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寻找进化吸引盆地之间的边界,以及赖特健身景观类比的含义。 (英语) Zbl 1456.92102号

小结:1932年,赖特提出了健身景观的概念。通过与自然景观相类比,自然景观的梯度可以预测滚动大理石的空间轨迹,健身景观的轮廓意在预测进化人群的遗传轨迹。赖特的主要兴趣在于突变相互作用可能会阻碍自然选择,从而在健身领域产生多重最大值。在这里,我们研究了由等位基因频率和等位基因之间的连锁不平衡所定义的状态空间上的动力学系统。对于最简单的双焦点情形,我们首先分析了在选择和重组影响下进化的无限大种群中吸引盆之间的鞍点。我们进一步从数值上表明,盆地之间的边界与连锁不平衡近似线性,但与等位基因频率无关。我们还利用这一框架,对单峰健身景观的两个古老结果提出了新的观点。最后,我们寻找了一个势函数,它的轮廓可以通过这个状态空间预测进化轨迹。重要的是,并非每个动力系统都可以用势函数来描述,而目前的问题就是这样一种情况。因此,用赖特的比喻来说,在定位健身谷的地面时,我们失去了景观,这个结论不仅限于我们选择的参数化,也不存在问题。这个结果促使我们仔细审查这个广泛使用的类比的形式含义和要求。

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第92天 与进化有关的问题
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参考文献:

[1] Wright S 1932突变、近亲繁殖、杂交和选择在进化中的作用程序。第六届国际会议。遗传学ed D F Jones(威斯康星州梅纳沙:布鲁克林植物园)第356-66页
[2] Weinreich D M、Watson R A和Chao L 2005进化轨迹的符号上位性和遗传约束进化59 1165
[3] Provine W B 1986年Sewall Wright与进化生物学(伊利诺伊州芝加哥:芝加哥大学出版社)第545页
[4] 考夫曼SA 1993秩序的起源(纽约:牛津大学出版社)第709页
[5] 梅纳德·史密斯J 1970自然选择和蛋白质空间的概念自然225 563 ·数字对象标识代码:10.1038/225563a0
[6] 费希尔R A 1930自然选择的遗传理论第2版(牛津,GB:Clarendon)第272页
[7] 伦泽M2005年古代适应性景观的生物化学结构科学类310 499 ·Zbl 1226.92022号 ·doi:10.1126/科学.1115649
[8] Gillespie J H 1984突变景观中的分子进化进化38 1116 ·doi:10.2307/2408444
[9] Eigen M、McCaskill J和Schuster P 1988分子准谱《物理学杂志》。化学。92 6881 ·doi:10.1021/j100335a010
[10] Wright S 1988重新审视有选择价值的表面美国国家。131 115 ·数字对象标识代码:10.1086/284777
[11] Lewontin R C和White M D J 1960蝗虫两对染色体反转多态性的相互作用进化14 116 ·doi:10.307/2405927
[12] Brodie E D III 2000为什么进化遗传学不总是相加表观与进化过程ed J B Wolf、E D Brodie III和M J Wade(纽约:牛津大学出版社),第3-20页
[13] Neher R A和Shraiman B I 2011数量性状的统计遗传学和进化修订版Mod。物理学。83 1283 ·doi:10.1103/RevModPhys.83.1283
[14] Weinreich D M和Chao L 2005大规模种群从当地适应度峰值中快速进化逃逸,这在本质上是可能的进化59 1175 ·doi:10.1111/j.0014-382.2005.tb01769.x
[15] Iwasa Y、Michor F和Nowak M A 2004进化动力学中的随机隧道遗传学166 1571 ·doi:10.1534/genetics.166.3.1571
[16] Altland A公司2011年群体遗传学中的罕见事件:具有重组的双焦点模型中的随机隧穿物理学。修订稿。106 088101 ·doi:10.1103/PhysRevLett.106.088101
[17] Lynch M 2010确定复杂适应时间的预期程序。美国国家科学院。科学。107 16577 ·doi:10.1073/pnas.1010836107
