×

难处理可能性的扩展经验鞍点近似。 (英语) Zbl 1395.62338号

摘要:计算生态学、生物学和遗传学中使用的复杂随机模型所带来的挑战刺激了统计推断近似方法的发展。在这里,我们重点关注合成似然(SL),这是一种将观测数据和模拟数据简化为一组汇总统计数据的过程,并通过合成似然函数量化它们之间的差异。SL几乎不需要调整,但它依赖于摘要统计的近似正态性。我们通过提出一种新的、更灵活的密度估计器来放宽这个假设:扩展经验鞍点近似。除了证明SL的一致性外,在新的或高斯密度估计下,我们还用三个例子说明了该方法。其中之一是一个复杂的基于个体的森林模型,SL为其提供了统计推断的少数实用可能性之一。实例表明,新的密度估计器能够捕获与正态性的较大偏差,同时可扩展到高维,这反过来导致相对于高斯替代的更准确的参数估计。新的密度估计器由伊萨德尔R包,可在综合R档案网络(CRAN)上免费获得。

MSC公司:

第62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
62甲12 多元分析中的估计
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用

参考文献:

[1] Andrieu,C.、G.O.Roberts等人(2009年)。有效蒙特卡罗计算的伪边缘方法。,《统计年鉴》37(2),697-725·兹比尔1185.60083 ·doi:10.1214/07-AOS574
[2] Bartolucci,F.(2007)。总体平均值经验似然比的惩罚版本。,统计与概率快报77(1),104-110·Zbl 1106.62050号 ·doi:10.1016/j.spl.2006.05.016
[3] Beaumont,M.A.、W.Zhang和D.J.Balding(2002年)。群体遗传学中的近似贝叶斯计算。,遗传学162(4),2025-2035。
[4] Blum,M.、M.Nunes、D.Prangle和S.Sisson(2013年)。近似贝叶斯计算中降维方法的比较评述。,统计科学28(2),189-208·兹比尔1331.62123 ·doi:10.1214/12-STS406
[5] Blum,M.G.(2010年)。近似贝叶斯计算:非参数视角。,美国统计协会期刊105(491)·Zbl 1390.62052号 ·doi:10.1198/jasa.2010.tm09448
[6] Butler,R.W.(2007)。,鞍点近似及其应用。剑桥大学出版社·Zbl 1183.62001号
[7] Cherubini,U.、E.Luciano和W.Vecchiato(2004)。,金融学中的Copula方法。约翰·威利父子公司·Zbl 1163.62081号
[8] Daniels,H.E.(1954年)。统计学中的鞍点近似。,《数理统计年鉴》25(4),631-650·Zbl 0058.35404号 ·doi:10.1214/aoms/1177728652
[9] Davison,A.C.和D.V.Hinkley(1988年)。重采样方法中的鞍点近似。,生物特征75(3),417-431·Zbl 0651.62018号 ·doi:10.1093/biomet/75.3.417
[10] Dislich,C.、S.Günter、J.Homeier、B.Schröder和A.Huth(2009年)。模拟厄瓜多尔南部热带山地森林的森林动态。,埃尔德昆德63(4),347-364。
[11] Doucet,A.、S.Godsill和C.Andrieu(2000年)。贝叶斯滤波的序贯蒙特卡罗抽样方法,统计与计算10(3),197-208。
[12] Doucet,A.、P.E.Jacob和S.Rubenthaler(2013年)。分数向量和观测信息矩阵的无导数估计及其在状态空间模型中的应用。,arXiv预打印arXiv:1304.5768。
[13] Durbin,J.(1980)。充分估计的密度近似。,生物特征67(2),311-333·Zbl 0436.62020号 ·doi:10.1093/biomet/67.2.311
[14] Easton,G.S.和E.Ronchetti(1986年)。一般鞍点近似及其在\(\textL\)-统计中的应用。,美国统计协会期刊81(394),420-430·2014年6月11日Zbl
[15] Everitt,R.G.、A.M.Johansen、E.Rowing和M.Evdemon-Hogan(2015年)。贝叶斯模型与棘手可能性的比较。,arXiv预打印arXiv:1504.00298·Zbl 1505.62139号 ·doi:10.1007/s11222-016-9629-2
[16] Fasiolo,M.、N.Pya、S.N.Wood等人(2016年)。生态学和流行病学中高度非线性状态空间模型的推理方法比较。,统计科学31(1),96-118·Zbl 1442.62349号
[17] Fasiolo,M.和S.N.Wood(2015)。动态生态模型的近似方法。,arXiv预打印arXiv:1511.02644。
[18] Feuerverger,A.(1989)。关于经验鞍点近似。,生物特征76(3),457-464·Zbl 0674.62019号 ·doi:10.1093/biomet/76.3.457
[19] Fischer,R.、F.Bohn、M.D.de Paula、C.Dislich、J.Groneveld、A.G.Gutiérrez、M.Kazmierczak、N.Knapp、S.Lehmann、S.Paulick等人(2016年)。应用林隙模型了解复杂热带森林的生态系统和碳动态的经验教训。,生态建模。
[20] Fukunaga,K.和L.Hostetler(1975年)。密度函数梯度的估计及其在模式识别中的应用。,IEEE信息理论汇刊21(1),32-40·Zbl 0297.62025号 ·doi:10.1109/TIT.1975.1055330
