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一种用于对流-扩散-反应问题的混合平滑耗散粒子动力学(SDPD)空间随机模拟算法(sSSA)。 (英语) Zbl 1416.76244号

总结:我们开发了一种新的算法,将离散随机模拟与基于粒子的流体动力学仿真框架平滑耗散粒子动力学(SDPD)相结合,使用空间随机模拟算法(sSSA)。该混合算法能够在无网格动态域上用拉格朗日参考系对空间分辨的化学反应系统进行离散随机模拟。SDPD结合了两种流行的介观技术:平滑粒子流体力学和耗散粒子动力学(DPD),将这两种方法的宏观和介观流体动力学效果联系起来。我们使用反应扩散主方程(RDME)形式实现了离散随机模拟,并基于SDPD方法实现了确定性反应扩散方程。我们通过将我们的结果与四个典型模型进行比较来验证新方法,并通过在微流体室中模拟含有化学梯度的流经酵母细胞的流动来证明我们方法的通用性。

MSC公司:

76米28 粒子法和晶格气体法
76兰特 扩散
92立方37 细胞生物学
65亿75 涉及偏微分方程的初值和初边值问题的概率方法、粒子方法等

软件:

斯托奇SS
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全文: 内政部

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