×

线性潜在变量模型:盥洗包。 (英语) Zbl 1306.65070号

摘要:提出了一个用于指定和估计线性潜在变量模型的R包。该实现的原理是将模型规范与实际数据分离,从而形成一种动态且简单的建模复杂层次结构的方法。实现了几个高级功能,包括聚类相关数据的鲁棒标准误差、多组分析、非线性参数约束、不完全数据推理、截尾和二进制观测的最大似然估计以及工具变量估计。此外,还描述了涵盖广泛非线性广义结构方程模型的广泛仿真界面。模型和软件在人脑中血清素转运体的测量数据中进行了演示。

MSC公司:

62-08 统计学相关问题的计算方法
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用

参考文献:

[1] Andersen EB(1971)条件似然比检验的渐近分布。美国统计协会杂志66(335):630-633·Zbl 0226.62017号 ·doi:10.1080/016214591971.10482321
[2] Angrist J(2001)用虚拟内生回归变量估计有限因变量模型:实证实践的简单策略。J公共汽车经济统计19:2-16·doi:10.1198/07350010152472571
[3] Bates D,Maechler M(2009)lme4:使用S4类的线性混合效应模型。http://CRAN.R-project.org/package=lme4,R包版本0.999375-31
[4] Boker S、Neale M、Maes H、Wilde M、Spiegel M、Brick T、Spies J、Estabrook R、Kenny S、Bates T、Mehta P、Fox J(2011)Openmx:一个开源扩展结构方程建模框架。Psychometrica 76:306-317·Zbl 1284.62689号 ·doi:10.1007/s11336-010-9200-6
[5] Bollen K(1996)潜在变量方程的替代两阶段最小二乘(2sls)估计。《心理测量学》61(1):109-121·Zbl 0875.62369号 ·doi:10.1007/BF02296961
[6] Bollen KA(1989)带潜在变量的结构方程。应用概率统计,威利数列概率统计。纽约威利·Zbl 0731.62159号
[7] Bollen KA(2001)两阶段最小二乘和潜在变量模型:同步估计和对错误指定的鲁棒性。在:Cudeck R,Sörbom D,Du Toit SHC(eds)结构方程建模,现在和未来:纪念Karl Jöreskog的节日,国际科学软件公司,林肯伍德·Zbl 0556.62099号
[8] Bollen KA,Kirby JB,Curran PJ,Paxton PM,Chen F(2007)错误指定两阶段最小二乘(2SLS)和最大似然(ML)估计下的潜在变量模型。Soc方法研究36(1):48-86。doi:10.1177/0049124107301947·doi:10.1177/0049124107301947
[9] Budtz-Jörgensen E,Keiting N,Grandjean P,Weihe P,White RF(2003)《产前汞暴露对健康影响评估的统计方法》。环境计量14:105-120·doi:10.1002/env.569
[10] Caffo B,Griswold M(2006)链接-正常模型的用户友好介绍。美国统计局60(2):139-145·doi:10.1198/000313006X110203
[11] Csardi G,Nepusz T(2006)复杂网络研究的igraph软件包,InterJ,complex Syst 1695。网址:http://igraph.sf.net
[12] Ditlevsen S、Christensen U、Lynch J、Damsgaard MT、Keiting N(2005)《中介比例:一种结构方程方法,用于估计中间变量解释的暴露对结果的影响比例》。流行病学16(1):114-120。doi:10.1097/01.ede.0000147107.76079.07·Zbl 0556.62099号
[13] Erritzoe D、Holst KK、Frokjaer VG、Licht CL、Kalbitzer J、Nielsen FA、Svarer C、Madsen J、Knudsen GM(2010)《大脑5-羟色胺转运体与5-HT2A受体结合之间的非线性关系:人体体内分子成像研究》。神经科学杂志30(9):3391-3397。doi:10.1523/JNEUROSCI.252-09.2010年9月。http://www.jneurosci.org/cgi/reprint/30/9/3391.pdf
