×

通过层次似然推断HIV动力学模型。 (英语) Zbl 1247.92030号

概要:HIV动力学模型通常基于非线性常微分方程组(ODE),该系统没有解析解。在此类模型中引入随机效应会导致非常具有挑战性的非线性混合效应模型。为了避免对似然中涉及的多重积分进行数值计算,提出了一种基于惩罚似然的层次似然方法。给出了固定效应下最大h似然估计量(MHLE)的渐近分布。MHLE略有偏差,但通过使用参数自举程序可以使偏差可忽略不计。提出了一种有效的h似然最大化算法。一项基于经典HIV动力学模型的模拟研究证实了MHLE的良好特性。该方法用于临床试验的分析。

MSC公司:

92天30分 流行病学
34F05型 常微分方程和随机系统
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
62F40型 引导、折刀和其他重采样方法

软件:

引导数据库
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用

参考文献:

[1] Andersen,P.K。;博根,Ø。;吉尔·R·D。;Keiting,N.,《基于计数过程的统计模型》(1993),Springer-Verlag:Springer-Verlag New-York·Zbl 0769.62061号
[2] Beal,S.L。;Sheiner,L.B.,估算种群动力学,生物医学工程评论,8195-222(1982)
[3] Commandes,D.,《统计模型、传统、惩罚和等级可能性》,《统计调查》,第3期,第1-17页(2009年)·Zbl 1190.62072号
[4] Davidian,M。;Giltinan,D.M.,重复测量数据的非线性模型(1995),Chapman&Hall
[5] 唐纳,S。;Samson,A.,《动力系统定义的不完全数据模型中的参数估计》,《统计规划与推断杂志》,1372815-2831(2007)·Zbl 1331.62099号
[6] 埃夫隆,B。;Tibshirani,R.J.,《Bootstrap简介》(1993),查普曼和霍尔出版社·Zbl 0835.62038号
[7] Guedj,J。;Thiébaut,R。;Commumes,D.,HIV动力学模型的实际可识别性,《数学生物学公报》,69,2493-2513(2007)·Zbl 1245.92055号
[8] Guedj,J。;Thiébaut,R。;Commumes,D.,HIV动力学模型中的最大似然估计,生物统计学,63,1198-1206(2007)·Zbl 1136.62074号
[9] 何博士。;Neumann,A.U。;Perelson,美国。;Chen,W。;Leonard,J.M。;Markowitz,M.,HIV-1感染中血浆病毒和CD4淋巴细胞的快速转换,《自然》,373123-126(1995)
[10] Huang,X.,结合药物依从性和治疗耐药性预测病毒学反应的长期HIV动态模型,计算统计与数据分析,52,3765-3778(2008)·Zbl 1452.62812号
[11] 黄,X。;刘,D。;Wu,H.,纵向HIV动态系统参数估计的层次贝叶斯方法,生物统计学,62413-423(2006)·Zbl 1097.62128号
[12] 库恩,E。;Lavielle,M.,非线性混合效应模型中的最大似然估计,计算统计与数据分析,491020-1038(2005)·Zbl 1429.62279号
[13] Lee,Y。;Nelder,J.A.,层次广义线性模型,J.Roy。统计师。Soc.B,58,619-678(1996)·Zbl 0880.62076号
[14] Lee,Y。;Nelder,J.A.,《分层广义线性模型:广义线性模型、随机效应模型和结构化分散的综合》,《生物统计学》,88,987-1006(2001)·Zbl 0995.62066号
[15] Lee,Y。;Nelder,J.A。;Pawitan,Y.,《具有随机效应的广义线性模型》(2006),Chapman和Hall·Zbl 1110.62092号
[16] Lindstrom,M。;Bates,D.,重复测量数据的非线性混合效应模型,生物统计学,46673-687(1990)
[17] Marquardt,D.,非线性参数最小二乘估计算法,SIAM应用数学杂志,11,431-441(1963)·Zbl 0112.10505号
[18] McCullagh,P。;Nelder,J.A.,《广义线性模型》(1989),查普曼和霍尔出版社:纽约查普曼和霍尔出版社·Zbl 0744.62098号
[19] McGilchrist,C.A。;Aisbett,C.W.,《生存分析中脆弱性的回归》,生物统计学,47461-466(1991)
