塞巴斯蒂安·吕克;阿洛伊斯·费希特;米歇拉·水手;赫尔加·乔斯;罗尔夫·布伦纳（Rolf E.Brenner）。;保罗·沃尔特;沃尔克·施密特 基于灰度值定向图像分割的间充质细胞系中间丝网络的统计分析。 （英语） 兹比尔1305.65055 计算。统计。 28，第1期，139-160（2013）. 小结：中间纤维网络是细胞骨架的一部分，在大变形期间保护细胞的完整性。在间充质细胞系中，细胞骨架集中参与信号转导，从而影响分化。我们研究了三种人类间充质细胞类型，即未分化间充质干细胞、软骨细胞和成骨细胞中IF网络的超微结构。为了捕获IF网络的高形态可变性，我们应用图像分析技术，以全自动的方式从2D扫描电子显微镜（SEM）图像中提取网络图，从而实现SEM数据的高通量分析。提取的网络图通过空间统计技术进行分析，以检测不同细胞类型之间的网络形态差异，并推断细胞在迁移和分化过程中用于适应其力学特性的网络重构策略。 引用于1文件 MSC公司： 62-08 统计问题的计算方法 关键词：细胞骨架;中间纤维;图像分析;空间统计学;细胞力学;高通量显微镜;间充质干细胞;成骨细胞;软骨细胞 软件：图像J PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{S.Lück}等人，计算。Stat.28，No.1，139--160（2013；Zbl 1305.65055） 全文： 内政部 参考文献： [1] Beil M，Micoulet A，von Wichert G，Paschke S，Walther P，Omary MB，Van Veldhoven PP，Gern U，Wolff-Hieber E，Eggermann J，Waltenberger J，Adler G，Spatz J，Seufferlein T（2003）鞘氨醇磷酰胆碱调节人类癌细胞的角蛋白网络结构和粘弹性特性。自然细胞生物学5:803–811·doi:10.1038/ncb1037 [2] Beil M，Braxmeier H，Fleischer F，Schmidt V，Walter P（2005）癌细胞扫描电子显微镜图像中角蛋白细丝网络的定量分析。微生物学杂志220:84–95·文件编号：10.1111/j.1365-2818.2005.01505.x [3] Beil M，Lück S，Fleischer F，Portet S，Arendt W，Schmidt V（2009）通过分段确定马尔可夫过程模拟角蛋白纤维网络的形成。《Theor生物学杂志》256:518–532·Zbl 1400.92160号 ·doi:10.1016/j.jtbi.2008.09.044 [4] Bobick BE，Tuan RS，Chen FH（2010）中间丝波形蛋白调节成人骨髓源多能干祖细胞的软骨生成。细胞生物化学杂志109:265–276 [5] Couprie M、Bezerra FN、Bertrand G（2001）《灰度处理的拓扑算子》。电子成像杂志10:1003–1015·doi:10.1117/1.1408316 [6] Canny J（1986）边缘检测的计算方法。IEEE T型分析8:679–698·doi:10.1109/TPAMI.1986.4767851 [7] Daley DJ，Vere-Jones D（2003/08）点过程理论导论，第一卷和第二卷。纽约州施普林格·Zbl 1026.60061号 [8] Darling EM、Topel BS、Zauscher S、Vail TP、Guilak F（2008）间质衍生干细胞和原代成骨细胞、软骨细胞和脂肪细胞的粘弹性特性。生物技术杂志41:454–464·doi:10.1016/j.jpbiomach.2007.06.019 [9] Deriche R（1987）使用Canny准则导出递归实现的最佳边缘检测器。国际J计算机展望1:167–187·doi:10.1007/BF00123164 [10] Docheva D、Padula D、Popov C、Mutschler W、Clausen-Schaumann H、Schieker M（2008）《利用原子力显微镜研究间充质干细胞、成骨细胞和骨肉瘤细胞的细胞形状、体积和弹性》。细胞分子医学杂志12:537–552·doi:10.1111/j.1582-4934.2007.00138.x [11] Dubochet J（2007）《快速冷却物理学及其对细胞冷冻固定化的影响》。方法细胞生物学79:7-21·doi:10.1016/S0091-679X（06）79001-X [12] Eriksson JE、Dechat T、Grin B、Helfand B、Mendez M、Pallari HM、Goldman RD（2009）《中间丝介绍：从发现到疾病》。临床研究杂志119:1763–1771·doi:10.1172/JCI38339 [13] Fiedler J、Röderer G、Günther KP、Brenner R（2002）BMP-2、BMP-4和PDGF-bb刺激原代人类间充质祖细胞的趋化性迁移。细胞生物化学杂志87:305–312·doi:10.1002/jcb.10309 [14] Fiedler J、Leucht F、Waltenberger J、Dehio C、Brenner RE（2005）VEGF-A和PlGF-1刺激人类间充质祖细胞的趋化迁移。