[14] Fox J(2006)《教师角:使用r.Struct-Equ Model Multidisip J 13(13):465-585中的sem包进行结构方程建模》。doi:10.1207/s15328007sem1303_7·doi:10.1207/s15328007sem1303_7
[15] Fox J(2009)Sem:结构方程模型。http://CRAN.R-project.org/package=sem,R包版本0.9-16·Zbl 0195.48801号
[16] Gansner ER,North SC(1999)开放式图形可视化系统及其在软件工程中的应用。Softw Pract Expert 30:1203-1233·Zbl 1147.68782号 ·doi:10.1002/1097-024X(200009)30:11<1203::AID-SPE338>3.0.CO;2-牛顿
[17] RC、Carey VJ、Bates DM等人(2004)《生物导体:计算生物学和生物信息学的开放软件开发》。基因组生物学5:R80。http://genomebiology.com/2004/5/10/R80
[18] Gentry J、Long L、Gentleman R、Falcon S、Hahne F、Sarkar D(2009)Rgraphviz:为R图形对象提供绘图功能。R包版本1.20.3
[19] Genz A、Bretz F、Miwa T、Mi X、Leisch F、Scheip F、Hothorn T(2009)Mvtnorm:多元正态分布和T分布。http://CRAN.R-project.org/package=mvtnorm,R包版本0.9-4
[20] Gilbert P(2009)NumDeriv:精确的数值导数。http://www.bank-banque-canada.ca/pgilbert,R包版本2006.4-1·Zbl 0478.62088号
[21] Greene WH(2002)《计量经济学分析》,第5版。英格伍德悬崖普伦蒂斯·霍尔
[22] Holm S(1979)一种简单的顺序拒绝多重试验程序。《扫描J统计》6(2):65-70。doi:10.2307/4615733·Zbl 0402.62058号 ·doi:10.2307/4615733
[23] Holst KK(2011)Lava.tobit:具有删失和二元结果的潜在变量模型。http://lava.r-forge.r-project.org,R包版本0.4-3·Zbl 0695.62172号
[24] Holst KK(2012)Gof:基于累积残差的模型不可知论。http://CRAN.R-project.org/package=gof,R包版本0.8-1·Zbl 0478.62088号
[25] Horvitz DG,Thompson DJ(1952),有限宇宙采样的推广,无需替换。美国统计协会杂志47(260):663-685·兹比尔0047.38301 ·网址:10.1080/01621459.1952.10483446
[26] Hotelling H(1953)关于相关系数及其变换的新观点。J R Stat Soc Ser B 15:193-225(讨论,225-232)·Zbl 0052.14905号
[27] Jöreskog K(1970)协方差结构分析的一般方法。生物特征57:239-251·Zbl 0195.48801号
[28] Kalbitzer J、Erritzoe D、Holst KK、Nielsen F、Marner L、Lehel S、Arentzen T、Jernigan TL、Knudsen GM(2010年),短血清素转运体相关多态性区域-等位基因携带者(而非长等位基因纯合子)脑内血清素转运蛋白结合的季节性变化。生物精神病学67:1033-1039。doi:10.1016/j.biopych.2009.11.027·doi:10.1016/j.biopych.2009.11.027
[29] Kenward MG,Molenberghs G(1998),当数据随机缺失时基于概率的频率学家推断。《统计科学》13(3):236-247。doi:10.1214/ss/1028905886·Zbl 1099.62503号 ·doi:10.1214/ss/1028905886
[30] Laird NM,Ware JH(1982)纵向数据的随机效应模型。生物统计学38:963-974·Zbl 0512.62107号 ·doi:10.2307/2529876
[31] Lehmann EL,Romano JP(2005)《检验统计假设》。统计中的斯普林格文本。纽约州施普林格·2018年6月17日
[32] Liang KY,Zeger S(1986)使用广义线性模型的纵向数据分析。生物特征73(1):13-22·Zbl 0595.62110号 ·doi:10.1093/biomet/73.1.13