[18] Weissman D B、Feldman M W和Fisher D S,2010年,有性行为人群中的适宜性与适宜性交叉率遗传学186 1389 ·doi:10.1534/genetics.110.123240
[19] Barton N和Turelli M 1991多基因座的自然选择和性别选择遗传学127 229
[20] Kirkpatrick M、Johnson T和Barton N 2002多点演化的一般模型遗传学161 1727
[21] 巴顿N H 1995连锁和自然选择的限制遗传学140 821
[22] Barton N和Otto S P 2005随机漂移引起的重组进化遗传学169 2353 ·doi:10.1534/genetics.104.032821
[23] Otto S P 2003种族隔离的优势和性别的演变遗传学164 1099
[24] Lenormand T 2003重组中性别二型性的进化遗传学163 811
[25] Crow J F和Kimura M 1965性种群和无性种群的进化美国国家。99 439·doi:10.1086/282389
[26] Eshel I和Feldman M W 1970关于重组的进化效应西奥。大众。生物。1 88个·Zbl 0242.92004号 ·doi:10.1016/0040-5809(70)90043-2
[27] Rutschman D H 1994双焦点单倍体模型的动力学西奥。大众。生物。45 167 ·Zbl 0799.92009号 ·doi:10.1006/tpbi.1994.1009
[28] Lewontin R C 1988关于配子不平衡的度量遗传学120 849
[29] Hartl D L和Clark A G,2007年群体遗传学原理第四版(马萨诸塞州桑德兰:西努埃尔)第565页
[30] Peters A D和Lively C M 2000高潮与性的维持表观与进化过程ed J B Wolf、E D Brodie III和M J Wade(纽约:牛津大学出版社),第99-112页
[31] Martelli M 1999年离散动力系统与混沌导论(纽约州纽约市:威利)第328页·Zbl 1127.37300号 ·doi:10.1002/9781118032879
[32] Otto S P和Day T 2007生物学家生态学和进化数学建模指南(纽约普林斯顿:普林斯顿大学出版社)第732页·Zbl 1152.92027
[33] Park S-C和Krug J 2011具有选择、突变和重组的双焦点模型中的双稳态数学杂志。生物。62 763 ·Zbl 1232.92060号 ·doi:10.1007/s00285-010-0352-x
[34] Nei M 1967通过自然选择修改连锁强度遗传学57 625
[35] Higgs P G 1998补偿性中性突变与RNA进化Genetica(遗传学)102/103 91 ·doi:10.1023/A:1017059530664
[36] Feldman M W 1971双位点单倍体重组群体的平衡研究西奥。大众。生物。2 299·Zbl 0245.92014号 ·doi:10.1016/0040-5809(71)90022-0
[37] Muller H J 1932性的一些遗传方面美国国家。66 118 ·doi:10.1086/280418
[38] Kim Y和Orr H A 2005性与无性的适应:克隆干扰和Fisher-Muller模型遗传学171 1377 ·doi:10.1534/genetics.105.045252
[39] Desai M M和Fisher D S 2007有益突变选择平衡和连锁对正选择的影响遗传学176 1759 ·doi:10.1534/genetics.106.067678
[40] 沃森R A 2005成分进化:性别、共生和模块化对进化渐进框架的影响(马萨诸塞州剑桥:麻省理工学院出版社)第324页
[41] Neher R A、Shraiman B I和Fisher D S 2010大型性人群的适应率遗传学184 467 ·doi:10.1534/genetics.109.109009
[42] Jain K 2010重组时的固定时间西奥。大众。生物。77 23 ·Zbl 1403.92178号 ·doi:10.1016/j.tpb.2009.10.005
[43] 盖林格H 1944论孟德尔遗传中连锁的概率理论安。数学。斯达。15 25 ·Zbl 0063.01560号 ·doi:10.1214/aoms/1177731313
[44] Robinson W P、Asmussen M A和Thomson G 1991三焦点系统对两两不平衡施加了额外的约束遗传学129 925