生物化学与生物物理研究通讯334:561–568·doi:10.1016/j.bbrc.2005.06.116 [15] Fiedler J、Brill C、Blum WF、Brenner RE（2006）IGF-I和IGF-II刺激骨髓来源的人类间充质祖细胞的定向细胞迁移。生物化学与生物物理研究通讯345:1177–1183·文件编号：10.1016/j.brc.2006.05.034 [16] Fleischer F、Ananthakrishnan R、Eckel S、Schmidt H、KäS J、Svitkina T、Schmidd V、Beil M（2007）《黑色素瘤细胞足爪肌动蛋白网络结构和弹性》。新J Phys 9:420·doi:10.1088/1367-2630/9/11/420 [17] Fudge DS、Gardner KH、Forsyth VT、Riekel C、Gosline JM（2003）《水合中间丝的机械性能：从海鱼黏液丝中获得的见解》。《生物物理学杂志》第85期：2015–2027·doi:10.1016/S0006-3495（03）74629-3 [18] Hayter AJ（1984）Tukey-Kramer多重比较程序是保守的推测的证明。安统计12:61–75·Zbl 0545.62047号 ·doi:10.1214/aos/1176346392 [19] Heussinger C，Frey E（2007），半柔性聚合物和纤维网络弹性响应中的结构作用。物理版E 75:011917·doi:10.1103/PhysRevE.75.011917 [20] Hohenberg HH，Müller-Reichert T，Schwarz H，Zierold K（2003）前言，高压冷冻专刊。微细杂志212:1–2·文件编号：10.1046/j.1365-2818.2003.01259.x [21] Huisman EM，van Dillen TM，Onck PR，Vander Giessen E（2007）三维交联F-肌动蛋白网络：网络结构和机械行为之间的关系。物理评论稿99:208103·doi:10.1103/PhysRevLett.99.208103 [22] Jackson WM、Jaasma MJ、Tang RY、Keaveny TM（2008）流体剪切的机械载荷足以改变成骨细胞的细胞骨架组成。Am J细胞生理学295:C1007–C1015·doi:10.1152/ajpcell.00509.2007 [23] Janmey PA、Euteneuer U、Traub P、Schliwa M（1991），与其他丝状生物聚合物网络相比，波形蛋白的粘弹性特性。细胞生物学杂志113:155–160·文件编号：10.1083/jcb.113.1.155 [24] Joos H、Albrecht W、Laufer S、Reichel H、Brenner RE（2008）IL-1β调节人类软骨细胞中的FHL2和其他细胞骨架相关基因。分子医学150–159 [25] Kramer CY（1956）将多重范围测试扩展到重复次数不等的分组均值。生物计量学12:307–310·doi:10.2307/3001469 [26] Kreplak L，Bär H，Leterrier JF，Herrmann H，Aebi U（2005）《探索单根中间纤维的力学行为》。分子生物学杂志354:569–577·doi:10.1016/j.jmb.2005.09.092 [27] Landini G（2010）ImageJ插件和宏。http://www.dentistry.bham.ac.uk/landinig/software/software.html [28] Lin Y、Broedersz CP、Rowat AC、Wedig T、Herrmann H、MacKintosh FC、Weitz DA（2010）二价阳离子交联中间丝尾结构域中的波形蛋白以调节网络力学。分子生物学杂志399:637-644·doi:10.1016/j.jmb.2011.04.054 [29] Lück S，Sailer M，Schmidt V，Walther P（2010）使用SEM-tomography对中间纤维网络进行三维分析。微生物学杂志239:1–16·文件编号：10.1111/j.1365-2818.2009.03348.x [30] MacKintosh F，Käs J，Janmey PA（1995）半柔性生物聚合物网络的弹性。物理评论稿75:4425–4428·doi:10.1103/PhysRevLett.75.4425 [31] Mayer J，Schmidt V，Schweigert F（2004）空间随机模型的统一模拟框架。模拟模型Pract Th 12:307–326·doi:10.1016/j.simpat.2004.02.001 [32] Mayr-Wohlfart U、Waltenberger J、Hausser H、Kessler S、Gunther KP、Dehio C、Puhl W、Brenner RE（2002）血管内皮生长因子刺激原代人类成骨细胞的趋化迁移。骨骼30:472–477·doi:10.1016/S8756-3282（01）00690-1 [33] Morse DC（1998）半柔性聚合物集中各向同性溶液的粘弹性。