拉泽什·赛努丁;凯文·桑顿;詹妮弗·哈洛;布斯，詹姆斯;迈克尔·斯蒂尔曼;鲁里科·吉田;罗伯特·格里菲斯;吉尔·麦克韦;彼得·唐纳利 现场频谱实验。 （英语） Zbl 1220.62141号 牛市。数学。生物。 73，第4期，829-872（2011）. 摘要：从现有脱氧核糖核酸（DNA）序列评估高结构群体遗传模型参数的似然函数在计算上是禁止的。在这种情况下，可以从数据的汇总统计数据（如站点频率谱（SFS）或其线性组合）中近似推断参数。这种方法被称为近似似然或贝叶斯计算。使用受控集总马尔可夫链和计算交换代数方法，我们计算了在无限多人突变模型下中性进化的非重组轨迹上SFS及其许多经典线性组合的精确似然。利用SFS周围的部分序合并实验图，我们为近似充分性提供了一个决策理论框架。我们还将一系列基于SFS的非重组位点标准中性的经典假设检验扩展到一个更强大的版本，该版本以SFS提供的拓扑信息为条件。 引用于4文件 MSC公司： 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析 92D10型 遗传学和表观遗传学 60J22型 马尔可夫链中的计算方法 92C40型 生物化学、分子生物学 65C60个 统计中的计算问题（MSC2010） 92D15型 与进化有关的问题 关键词：可控集总聚结;群体遗传马尔可夫基 软件：fastDNAml（快速DNAml）;4第2页;麦考利2 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit｛R.Sainudin｝等人，公牛。数学。生物学73，第4期，829--872（2011；Zbl 1220.62141） 全文： 内政部 参考文献： [1] Bahlo，M.和；Griffiths，R.（1996）。根据细分群体中的基因树进行推断。西奥。大众。生物学57，79–95·Zbl 0984.9202号 ·doi:10.1006/tpbi.1999.1447 [2] Barvinok，A.（1994）。维数固定时计算多面体积分点的多项式时间算法。数学。操作。第19、769–779号决议·Zbl 0821.90085号 ·doi:10.1287/门19.4.769 [3] Beaumont，M.、Zhang，W.和；Balding，D.（2002年）。群体遗传学中的近似贝叶斯计算。遗传学1622025-2035。 [4] 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