[21] Gutmann,M.U.和J.Corander(2016年)。基于模拟器的统计模型无似然推理的贝叶斯优化。,机器学习研究杂志17(1),4256-4302·Zbl 1392.62072号
[22] Hartig,F.、J.M.Calabrese、B.Reineking、T.Wiegand和A.Huth(2011年)。随机模拟模型的统计推断——理论与应用。,生态字母14(8),816-827。
[23] Hartig,F.、C.Dislich、T.Wiegand和A.Huth(2014)。技术说明:基于过程的热带森林模型的近似贝叶斯参数化。,生物地球科学11,1261-1272。
[24] Ionides,E.L.、A.Bhadra、Y.Attchadé和A.King(2011年)。迭代过滤,《统计年鉴》39(3),1776-1802·Zbl 1220.62103号 ·doi:10.1214/11-AOS886
[25] Ionides,E.L.、C.Bretó和A.A.King(2006年)。非线性动力系统的推理。,美国国家科学院院刊103(49),18438-18443。
[26] Joe,H.(2006)。基于部分相关生成随机相关矩阵。,《多变量分析杂志》97(10),2177-2189·Zbl 1112.62055号 ·doi:10.1016/j.jmva.2005.05.010
[27] Marjoram,P.、J.Molitor、V.Plagnol和S.Tavaré(2003年)。无可能性的马尔可夫链蒙特卡罗。,《国家科学院学报》100(26),15324-15328。
[28] McCullagh,P.(1987)。,统计学中的张量方法,第161卷。查普曼和霍尔伦敦·Zbl 0732.62003号
[29] Meeds,E.和M.Welling(2014年)。GPS-ABC:高斯过程替代近似贝叶斯计算。,arXiv预打印arXiv:1401.2838。
[30] Monti,A.C.和E.Ronchetti(1993年)。关于多元m-估计的经验似然与经验鞍点逼近的关系。,生物特征80(2),329-338·Zbl 0778.62049号 ·doi:10.1093/biomet/80.2.329
[31] Murray,L.M.、A.Lee和P.E.Jacob(2016年)。粒子过滤器中的并行重采样。,计算与图形统计杂志25(3),789-805·doi:10.1080/10618600.2015.06205
[32] Newey,W.K.(1991)。概率一致收敛与随机等度连续。,《计量经济学:计量经济学社会杂志》,1161-1167·Zbl 0743.60012号 ·doi:10.2307/2938179
[33] Owen,A.B.(2001)。,经验可能性。CRC出版社·Zbl 0989.62019
[34] Prangle,D.等人(2017年)。调整ABC距离功能。,贝叶斯分析12(1),289-309·Zbl 1384.62098号 ·doi:10.1214/16-BA1002
[35] Price、L.F.、C.C.Drovandi、A.Lee和D.J.Nott(2017年)。贝叶斯综合似然。,《计算与图形统计学杂志》,1-11·Zbl 07498962号
[36] Rao,C.R.(2009)。,线性统计推断及其应用,第22卷。约翰·威利父子公司。
[37] Rencher,A.C.和W.F.Christensen(2012)。,多元分析方法,第709卷。约翰·威利父子公司·Zbl 1275.62011号
[38] Roberts,A.W.和D.E.Varberg(1973年)。凸函数·Zbl 0271.26009号
[39] Ronchetti,E.和A.H.Welsh(1994年)。多元M-估计的经验鞍点逼近。,英国皇家统计学会杂志。B系列(方法学)52(2),313-326·Zbl 0796.62018号
[40] Rubio,F.J.,A.M.Johansen等人(2013年)。最大难处理似然估计的简单方法。,电子统计杂志7,1632-1654·Zbl 1327.62075号 ·doi:10.1214/13-EJS819
[41] Silverman,B.W.(1986)。,统计和数据分析密度估计,第26卷。CRC出版社·Zbl 0617.62042号
[42] Spall,J.C.(2005)。,随机搜索和优化简介:估计、模拟和控制,第65卷。约翰·威利父子公司·邮编1088.90002
[43] Toni,T.、D.Welch、N.Strelkowa、A.Ipsen和M.P.Stumpf(2009年)。动力系统参数推断和模型选择的近似贝叶斯计算方案。,《皇家学会界面杂志》6(31),187-202。
[44] Van der Vaart,A.W.(2000)。,渐近统计,第3卷。剑桥大学出版社·Zbl 0910.62001号
[45] Wang,S.(1992)。引导中的一般鞍点近似。,统计与概率字母13(1),61-66。
[46] Wegmann,D.、C.Leuenberger和L.Excoffier(2009年)。高效近似贝叶斯计算与无似然马尔可夫链蒙特卡罗耦合。,遗传学182(4),1207-1218。
[47] 威尔金森,R.(2014)。使用高斯过程加速ABC方法。年,AISTATS,第1015-1023页。
[48] Wood,S.N.(2010年)。噪声非线性生态动力系统的统计推断。,《自然》466(7310),1102-1104。
[49] Yan,J.等人(2007年)。享受copula的乐趣:使用copula包。,统计软件杂志21(4),1-21。
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。