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约翰娜·伯特尔;格雷戈里·尤因;卡罗琳·科索尔;安德烈亚斯·福希克

群体遗传推断的近似最大似然估计。 （英语） Zbl 1396.92050号

统计应用程序。遗传学。分子生物学。 16，编号5-6，387-405（2017）.
摘要：在许多群体遗传问题中，参数估计受到难以处理的似然函数的阻碍。因此，近似估计方法已经被开发出来，并且随着计算能力的增长，基于采样的方法变得流行起来。然而，这些方法（如近似贝叶斯计算（ABC））在高维问题中可能效率低下。这导致了更复杂的迭代估计方法的发展，如粒子滤波器。在这里，我们提出了一种基于随机近似的替代方法。通过沿模拟梯度或上升方向移动，该算法生成一系列估计，在给定一组观察到的汇总统计信息的情况下，这些估计最终收敛到最大似然估计。这种策略不会从参数空间的低似然区域中进行太多采样，而且速度很快，即使涉及许多汇总统计数据。我们在提供调整指南方面付出了相当大的努力，以提高稳健性，并在高维摘要统计和低信噪比的问题上取得良好的性能。然后，我们研究了我们得到的方法的性能，并在仿真中研究了其特性。最后，我们重新估计了描述博尔尼亚和苏门答腊猩猩-不丹的人口统计历史的参数。

MSC公司：

92D10型 遗传学和表观遗传学
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析
2015年1月62日 贝叶斯推断

关键词：

近似推断;隔离迁移模型;最大似然估计;猩猩-不丹;群体遗传学;随机近似

软件：

科恩平滑;引导库;MSMS（座椅位置记忆系统）
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{J.Bertl}等人，《统计应用》。遗传学。分子生物学。16，编号5-6387-405（2017年；兹bl 1396.92050）
全文： 内政部 链接

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