[33] Little RJA,Rubin DB(2002),缺失数据的统计分析,第2版。概率统计中的威利级数,威利,霍博肯·Zbl 1011.62004号
[34] Magnus JR,Neudecker H(1988)《矩阵微分学在统计学和计量经济学中的应用》。概率和数理统计中的威利级数:应用概率和统计学。奇切斯特·威利·Zbl 0651.15001号
[35] McArdle JJ,McDonald RP(1984),力矩结构网格作用模型的一些代数性质。英国数学统计心理学杂志37(2):234-251·Zbl 0556.62099号 ·doi:10.1111/j.2044-8317.1984.tb00802.x
[36] Muthén LK,Muthén BO(2007)Mplus用户指南(第5版),第5版。洛杉矶穆森&穆森·Zbl 0861.62030号
[37] Paik M(1988)小样本非正态数据的重复测量分析。公共统计模拟计算17:1155-1171·兹伯利0695.62172 ·doi:10.1080/03610918808812718
[38] Pinheiro JC,Bates DM(2000),S和S-PLUS中的混合效应模型。柏林施普林格·Zbl 0953.62065号 ·doi:10.1007/978-1-4419-0318-1
[39] Pinheiro JC,Chao EC(2006)多层广义线性混合模型的高效拉普拉斯和自适应高斯求积算法。J计算图统计15(1):58-81·doi:10.1198/106186006X96962
[40] R开发核心团队(2010)R:统计计算的语言和环境。R统计计算基金会,维也纳。网址:http://www.R-project.org,ISBN 3-900051-07-0
[41] REvolution Computing(2009)Foreach:R的Foreach循环构造。http://CRAN.R-project.org/package=foreach,R包版本1.3.0
[42] Rabe-Hesketh S,Skrondal A,Pickles A(2004)广义多级结构方程建模。《心理测量学》69:167-190。doi:10.1007/BF02295939·Zbl 1306.62484号
[43] Raftery,A。;Bollen,K.(编辑);Long,J.(编辑),结构方程模型中的贝叶斯模型选择,163-180(1993),纽伯里公园
[44] Rotnitzky A,Robins JM(1995),依赖删失下的半参数回归估计。生物统计学82(4):805-820·Zbl 0861.62030号 ·doi:10.1093/biomet/82.4.805
[45] Sanchez BN,Budtz-Jörgensen E,Ryan LM,Hu H(2005)结构方程模型:环境流行病学应用综述。美国统计学会杂志100:1443-1455·Zbl 1117.62420号 ·doi:10.1198/016214500500001005
[46] Sharpsteen C,Bracken C(2010)TikzDevice:用于以PGF/TikZ格式输出R图形的设备。http://R-Forge.R-project.org/projects/tikzdevice,R包版本0.5.2/r34
[47] Steiger JH(2001)倒车时快速行驶。美国统计学会杂志96(453):331-338。doi:10.1198/016214501750332893·doi:10.19198/0162114501750332893
[48] Thomas Lumley的Therneau T,原始R港(2009)生存:生存分析,包括惩罚可能性。http://CRAN.R-project.org/package=生存,R包版本2.35-8
[49] White H(1982)错误指定模型的最大似然估计。计量经济学50(1):1-26·Zbl 0478.62088号 ·doi:10.2307/1912526
[50] Williams RL(2000)关于聚类相关数据稳健方差估计的注释。生物统计学56(2):645-646。doi:10.1111/j.0006-341X.2000.00645.x·Zbl 1060.62566号 ·doi:10.1111/j.0006-341X.2000.00645.x
[51] Yan J,Fine J(2004),关联结构的估算方程。《统计医学》23:859-874。doi:10.1002/sim.1650·doi:10.1002/sim.1650
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。