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Döcker，詹诺什;西蒙·林茨;查尔斯·森普尔

根系统发育网络的超立方体和哈密尔顿循环显示集。 （英语） Zbl 1526.92038号

高级申请。数学。 152，文章ID 102595，31 p.（2024）.
摘要：在从一组系统发育树重建系统发育网络的背景下，已经建立了一些特征和随后的算法来重建一个系统发育网络，该网络以某种最小的方式将所有树集中嵌入到输入中。然而，在许多情况下，生成的网络还嵌入了不属于输入的其他系统发育树。然而，对这些推断树知之甚少。在本文中，我们探讨了嵌入到给定系统发育网络中的所有系统发育树之间的关系。为此，我们将一个特殊的图（G）（我们称之为rSPR图）与\（mathcal{P}\）中的元素相关联，并证明，如果\（|mathcal}|=2^k\），其中\（k）是在\（mathcal{N}\）中点的个数，那么\（G）有一个Hamilton圈。其次，通过利用rSPR图和超立方体的性质，我们转向一类研究得很好的有根二元一级网络，并给出了一组有根二元系统发育树何时可以嵌入一级网络而不推断任何额外的树的充要条件。最后，我们展示了如何将这些条件转换为多项式时间算法来重建存在的网络。

MSC公司：

92D15型 与进化有关的问题
05C90年 图论的应用
05C85号 图形算法（图形理论方面）

关键词：

显示器;格雷码;超立方体;汉密尔顿循环;系统发育网络;子树修剪与再生

软件：

MSC四重奏;树突镜
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{J.Döcker}等人，高级应用程序。数学。152，文章ID 102595，31 p.（2024；Zbl 1526.92038）
全文： 内政部 arXiv公司

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