1.模型和应力张量。大分子31:7030–7043·doi:10.1021/ma9803032 [34] Mücke N，Kreplak L，Kirmse R，Wedig T，Herrmann H，Aebi U，Langowski J（2004）通过原子力显微镜评估中间丝的柔韧性。分子生物学杂志335:1241–1250·doi:10.1016/j.jmb.2003.11.038 [35] Mücke N，Kirmse R，Wedig T，Leterrier JF，Kreplak L（2005）吸附在不同固体载体上的中间纤维形态的研究。结构生物学杂志150:268–276·doi:10.1016/j.jsb.2005.02.012 [36] Nakasaki M、Yoshioka K、Miyamoto Y、Sasaki T、Yoschikawa H、Itoh K（2008）成骨细胞分泌的IGF-I是成骨细胞的一种强有力的趋化因子。骨骼43:869–879·doi:10.1016/j.bon.2008.07.241 [37] Ozkucur N，Monsees TK，Perike S，Do HQ，Funk RH（2009），局部钙升高和细胞伸长在电刺激的成骨样细胞中启动引导运动。公共科学图书馆One 4:e6131·doi:10.1371/journal.pone.0006131 [38] O'Neill GM（2009），间充质细胞迁移中肌动蛋白丝和粘附之间的协调。细胞Adh Migr 3:355–357·doi:10.4161/cam.3.4.9468 [39] Rasband WS（1997–2010）图像杂志。马里兰州贝塞斯达美国国立卫生研究院。http://rsb.info.nih.gov/ij/ [40] Resch GP、Goldie KN、Krebs A、Hoenger A、Small JV（2002），通过冷冻电子显微镜观察肌动蛋白细胞骨架。细胞科学杂志115:1877–1882 [41] Ris H（1985）临界点驱动的完整支架和塑料包埋切片中的细胞质丝系统。细胞生物学杂志100:1474-1487·doi:10.1083/jcb.100.5.1474 [42] Rodríguez JP、González M、Ríos S、Cambiazo V（2004）人类间充质干细胞（MSC）在成骨分化过程中的细胞骨架组织变化。细胞生物化学杂志93:721–731·doi:10.1002/jcb.20234 [43] Sailer M，Höhn K，Lück S，Schmidt V，Beil M，Walther P（2010）研究角蛋白纤维网络形态的新型电子层析方法。Microsc微型肛门16:462–471·doi:10.1017/S1431927610093657 [44] Schopferer M，Bär H，Hochstein B，Sharma S，Mücke N，Herrmann H，Willenbacher N（2009）Desmin和vimentin中间纤维网络：通过机械流变仪研究其粘弹性。分子生物学杂志388:133–143·doi:10.1016/j.jmb.2009.03.005 [45] Stoyan D，Stoyan H（1994），分形，随机形状和点场。几何统计方法。奇切斯特·威利·Zbl 0828.62085号 [46] Trickey WR，Vail TP，Guilak F（2004）细胞骨架在人类关节软骨细胞粘弹性特性中的作用。骨科研究杂志22:131–139·doi:10.1016/S0736-0266（03）0150-5 [47] Treiser MD、Yang EH、Gordonov S、Cohen DM、Androulakis IP、Kohn J、Chen CS、Moghe PV（2010）基于细胞骨架的干细胞谱系命运预测。P美国国家科学院12:610–615·doi:10.1073/pnas.0909597107 [48] Urban E、Jacob S、Nemethova M、Resch GP、Small JV（2010年）电子断层扫描揭示了跛足纲肌动蛋白丝的未分支网络。自然细胞生物学12:429–435·doi:10.1038/ncb2044 [49] Vignal E，Resch G（2003）《在跛足足上释放光和电子：爬行细胞的运动成像》。生物技术34:780–784、786:788–789 [50] Weichsel J、Herold N、Lehmann MJ、Kräusslich H、Schwarz US（2010年）采用自动化高通量显微镜研究肌动蛋白细胞骨架变化的定量测量。细胞学A部分77:52-6 [51] Windoffer R，Woll S，Strnad P，Leube RE（2004）《活细胞角蛋白纤维网络周转新原理的鉴定》。分子生物学细胞15:2436–2448·doi:10.1091/mbc。E03-09-0707号 [52] Yourek G，Hussain MA，Mao JJ（2007），间充质干细胞分化过程中的细胞骨架变化。ASAIO期刊53:219–228·doi:10.1097/MAT.0b013e31802deb2d 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