[20] 苗,H。;戴克斯,C。;德米特,L.M。;卡夫纳,J。;帕克,S.Y。;Perelson,A。;Wu,H.,基于流式细胞仪生长竞争实验的HIV-1动力学参数和复制适合度的建模与估计,《数学生物学公报》,701749-1771(2008)·Zbl 1166.92029号
[21] 苗,H。;戴克斯,C。;德米特,L.M。;Wu,H.,HIV病毒适应度实验的微分方程建模:模型识别、模型选择和多模态推断,生物统计学,65,292-300(2009)·Zbl 1159.62079号
[22] Molina,J.M。;Cháne,G。;费尔查尔,F。;Journot,V。;佩莱格林,I。;桑巴迪耶,M.N。;兰辛,C。;科特,L。;马德琳,I。;德博德,T。;Decazes,J.M.,《ALBI试验:一项比较司他夫定+地达诺新与齐多夫定+拉米夫定的随机对照试验以及交替使用这两种联合方案治疗之前未经治疗的感染人类免疫缺陷病毒的患者》,《传染病杂志》,180,351-358(1999)
[23] Noh,M。;Lee,Y.,非线性混合效应模型的层次似然法,计算统计与数据分析,52,3517-3527(2008)·Zbl 1452.62544号
[24] Nowak,医学硕士。;Bangham,C.R.M.,《持续性病毒的种群动力学和免疫反应》,《科学》,27274-79(1996)
[25] Nowak,医学硕士。;May,R.M.,《病毒动力学:免疫学和病毒学的数学原理》(2000),牛津大学出版社·Zbl 1101.92028号
[26] Perelson,A.S。;Neumann,A.U。;马科维茨,M。;Leonard,J.M。;Ho,D.D.,HIV-1体内动力学:病毒清除率、感染细胞寿命和病毒生成时间,《科学》,271,5255,1582-1586(1996)
[27] O'Sullivan,F.,全自动对数密度和对数hazard估计量的快速计算,SIAM科学与统计计算杂志,9,363-379(1988)·Zbl 0688.65083号
[28] H·推杆。;海斯特坎普,S.H。;兰格,J.M。;de Wolf,F.,艾滋病毒动力学模型参数估计的贝叶斯方法,《医学统计学》,21,2199-2214(2002)
[29] 拉姆齐,J.O。;胡克,G。;坎贝尔,D。;曹,J.,微分方程的参数估计:广义平滑方法,《皇家统计学会杂志:B辑》,69,741-796(2007)·Zbl 07555374号
[30] Ramratnam,B。;里贝罗,R。;He,T。;钟,C。;西蒙,V。;范德霍芬,J。;A.赫尔利。;张,L。;Parelson,A.S。;Ho,D.D。;Markowitz,M.,《加强抗逆转录病毒治疗会加速HIV-1潜伏库的衰退,减少但不会消除正在进行的病毒复制》,《获得性免疫缺陷综合征杂志》,35,33-37(1999)
[31] 里贝罗,R.M。;莫赫里,H。;Ho,D.D。;Perelson,A.S.,HIV-1感染中T细胞活化、增殖和死亡的体内动力学:为什么CD4而不是CD8 T细胞被耗尽?,《国家科学院学报》,99,15572-15577(2002)
[32] 罗德里格斯-费尔南德斯,M。;门德斯,P。;Banga,J.R.,《生化途径参数稳健估计的混合方法》,《生物系统》,83,248-265(2006)
[33] J.M.G.泰勒。;坎伯兰,W.G。;Sy,J.P.,用于分析纵向艾滋病数据的随机模型,《美国统计协会杂志》,89727-736(1994)·Zbl 0806.92011号
[34] 泰勒,J.M.G;Tan,S-J;Detels,R。;Giorgi,J.V.,艾滋病患者CD4 T细胞数量自然史计算机模拟模型的应用,5,159-167(1991)
[35] 塞尔诺,T.M。;Grambsch,P.M.,《生存数据建模:扩展考克斯模型》(2000),施普林格出版社·Zbl 0958.62094号
[36] van der Vaart,A.,1998年。渐近统计,剑桥。;van der Vaart,A.,1998年。渐进统计,剑桥·Zbl 0910.62001号
[37] Wu,H.,艾滋病临床试验中HIV动态研究的统计方法,《医学研究中的统计方法》,第14期,第171-192页(2005年)·Zbl 1122.62378号
[38] 吴,H。;丁,A.,《体内HIV-1人群动态:艾滋病临床试验病毒学数据的适用模型和推断工具》,生物计量学,55,410-418(1999)·Zbl 1059.62735号
[39] Wu,H。;丁,A.A。;DeGruttola,V.,《HIV动态参数估计》,《医学统计》,第17期,第2463-2485页(1998年)
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。