康惠元;拉德克·埃尔班 将马尔可夫链模型与随机偏微分方程相结合的多尺度随机反应扩散算法。 （英语） Zbl 1422.92055号 牛市。数学。生物。 81，第8号，3185-3213（2019）. 摘要：分析了反应扩散过程随机模拟的两种多尺度算法。它们适用于包含分子浓度显著不同区域的系统。在这两种方法中，感兴趣的区域被划分为两个子集，分别使用连续时间马尔可夫链模型和随机偏微分方程（SPDE）。在第一种算法中，马尔可夫链（基于区间）模型通过考虑界面附近计算域的SPDE部分中的伪区间（也称为重叠或握手区域）与反应扩散SPDE耦合。在第二种算法中，没有使用重叠区域。给出了这两种方案的进一步扩展，包括不同建模方法之间自适应选择边界的情况。 引用于1文件 MSC公司： 92立方厘米 系统生物学、网络 92C45型 生化问题中的动力学（药代动力学、酶动力学等） 60J28型 连续时间Markov过程在离散状态空间中的应用 35卢比60 随机偏微分方程 65立方厘米 马尔可夫链的数值分析或方法 2008年9月 生物问题的计算方法 关键词：随机反应扩散系统;化学反应网络;马尔可夫链;Gillespie算法;多尺度模拟;随机偏微分方程 软件：斯莫尔丁;步骤;MesoRD公司;STOCHSIMGPU公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{H.-W.Kang}和\textit{R.Erban}，公牛。数学。生物学81，No.8，3185--3213（2019；Zbl 1422.92055） 全文： 内政部 参考文献： [1] Alexander F，Garcia A，Tartakovsky D（2002）随机偏微分方程的算法改进：I.线性扩散。计算物理杂志182（1）：47-66·邮编1090.65510 [2] Alexander F，Garcia A，Tartakovsky D（2005）随机偏微分方程的算法改进：II。相关系统。计算机物理杂志207（2）：769-787·Zbl 1072.65006号 [3] Altintan D，Ganguly A，Koeppl H（2016）《多尺度反应网络的高效模拟：多级划分方法》。美国控制会议2016:6073-6078 [4] Ander M、Beltrao P、Di Ventura B、Ferkinghoff 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