疗方法提供信息，神经药理学，145，37-48（2019）·doi:10.1016/j.neuropharm.2017.12.038 [32] S.K.Roy；G.Maity；G.-W Weber，使用目标效用函数的多目标两阶段灰色运输问题，CEJOR Cent。欧洲药典。决议，25，417-439（2017）·Zbl 1370.90027号 ·doi:10.1007/s10100-016-0464-5 [33] E.萨夫库；G.-W Weber，具有延迟的马尔可夫状态切换跳跃扩散模型的随机最大值原理及其在金融中的应用，J.Optim。理论应用。，179, 696-721 (2018) ·Zbl 1402.93269号 ·doi:10.1007/s10957-017-1159-3 [34] A.J.Schork，一项关于精神疾病共同风险的全基因组关联研究，涉及胎儿神经发育期间的基因调控，《自然神经科学》，22，353-361（2019）·doi:10.1038/s41593-018-0320-0 [35] A.Shapiro、D.Dentcheva和A.Ruszczynski，随机规划讲座：建模与理论，第二版《工业和应用数学学会》，宾夕法尼亚州费城，2014年·兹比尔1302.90003 [36] O.Stein，半有限规划中的双层策略《非凸优化及其应用》，71，Kluwer学术出版社，马萨诸塞州波士顿，2003年·Zbl 1103.90094号 [37] P.Taylan；G.-W.韦伯；E.Kropat，使用样条曲线和圆锥规划通过加法模型逼近随机微分方程，国际计算预期系统杂志，21，341-352（2008） [38] E.B.Tirkolaee、A.Goli和G.-W.Weber，模糊季节需求下考虑加班和外包选项的多目标综合生产计划模型，查姆施普林格，2019年，81-96。 [39] E.B.Tirkolaee；S.Hadian；G.-W.韦伯；I.Mahdavi，《易腐产品分销的稳健绿色基于交通的路由问题》，计算智能，36，80-101（2020）·doi:10.1111/coin.12240 [40] E.B.Tirkolaee；I.马达维；M.M.Seyyed Esfahani先生；G.-W.Weber，城市固体废物管理模糊需求下多行程容量约束弧路由问题的混合增广蚁群优化，废物管理与研究，38，156-172（2020）·doi:10.1177/0734242X19865782 [41] E.B.Tirkolaee、I.Mahdavi、M.M.Seyyed Esfahani和G.-W.Weber，一种新的混合方法，用于两级供应链设计中可持续可靠供应商的选择，清洁生产杂志, 250 (2020), 119517. [42] E.B.Tirkolaee；I.马哈达维；M.M.Seyyed Esfahani先生；G.-W.Weber，《设计不确定性下城市废物管理系统的稳健绿色位置分配库存问题》，废物管理，102，340-350（2020）·doi:10.1016/j.wasman.2019.10.038 [43] E.B.Tirkolaee；J.Mahmoodkhani；M.R.Bourani先生；R.Tavakkoli Moghaddam，用于鲁棒多级容量位置分配库存问题的自学习粒子群优化，《先进制造系统杂志》，18677-694（2019）·doi:10.1142/S0219686719500355 [44] R.Uher，抑郁症中基因-环境相互作用的含义：将导致告知治疗？，分子精神病学，13，1070-1078（2008）·doi:10.1038/mp.2008.92 [45] S.Van der Auwera，抑郁症的全基因组基因-环境相互作用：候选基因的系统评估，《美国医学遗传学杂志》第B部分：神经精神遗传学，177，40-49（2018）·doi:10.1002/ajmg.b.32593 [46] A.瓦辛；P.Kartunova；G.-W Weber，容量和电力市场设计模型，CEJOR Cent。欧洲药典。决议，21，651-661（2013）·Zbl 1339.91085号 ·doi:10.1007/s10100-012-0259-2 [47] M.维达尔；M.Cusick；A.-L.Barabási，交互作用网络与人类疾病，细胞，144986-998（2011）·doi:10.1016/j.cell.2011.02.016 [48] G.-W.Weber，Charakterisierung struktureller stabilität in der nichtlinearen optimierung，Aachener Beiträge zur Mathematik，5岁，Augustinus出版社（现为美因茨出版社），亚琛，1992年·Zbl 0796.90066号 [49] G.-W.韦伯，广义半无限优化及相关问题《数学研究与说明》，29，赫尔德曼·弗拉格，莱姆戈，2003年·Zbl 1056.90134号 [50] G.-W.韦伯；S.Alparslan-Gök；N.Dikmen，《环境与生命科学：基因环境网络优化、游戏和控制——近期成就调查》，《组织变革与社会变革杂志》，第5期，第197-233页（2008年）·doi:10.1386/jots.5.3.197_1 [51] G.-W.韦伯；S.Z.Alparslan-Gök；B.Söyler，《环境与生命科学中的一种新数学方法：基因-环境网络及其动力学》，环境建模与评估，14，267-288（2009）·doi:10.1007/s10666-007-9137-z [52] G.-W.Weber、R.Branzei和S.Alparslan-Gök，关于合作椭球对策第24届小型欧洲会议——关于金融领域的持续优化和信息化技术，MEC-EurOPT, 2010, 369-372. [53] G.-W.韦伯；E.克罗巴特；B.Akteke-Øztürk；Z.-K.Görgülü，OR和数学方法在基因环境网络中的应用调查，CEJOR Cent。欧洲药典。决议，17，315-341（2009）·Zbl 1204.90001号 ·doi:10.1007/s10100-009-0092-4 [54] G.-W.韦伯；E.克罗帕特；A.特泽尔；S.Belen，《监管和生态金融网络的优化应用——调查和新发展》，太平洋地区。J.Optim。，6, 319-340 (2010) ·Zbl 1282.93279号 [55] G.-W.韦伯；S.özögür-Akyüz；E.Kropat，《数据挖掘和连续优化在计算生物学和医学中的应用综述》，出生缺陷研究第C部分：今日胚胎：综述，87，165-181（2009）·doi:10.1002/bdrc.151 [56] G.-W.韦伯；A.Tezel，关于遗传网络的广义半无限优化，TOP，15，65-77（2007）·Zbl 1123.93018号 ·doi:10.1007/s11750-007-0003-6 [57] A.Yildizbasi；A.校准；T.白豆；R.法拉哈尼；G.-W.Weber，使用交互式模糊规划方法对汽车闭环供应链网络进行多级优化，《经济的技术和经济发展》，24，1004-1028（2018）·doi:10.3846/20294913.2016.1253044 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。