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Konstantinos N.Blazakis。；阿诺蒂达·麦兹沃伊；雷耶斯·阿尔达索罗、康斯坦丁诺·卡洛斯；风格，凡妮莎；文卡塔拉曼，钱德拉塞卡

通过几何进化规律的最优控制实现全细胞跟踪。 （英语） Zbl 1349.92006号

J.计算。物理学。 297, 495-514 (2015).
摘要：细胞跟踪算法自动化和系统化细胞随时间推移的图像数据集分析，是细胞现象建模和理解中不可或缺的工具。在本研究中，我们提出了一个全细胞跟踪的理论框架和算法。在这项工作中，我们认为“跟踪”相当于从静态图像数据集动态重建整个细胞数据（形态）。我们工作的新颖之处在于，跟踪算法是由细胞运动模型驱动的。该模型可被视为对最近开发的具有物理意义的细胞运动模型的简化。由此产生的问题是几何演化规律的最优控制，我们讨论了最优控制问题的形式化和数值逼近。这项工作的总体目标是设计一个用于细胞跟踪的框架，在该框架中，恢复的数据反映了正向模型的物理特性。给出了一些数值模拟，说明了我们方法的适用性。

引用于6文件

MSC公司：

92-08 生物学问题的计算方法
92立方厘米 细胞运动（趋化性等）
49平方米25 最优控制中的离散逼近
49N90型 最优控制和微分对策的应用

关键词：

单元格跟踪；几何演化定律；最优控制；相位场；有限元

软件：

PhagoSight公司；趋化作用
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{K.N.Blazakis}等人，J.Compute。物理学。297495-514（2015；Zbl 1349.92006）
全文： 内政部 arXiv公司

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