[45] Mitchell M、Holland J H和Forrest S 1994,什么时候遗传算法会比爬山更好?神经信息处理系统研究进展ed J D Cowan、G Tesauro和J Alscort(加州圣马特奥:Morgan Kaufmann),第51-58页
[46] Orr H A 2003自适应步行平均步数的最小值J.理论。生物。220 241 ·Zbl 1464.92202号 ·doi:10.1006/jtbi.2003.3161
[47] Loomis L 1977年微积分(马萨诸塞州雷丁:Addison Wesley)第899页
[48] Pigluicci M和Kaplan J,2006年理解进化(伊利诺伊州芝加哥:芝加哥大学出版社)p 300·doi:10.7208/chicago/9780226668352.0001
[49] Gavrilets S 2004健身景观和物种起源人口生物学专著ed S A Levin和H S Horn(新泽西州普林斯顿:普林斯顿大学出版社)第476页
[50] 卡普兰J 2008适应性景观隐喻的终结?生物.菲尔。23 625 ·doi:10.1007/s10539-008-9116-z
[51] Pigluicci M 2008 Sewall Wright的适应性景观:1932年与1988年生物.菲尔。23 591 ·doi:10.1007/s10539-008-9124-z
[52] Hastings A 1981离散时间遗传模型中的稳定循环程序。美国国家科学院。科学。78 7224 ·Zbl 0466.92010号 ·doi:10.1073/pnas.78.11.7224
[53] Akin E 1982简单遗传系统中的循环数学杂志。生物。13 305 ·Zbl 0484.92009号 ·doi:10.1007/BF00276066
[54] Thompson C J和McBride J L 1974论Eigen的物质自组织理论和生物大分子进化数学。Biosci公司。21 127 ·Zbl 0287.92005号 ·doi:10.1016/0025-5564(74)90110-2
[55] Berg J、Willmann S和Lässig M 2004转录因子结合位点的适应性进化BMC演变。生物。4 42 ·doi:10.1186/1471-2148-4-42
[56] Sella G和Hirsh A E 2005统计物理学在进化生物学中的应用程序。美国国家科学院。科学。102 9541 ·doi:10.1073/pnas.0501865102
[57] Zhu Y和Ao P 2006极限环和守恒动力学国际期刊修订版。物理学。乙20 817·Zbl 1130.82329号 ·doi:10.1142/S0217979206033607
[58] Ao P 2008从达尔文动力学中出现随机动力学方程和稳态热力学Commun公司。西奥。物理学。49 1073·Zbl 1392.37093号 ·doi:10.1088/0253-6102/49/5/01
[59] Ao P 2008达尔文进化论定律物理学。生命修订版。2 117 ·doi:10.1016/j.plrev.2005.03.002
[60] McCandlish D M 2011可视化健身景观进化65 1544 ·文件编号:10.1111/j.1558-5646.2011.01236.x
[61] Jansen T和Wegener I 2001 Real Royal Road功能-交叉证明至关重要GECCO-2001:程序。遗传与进化计算。ed L E Spector和E D Goodman(加利福尼亚州旧金山:Morgan Kaufmann)第1034-41页
[62] Watson R A、Weinreich D M和Wakeley J 2006基因内上位性对性重组益处的影响生物化学。社会事务处理。34 560 ·doi:10.1042/BST0340560
[63] Watson R A、Weinreich D M和Wakeley J 2010基因组结构和性的益处进化65 523 ·文件编号:10.1111/j.1558-5646.2010.01144.x
[64] Kondrashov A,S 1982大型有性和无性生殖人群有害突变的选择遗传学。物件。40 325 ·doi:10.1017/S0016672300019194
[65] Otto S P和Lenormand T 2002解决性别与重组的矛盾《自然·遗传学评论》。3 252 ·doi:10.1038/nrg761
[66] Lewontin R C 1974年进化变化的遗传基础(纽约州纽约市:哥伦比亚大学出版社)
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