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布尔钦·西姆塞克;萨蒂什·艾扬格

mRNA转录的过度分散计数模型。 （英语） 兹比尔1470.62164

水龙头。数学杂志。统计。 47，第5期，1335-1347（2018）.
摘要：直接检测基因活性通常是不可能的，因为单个激活事件中的新蛋白质被之前事件中残留的蛋白质掩盖。因此，研究人员通过观察信使RNA（mRNA）的产生来确定基因的激活或失活。通常情况下，当基因处于开启状态时，mRNA转录会在短时间内快速爆发，而在其关闭状态时没有转录。mRNA生成的这种突发性并不是泊松过程的良好模型。我们提出Conway-Maxwell Poisson（COM-Poisson）分布作为更常见的负二项（NB）分布的潜在替代。我们使用这些模型的广义线性模型版本来合并协变量信息。我们还考虑零通货膨胀来模拟超额零计数。我们使用大肠杆菌和哺乳动物细胞的数据来说明我们提出的方法。我们发现，当存在生物物理衍生分布时，该分布表现良好。我们还表明，在缺乏这种生物物理知识的情况下，COM-Poisson与NB竞争。COM-Poisson和NB都出现在排队论中，这表明进一步应用该框架来研究mRNA动力学将是有用的。

MSC公司：

62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析
62J12型 广义线性模型（逻辑模型）
92D20型 蛋白质序列，DNA序列

关键词：

Conway-Maxwell-Poisson公司;链接函数;模型比较;负二项式;广义线性模型
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{B.Simsek}和\textit{S.Iyengar}，哈塞特。数学杂志。Stat.47，No.5，1335--1347（2018；Zbl 1470.62164）
全文： 链接

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