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张明;王立群;罗纳德·戈德曼

反向分子运动学的Bézier细分。 （英语） Zbl 1108.92021号

国际期刊计算。地理。申请。 16，编号5-6，513-532（2006）.
构象搜索是逆分子运动学的核心任务。影响构象搜索速度或质量的算法改进将对配体-受体对接、蛋白质结构从头计算预测和蛋白质折叠等应用产生深远影响。我们研究一个特定的几何约束构象搜索问题，其中一些特征原子具有预先指定的目标位置。利用Bézier细分，我们提出了一种定位和逼近由特征原子上的约束导出的方程解的方法。这些解对应的构象都是满足目标约束的构象。提出了利用多项式方程系数稀疏性的三种细分方法，并对结果进行了比较。

引用于1文件

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
92E10型 分子结构（图形理论方法、微分拓扑方法等）
92C45型 生化问题中的动力学（药代动力学、酶动力学等）
92-04 生物相关问题的软件、源代码等

关键词：

逆分子运动学;细分;伯恩斯坦碱

软件：

PHC包
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{M.Zhang}等人，国际计算机杂志。地理。申请。16、编号5--6513--532（2006；Zbl 1108.92021）
全文： 内政部

参考文献：

[1] Leach A.R.，分子建模原理与应用（2001）
[2] Lengauer T.，生物信息学——从地理学到药物（2002）
[3] 数字对象标识码：10.1110/ps.0305003·doi:10.1110/ps.0305003
[4] DOI:10.1002/（SICI）1096-987X（20000715）21:9<731:：AID-JCC3>3.0.CO；2-右·doi:10.1002/（SICI）1096-987X（20000715）21:9<731:：AID-JCC3>3.0.CO；2小时
[5] D.R.Henry和A.G.Ozkabak，计算化学百科全书，P.v。R.Schleyer（威利，纽约，1998）pp。543–552.
[6] 数字对象标识码：10.1021/ci010327z·doi:10.1021/ci010327z
[7] 内政部：10.1021/ci034068k·doi:10.1021/ci034068k
[8] Song G.，J.计算。生物9，第149页
[9] Craig J.J.，机器人导论（1989）·兹比尔0711.68103
[10] 内政部：10.1006/jsco.1998.0266·Zbl 0943.13005号 ·doi:10.1006/jsco.1998.0266
[11] 内政部：10.1007/978-1-4757-6911-1·doi:10.1007/978-1-4757-6911-1
[12] 内政部：10.1137/1.9780898717976·Zbl 1058.65054号 ·数字对象标识代码：10.1137/1.9780898717976
[13] M.Zhang和L.E.Kavraki，《计算分子生物学的潮流》（ACM出版社，2002年），pp。214–215.
[14] 内政部：10.1137/1.9781611970012·数字对象标识代码：10.1137/1.9781611970012
[15] 内政部：10.1145/317275.317286·Zbl 0961.65047号 ·doi:10.1145/317275.317286
[16] Press W.，《数字配方：科学计算的艺术》（1990）·Zbl 0587.65003号
[17] 内政部：10.1007/978-3-7091-6280-4_9·doi:10.1007/978-3-7091-6280-49
[18] 内政部：10.1016/0167-8396（93）90019-Y·Zbl 0817.65035号 ·doi:10.1016/0167-8396（93）90019-Y
[19] DOI:10.1093/bioinformatics/bti055·doi:10.1093/bioinformatics/bti055
[20] 内政部：10.1146/年/月/年·doi:10.1146/annurev.biophys.32.110601.142532
[21] Arfken G.，《物理学家的数学方法》（1985）·Zbl 0135.42304号
[22] Farin G.，《CAGD曲线和曲面：实用指南》（2002年）
[23] Goldman R.，《金字塔算法：几何建模中曲线和曲面的动态规划方法》（2002年）
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